More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0983 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0983  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 
451 aa  899    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0995172  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2567  phosphoglucosamine mutase  65.09 
 
 
451 aa  580  1e-164  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.474953  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1847  phosphoglucosamine mutase  64.19 
 
 
447 aa  556  1e-157  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.310353  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3610  phosphoglucosamine mutase  62.84 
 
 
445 aa  556  1e-157  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00189073  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0716  phosphoglucosamine mutase  62.42 
 
 
446 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.149315 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1573  phosphoglucosamine mutase  61.63 
 
 
447 aa  553  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126154  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4716  phosphoglucosamine mutase  62.19 
 
 
446 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4582  phosphoglucosamine mutase  61.97 
 
 
446 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.922342  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2709  phosphoglucosamine mutase  61.57 
 
 
455 aa  545  1e-154  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0705  phosphoglucosamine mutase  63.51 
 
 
446 aa  548  1e-154  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0611837  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2840  phosphoglucosamine mutase  61.35 
 
 
455 aa  543  1e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3079  phosphoglucosamine mutase  63.98 
 
 
453 aa  544  1e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.7667  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1967  phosphoglucosamine mutase  61.71 
 
 
446 aa  541  1e-153  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000194402  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1333  phosphoglucosamine mutase  60.58 
 
 
450 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.951592  hitchhiker  0.00110502 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1398  phosphoglucosamine mutase  60.36 
 
 
450 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.033665 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1973  phosphoglucosamine mutase  61.94 
 
 
451 aa  538  9.999999999999999e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0100286 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3350  phosphoglucosamine mutase  61.4 
 
 
445 aa  535  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0843387  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3469  phosphoglucosamine mutase  61.85 
 
 
445 aa  535  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0956  phosphoglucosamine mutase  60.72 
 
 
445 aa  535  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0280063  normal  0.292928 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03041  phosphoglucosamine mutase  62.02 
 
 
445 aa  532  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0250482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0531  phosphoglucosamine mutase  62.02 
 
 
445 aa  532  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0782231  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3553  phosphoglucosamine mutase  62.7 
 
 
445 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3483  phosphoglucosamine mutase  62.7 
 
 
445 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3368  phosphoglucosamine mutase  62.02 
 
 
445 aa  532  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000272746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3661  phosphoglucosamine mutase  62.02 
 
 
445 aa  532  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000185546  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4185  phosphoglucosamine mutase  59.78 
 
 
447 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02992  hypothetical protein  62.02 
 
 
445 aa  532  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0265797  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3589  phosphoglucosamine mutase  62.7 
 
 
445 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3472  phosphoglucosamine mutase  62.02 
 
 
445 aa  532  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000247168  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0785  phosphoglucosamine mutase  60.79 
 
 
453 aa  532  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3651  phosphoglucosamine mutase  62.7 
 
 
445 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0524  phosphoglucosamine mutase  62.02 
 
 
445 aa  532  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0662864  hitchhiker  0.00167255 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4498  phosphoglucosamine mutase  62.02 
 
 
445 aa  531  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140787  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3594  phosphoglucosamine mutase  62.02 
 
 
445 aa  532  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000289716  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3483  phosphoglucosamine mutase  62.7 
 
 
445 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0848624  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1022  phosphoglucosamine mutase  60.81 
 
 
448 aa  528  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00540573  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4495  phosphoglucosamine mutase  58.88 
 
 
447 aa  529  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.235157  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0774  phosphoglucosamine mutase  59.96 
 
 
445 aa  530  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000226413  normal  0.0239811 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3018  phosphoglucosamine mutase  59.11 
 
 
450 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0396425 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4717  phosphoglucosamine mutase  61.97 
 
 
446 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62840  phosphoglucosamine mutase  60.49 
 
 
445 aa  528  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5469  phosphoglucosamine mutase  59.51 
 
 
445 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1438  phosphoglucosamine mutase  58.39 
 
 
446 aa  525  1e-148  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.628979  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1504  phosphoglucosamine mutase  58.39 
 
 
446 aa  526  1e-148  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0568  phosphoglucosamine mutase  61.04 
 
 
445 aa  527  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.468081  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2888  phosphoglucosamine mutase  59.11 
 
 
450 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3065  phosphoglucosamine mutase  60.63 
 
 
445 aa  526  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0803  phosphoglucosamine mutase  61.12 
 
 
445 aa  526  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0442046  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2832  phosphoglucosamine mutase  59.96 
 
 
443 aa  526  1e-148  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0011182  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42860  phosphoglucosamine mutase  61.3 
 
 
445 aa  527  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3449  phosphoglucosamine mutase  59.1 
 
 
445 aa  523  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0814  phosphoglucosamine mutase  58.11 
 
 
444 aa  523  1e-147  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000566204  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002605  phosphoglucosamine mutase  61.17 
 
 
446 aa  521  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000248269  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1487  phosphoglucosamine mutase  58.89 
 
 
450 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.152305  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3394  phosphoglucosamine mutase  58.84 
 
 
443 aa  519  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000763461  hitchhiker  0.000140936 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01688  phosphoglucosamine mutase  59.28 
 
 
447 aa  520  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000297141  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0168  phosphoglucosamine mutase  61.31 
 
 
446 aa  517  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000649392  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3987  phosphoglucosamine mutase  60.67 
 
 
446 aa  516  1.0000000000000001e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304021  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0730  phosphoglucosamine mutase  59.91 
 
 
444 aa  516  1.0000000000000001e-145  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3600  phosphoglucosamine mutase  60.67 
 
 
446 aa  516  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434443  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3734  phosphoglucosamine mutase  60.67 
 
 
446 aa  516  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0349041  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1768  phosphoglucosamine mutase  60.18 
 
 
455 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3566  phosphoglucosamine mutase  59.46 
 
 
445 aa  513  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0054919  hitchhiker  0.00000589779 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03402  phosphoglucosamine mutase  60.5 
 
 
446 aa  514  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0485  phosphoglucosamine mutase  60.14 
 
 
445 aa  514  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00237844  normal  0.220868 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2718  phosphoglucosamine mutase  58.84 
 
 
446 aa  513  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.286925  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2822  phosphoglucosamine mutase  57.33 
 
 
450 aa  513  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2243  phosphoglucosamine mutase  57.65 
 
 
452 aa  512  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.6083  normal  0.124274 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0946  phosphoglucosamine mutase  58.5 
 
 
450 aa  508  9.999999999999999e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1738  phosphoglucosamine mutase  59.96 
 
 
450 aa  507  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.738973  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3285  phosphoglucosamine mutase  60.54 
 
 
445 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526752  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1123  phosphoglucosamine mutase  60.54 
 
 
445 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000138646  unclonable  0.0000000000053894 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0985  phosphoglucosamine mutase  60.95 
 
 
445 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000240064  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1188  phosphoglucosamine mutase  58 
 
 
451 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.282955 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1199  phosphoglucosamine mutase  60.09 
 
 
445 aa  501  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0779  phosphoglucosamine mutase  57.43 
 
 
452 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1484  phosphoglucosamine mutase  57.43 
 
 
452 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1135  phosphoglucosamine mutase  58.52 
 
 
458 aa  502  1e-141  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1617  phosphoglucosamine mutase  57.43 
 
 
452 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0594  phosphoglucosamine mutase  58.24 
 
 
445 aa  504  1e-141  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0485  phosphoglucosamine mutase  57.58 
 
 
463 aa  503  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.519608  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3422  phosphoglucosamine mutase  60.09 
 
 
445 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000143803  decreased coverage  0.000132803 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1002  phosphoglucosamine mutase  60.63 
 
 
445 aa  501  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0206827  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2021  phosphoglucosamine mutase  58.09 
 
 
451 aa  501  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1719  phosphoglucosamine mutase  56.89 
 
 
447 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.905768 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3244  phosphoglucosamine mutase  60.09 
 
 
445 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000220965  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1021  phosphoglucosamine mutase  60.09 
 
 
445 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000107828  hitchhiker  0.000573147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1086  phosphoglucosamine mutase  60.09 
 
 
445 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00718811  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1176  phosphoglucosamine mutase  58 
 
 
451 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873875  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1514  phosphoglucosamine mutase  57.43 
 
 
452 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149991  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1290  phosphoglucosamine mutase  57.43 
 
 
452 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.985716  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2839  phosphoglucosamine mutase  60.09 
 
 
445 aa  502  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000184945  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1025  phosphoglucosamine mutase  60.09 
 
 
445 aa  503  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0055133  hitchhiker  0.0000634577 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0578  phosphoglucosamine mutase  57.43 
 
 
452 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0573  phosphoglucosamine mutase  57.43 
 
 
467 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0791443  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2027  phosphoglucosamine mutase  56.44 
 
 
447 aa  499  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2774  phosphoglucosamine mutase  57.43 
 
 
452 aa  498  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0322399  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2850  phosphoglucosamine mutase  58.52 
 
 
443 aa  500  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.45347 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3353  phosphoglucosamine mutase  59.73 
 
 
447 aa  499  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0881  phosphoglucosamine mutase  57.3 
 
 
452 aa  500  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.389268  normal  0.0916323 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>