More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0716 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4716  phosphoglucosamine mutase  95.29 
 
 		 446 aa  871    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4495  phosphoglucosamine mutase  84.23 
 
 		 447 aa  780    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.235157  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4185  phosphoglucosamine mutase  84.68 
 
 		 447 aa  783    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0716  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 		 446 aa  908    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.149315 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0774  phosphoglucosamine mutase  87.39 
 
 		 445 aa  776    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000226413  normal  0.0239811 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42860  phosphoglucosamine mutase  83.37 
 
 		 445 aa  745    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3613  phosphoglucosamine mutase  80.67 
 
 		 445 aa  713    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5469  phosphoglucosamine mutase  84.04 
 
 		 445 aa  786    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4582  phosphoglucosamine mutase  94.84 
 
 		 446 aa  870    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.922342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62840  phosphoglucosamine mutase  83.6 
 
 		 445 aa  781    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4717  phosphoglucosamine mutase  94.84 
 
 		 446 aa  848    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3610  phosphoglucosamine mutase  63.64 
 
 		 445 aa  569  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00189073  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3449  phosphoglucosamine mutase  62.9 
 
 		 445 aa  565  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1847  phosphoglucosamine mutase  63.43 
 
 		 447 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.310353  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3018  phosphoglucosamine mutase  60.4 
 
 		 450 aa  558  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0396425 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2888  phosphoglucosamine mutase  60.4 
 
 		 450 aa  557  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0730  phosphoglucosamine mutase  63.33 
 
 		 444 aa  557  1e-157  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1333  phosphoglucosamine mutase  60.63 
 
 		 450 aa  557  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.951592  hitchhiker  0.00110502 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1398  phosphoglucosamine mutase  60.4 
 
 		 450 aa  558  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.033665 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0983  phosphoglucosamine mutase  62.42 
 
 		 451 aa  552  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0995172  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3394  phosphoglucosamine mutase  61.28 
 
 		 443 aa  553  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000763461  hitchhiker  0.000140936 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1487  phosphoglucosamine mutase  59.73 
 
 		 450 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.152305  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2822  phosphoglucosamine mutase  59.96 
 
 		 450 aa  548  1e-155  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0956  phosphoglucosamine mutase  61.36 
 
 		 445 aa  550  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0280063  normal  0.292928 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2243  phosphoglucosamine mutase  60.58 
 
 		 452 aa  548  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.6083  normal  0.124274 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2832  phosphoglucosamine mutase  60.36 
 
 		 443 aa  546  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0011182  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2567  phosphoglucosamine mutase  61.54 
 
 		 451 aa  547  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.474953  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3353  phosphoglucosamine mutase  63.95 
 
 		 447 aa  546  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3469  phosphoglucosamine mutase  62.73 
 
 		 445 aa  547  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3065  phosphoglucosamine mutase  60.68 
 
 		 445 aa  546  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002605  phosphoglucosamine mutase  61.85 
 
 		 446 aa  546  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000248269  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01688  phosphoglucosamine mutase  60.82 
 
 		 447 aa  544  1e-154  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000297141  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0985  phosphoglucosamine mutase  61.94 
 
 		 445 aa  546  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000240064  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3350  phosphoglucosamine mutase  62.41 
 
 		 445 aa  547  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0843387  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0168  phosphoglucosamine mutase  62.39 
 
 		 446 aa  547  1e-154  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000649392  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03041  phosphoglucosamine mutase  61.85 
 
 		 445 aa  542  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0250482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0531  phosphoglucosamine mutase  61.85 
 
 		 445 aa  542  1e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0782231  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4498  phosphoglucosamine mutase  61.85 
 
 		 445 aa  542  1e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3661  phosphoglucosamine mutase  61.85 
 
 		 445 aa  542  1e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000185546  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3553  phosphoglucosamine mutase  62.3 
 
 		 445 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02992  hypothetical protein  61.85 
 
 		 445 aa  542  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0265797  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3483  phosphoglucosamine mutase  62.3 
 
 		 445 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3594  phosphoglucosamine mutase  61.85 
 
 		 445 aa  542  1e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000289716  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3589  phosphoglucosamine mutase  62.3 
 
 		 445 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3651  phosphoglucosamine mutase  62.3 
 
 		 445 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3472  phosphoglucosamine mutase  61.85 
 
 		 445 aa  542  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000247168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3368  phosphoglucosamine mutase  61.85 
 
 		 445 aa  542  1e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000272746  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0524  phosphoglucosamine mutase  61.85 
 
 		 445 aa  542  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0662864  hitchhiker  0.00167255 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3483  phosphoglucosamine mutase  62.3 
 
 		 445 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0848624  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0568  phosphoglucosamine mutase  61.59 
 
 		 445 aa  540  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.468081  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0485  phosphoglucosamine mutase  62.19 
 
 		 445 aa  540  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00237844  normal  0.220868 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3566  phosphoglucosamine mutase  60.36 
 
 		 445 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0054919  hitchhiker  0.00000589779 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0803  phosphoglucosamine mutase  61.4 
 
 		 445 aa  538  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0442046  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1123  phosphoglucosamine mutase  60.86 
 
 		 445 aa  538  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000138646  unclonable  0.0000000000053894 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3285  phosphoglucosamine mutase  60.86 
 
 		 445 aa  538  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526752  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1199  phosphoglucosamine mutase  61.28 
 
 		 445 aa  537  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2839  phosphoglucosamine mutase  61.28 
 
 		 445 aa  535  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000184945  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3422  phosphoglucosamine mutase  60.82 
 
 		 445 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000143803  decreased coverage  0.000132803 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03402  phosphoglucosamine mutase  60.72 
 
 		 446 aa  536  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1002  phosphoglucosamine mutase  60.59 
 
 		 445 aa  535  1e-151  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0206827  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1021  phosphoglucosamine mutase  61.28 
 
 		 445 aa  536  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000107828  hitchhiker  0.000573147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1086  phosphoglucosamine mutase  61.28 
 
 		 445 aa  537  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00718811  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3244  phosphoglucosamine mutase  60.82 
 
 		 445 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000220965  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1025  phosphoglucosamine mutase  61.28 
 
 		 445 aa  537  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0055133  hitchhiker  0.0000634577 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0594  phosphoglucosamine mutase  59.82 
 
 		 445 aa  533  1e-150  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2718  phosphoglucosamine mutase  61.74 
 
 		 446 aa  533  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.286925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1022  phosphoglucosamine mutase  60.95 
 
 		 448 aa  531  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00540573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3987  phosphoglucosamine mutase  62 
 
 		 446 aa  530  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3600  phosphoglucosamine mutase  62 
 
 		 446 aa  530  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434443  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1573  phosphoglucosamine mutase  59 
 
 		 447 aa  530  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126154  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1973  phosphoglucosamine mutase  61.63 
 
 		 451 aa  530  1e-149  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100286 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3734  phosphoglucosamine mutase  62 
 
 		 446 aa  530  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0349041  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0814  phosphoglucosamine mutase  59.01 
 
 		 444 aa  527  1e-148  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000566204  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3079  phosphoglucosamine mutase  61.25 
 
 		 453 aa  525  1e-148  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.7667  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1967  phosphoglucosamine mutase  60.5 
 
 		 446 aa  523  1e-147  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000194402  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0636  phosphoglucosamine mutase  57.63 
 
 		 445 aa  523  1e-147  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.605562  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2840  phosphoglucosamine mutase  56.56 
 
 		 455 aa  513  1e-144  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2709  phosphoglucosamine mutase  56.56 
 
 		 455 aa  513  1e-144  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0705  phosphoglucosamine mutase  59.95 
 
 		 446 aa  512  1e-144  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0611837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0785  phosphoglucosamine mutase  59.56 
 
 		 453 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2839  phosphoglucosamine mutase  59.02 
 
 		 453 aa  506  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0946  phosphoglucosamine mutase  58.13 
 
 		 450 aa  501  1e-141  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0813  phosphoglucosamine mutase  58.82 
 
 		 443 aa  498  1e-140  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389869 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0485  phosphoglucosamine mutase  56.7 
 
 		 463 aa  500  1e-140  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.519608  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1438  phosphoglucosamine mutase  56.28 
 
 		 446 aa  493  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.628979  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1768  phosphoglucosamine mutase  58.18 
 
 		 455 aa  493  9.999999999999999e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2168  phosphoglucosamine mutase  57.43 
 
 		 447 aa  491  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1504  phosphoglucosamine mutase  56.28 
 
 		 446 aa  491  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2186  phosphoglucosamine mutase  57.05 
 
 		 447 aa  493  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0721  phosphoglucosamine mutase  59.14 
 
 		 446 aa  491  1e-137  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1359  phosphoglucosamine mutase  54.51 
 
 		 455 aa  488  1e-137  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1135  phosphoglucosamine mutase  55.13 
 
 		 458 aa  489  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0810  phosphoglucosamine mutase  59.14 
 
 		 446 aa  489  1e-137  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1484  phosphoglucosamine mutase  54.53 
 
 		 452 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0578  phosphoglucosamine mutase  54.53 
 
 		 452 aa  488  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0779  phosphoglucosamine mutase  54.53 
 
 		 452 aa  488  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1617  phosphoglucosamine mutase  54.53 
 
 		 452 aa  488  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2774  phosphoglucosamine mutase  54.75 
 
 		 452 aa  486  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0322399  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0573  phosphoglucosamine mutase  54.53 
 
 		 467 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0791443  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1738  phosphoglucosamine mutase  57.68 
 
 		 450 aa  486  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.738973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>