More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002605 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03041  phosphoglucosamine mutase  75.06 
 
 		 445 aa  667    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0250482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0531  phosphoglucosamine mutase  75.06 
 
 		 445 aa  667    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0782231  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3734  phosphoglucosamine mutase  74.44 
 
 		 446 aa  658    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0349041  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03402  phosphoglucosamine mutase  95.52 
 
 		 446 aa  844    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0485  phosphoglucosamine mutase  74.49 
 
 		 445 aa  669    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00237844  normal  0.220868 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3594  phosphoglucosamine mutase  75.06 
 
 		 445 aa  667    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000289716  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3553  phosphoglucosamine mutase  75.73 
 
 		 445 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4498  phosphoglucosamine mutase  74.83 
 
 		 445 aa  665    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0524  phosphoglucosamine mutase  75.06 
 
 		 445 aa  667    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0662864  hitchhiker  0.00167255 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3483  phosphoglucosamine mutase  75.73 
 
 		 445 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0168  phosphoglucosamine mutase  91.26 
 
 		 446 aa  807    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000649392  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3987  phosphoglucosamine mutase  74.44 
 
 		 446 aa  658    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002605  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 		 446 aa  905    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000248269  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3483  phosphoglucosamine mutase  75.73 
 
 		 445 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0848624  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3469  phosphoglucosamine mutase  73.81 
 
 		 445 aa  660    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0594  phosphoglucosamine mutase  83.3 
 
 		 445 aa  736    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3651  phosphoglucosamine mutase  75.73 
 
 		 445 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3610  phosphoglucosamine mutase  74.22 
 
 		 445 aa  691    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00189073  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3600  phosphoglucosamine mutase  74.44 
 
 		 446 aa  658    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434443  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02992  hypothetical protein  75.06 
 
 		 445 aa  667    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0265797  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3589  phosphoglucosamine mutase  75.73 
 
 		 445 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3350  phosphoglucosamine mutase  73.24 
 
 		 445 aa  660    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0843387  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0730  phosphoglucosamine mutase  72.62 
 
 		 444 aa  652    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0568  phosphoglucosamine mutase  74.61 
 
 		 445 aa  661    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.468081  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3472  phosphoglucosamine mutase  75.06 
 
 		 445 aa  667    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000247168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0803  phosphoglucosamine mutase  74.55 
 
 		 445 aa  659    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0442046  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3661  phosphoglucosamine mutase  75.06 
 
 		 445 aa  667    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000185546  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3368  phosphoglucosamine mutase  75.06 
 
 		 445 aa  667    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000272746  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1573  phosphoglucosamine mutase  68.11 
 
 		 447 aa  624  1e-177  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126154  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3449  phosphoglucosamine mutase  68.56 
 
 		 445 aa  616  1e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01688  phosphoglucosamine mutase  67.12 
 
 		 447 aa  610  1e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000297141  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0636  phosphoglucosamine mutase  64.71 
 
 		 445 aa  610  1e-173  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.605562  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0956  phosphoglucosamine mutase  66.59 
 
 		 445 aa  600  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0280063  normal  0.292928 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2832  phosphoglucosamine mutase  66.14 
 
 		 443 aa  597  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0011182  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3065  phosphoglucosamine mutase  65.23 
 
 		 445 aa  588  1e-167  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3394  phosphoglucosamine mutase  64.46 
 
 		 443 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000763461  hitchhiker  0.000140936 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0985  phosphoglucosamine mutase  66.14 
 
 		 445 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000240064  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1002  phosphoglucosamine mutase  65.46 
 
 		 445 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0206827  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3566  phosphoglucosamine mutase  64.01 
 
 		 445 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0054919  hitchhiker  0.00000589779 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3018  phosphoglucosamine mutase  62.95 
 
 		 450 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0396425 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3244  phosphoglucosamine mutase  65.16 
 
 		 445 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000220965  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3422  phosphoglucosamine mutase  65.16 
 
 		 445 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000143803  decreased coverage  0.000132803 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2888  phosphoglucosamine mutase  62.5 
 
 		 450 aa  568  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1123  phosphoglucosamine mutase  65.31 
 
 		 445 aa  568  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000138646  unclonable  0.0000000000053894 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2839  phosphoglucosamine mutase  64.93 
 
 		 445 aa  568  1e-161  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000184945  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1398  phosphoglucosamine mutase  62.95 
 
 		 450 aa  571  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.033665 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3285  phosphoglucosamine mutase  65.31 
 
 		 445 aa  568  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526752  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1025  phosphoglucosamine mutase  64.79 
 
 		 445 aa  569  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0055133  hitchhiker  0.0000634577 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1199  phosphoglucosamine mutase  64.56 
 
 		 445 aa  565  1e-160  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5469  phosphoglucosamine mutase  60.86 
 
 		 445 aa  566  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1021  phosphoglucosamine mutase  64.56 
 
 		 445 aa  565  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000107828  hitchhiker  0.000573147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1086  phosphoglucosamine mutase  64.56 
 
 		 445 aa  567  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00718811  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0716  phosphoglucosamine mutase  61.85 
 
 		 446 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.149315 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4582  phosphoglucosamine mutase  61.85 
 
 		 446 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.922342  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4716  phosphoglucosamine mutase  62.08 
 
 		 446 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4495  phosphoglucosamine mutase  60.05 
 
 		 447 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.235157  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4185  phosphoglucosamine mutase  59.78 
 
 		 447 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62840  phosphoglucosamine mutase  60.41 
 
 		 445 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1487  phosphoglucosamine mutase  62.05 
 
 		 450 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.152305  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42860  phosphoglucosamine mutase  60.63 
 
 		 445 aa  560  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1333  phosphoglucosamine mutase  62.28 
 
 		 450 aa  560  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.951592  hitchhiker  0.00110502 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1847  phosphoglucosamine mutase  62.5 
 
 		 447 aa  555  1e-157  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.310353  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0813  phosphoglucosamine mutase  65.76 
 
 		 443 aa  557  1e-157  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389869 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2567  phosphoglucosamine mutase  60.59 
 
 		 451 aa  555  1e-157  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.474953  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2840  phosphoglucosamine mutase  60.91 
 
 		 455 aa  553  1e-156  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2709  phosphoglucosamine mutase  60.91 
 
 		 455 aa  553  1e-156  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0774  phosphoglucosamine mutase  61.42 
 
 		 445 aa  554  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000226413  normal  0.0239811 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2822  phosphoglucosamine mutase  61.3 
 
 		 450 aa  551  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2243  phosphoglucosamine mutase  61.52 
 
 		 452 aa  551  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.6083  normal  0.124274 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4717  phosphoglucosamine mutase  62.08 
 
 		 446 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0814  phosphoglucosamine mutase  60.72 
 
 		 444 aa  539  9.999999999999999e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000566204  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0983  phosphoglucosamine mutase  61.17 
 
 		 451 aa  540  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0995172  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0946  phosphoglucosamine mutase  59.51 
 
 		 450 aa  529  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1967  phosphoglucosamine mutase  59.95 
 
 		 446 aa  530  1e-149  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000194402  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1973  phosphoglucosamine mutase  59.64 
 
 		 451 aa  530  1e-149  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100286 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3613  phosphoglucosamine mutase  60.41 
 
 		 445 aa  523  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0785  phosphoglucosamine mutase  60.31 
 
 		 453 aa  522  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3079  phosphoglucosamine mutase  60.31 
 
 		 453 aa  521  1e-147  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.7667  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0485  phosphoglucosamine mutase  59.42 
 
 		 463 aa  520  1e-146  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.519608  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1022  phosphoglucosamine mutase  58.64 
 
 		 448 aa  516  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00540573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1738  phosphoglucosamine mutase  60.22 
 
 		 450 aa  512  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.738973  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3353  phosphoglucosamine mutase  58.56 
 
 		 447 aa  512  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0779  phosphoglucosamine mutase  56.73 
 
 		 452 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1617  phosphoglucosamine mutase  56.73 
 
 		 452 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1290  phosphoglucosamine mutase  56.73 
 
 		 452 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.985716  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2774  phosphoglucosamine mutase  56.73 
 
 		 452 aa  509  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0322399  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2860  phosphoglucosamine mutase  56.95 
 
 		 452 aa  509  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1484  phosphoglucosamine mutase  56.73 
 
 		 452 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0573  phosphoglucosamine mutase  56.73 
 
 		 467 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0791443  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0578  phosphoglucosamine mutase  56.73 
 
 		 452 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1514  phosphoglucosamine mutase  56.73 
 
 		 452 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149991  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4441  phosphoglucosamine mutase  56.7 
 
 		 451 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0856  phosphoglucosamine mutase  56.73 
 
 		 450 aa  504  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.304504  normal  0.368726 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1264  phosphoglucosamine mutase  57.17 
 
 		 452 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.595538 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1176  phosphoglucosamine mutase  56.63 
 
 		 451 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873875  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1188  phosphoglucosamine mutase  56.63 
 
 		 451 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.282955 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1768  phosphoglucosamine mutase  58.41 
 
 		 455 aa  502  1e-141  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1135  phosphoglucosamine mutase  58.22 
 
 		 458 aa  503  1e-141  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2021  phosphoglucosamine mutase  56.47 
 
 		 451 aa  503  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2186  phosphoglucosamine mutase  57.85 
 
 		 447 aa  500  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.24566 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>