More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1260 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1359  phosphoglucosamine mutase  75.99 
 
 
455 aa  708    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1006  phosphoglucosamine mutase  75.99 
 
 
455 aa  711    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1260  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 
451 aa  925    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000461219  normal  0.0582076 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3449  phosphoglucosamine mutase  54.39 
 
 
445 aa  494  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2718  phosphoglucosamine mutase  54.55 
 
 
446 aa  483  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.286925  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3610  phosphoglucosamine mutase  53.45 
 
 
445 aa  479  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00189073  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2567  phosphoglucosamine mutase  52.8 
 
 
451 aa  476  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.474953  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2243  phosphoglucosamine mutase  53.32 
 
 
452 aa  476  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.6083  normal  0.124274 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5469  phosphoglucosamine mutase  53.32 
 
 
445 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0956  phosphoglucosamine mutase  53.67 
 
 
445 aa  476  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0280063  normal  0.292928 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62840  phosphoglucosamine mutase  53.54 
 
 
445 aa  477  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0983  phosphoglucosamine mutase  52.76 
 
 
451 aa  474  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0995172  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2186  phosphoglucosamine mutase  52.23 
 
 
447 aa  472  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3483  phosphoglucosamine mutase  54.77 
 
 
445 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2168  phosphoglucosamine mutase  52.9 
 
 
447 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3472  phosphoglucosamine mutase  54.32 
 
 
445 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000247168  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0803  phosphoglucosamine mutase  55.11 
 
 
445 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0442046  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1768  phosphoglucosamine mutase  54.29 
 
 
455 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3483  phosphoglucosamine mutase  54.77 
 
 
445 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0848624  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3589  phosphoglucosamine mutase  54.77 
 
 
445 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3651  phosphoglucosamine mutase  54.77 
 
 
445 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1973  phosphoglucosamine mutase  52.88 
 
 
451 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0100286 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0568  phosphoglucosamine mutase  54.91 
 
 
445 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.468081  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1487  phosphoglucosamine mutase  53.98 
 
 
450 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.152305  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3469  phosphoglucosamine mutase  54.24 
 
 
445 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4498  phosphoglucosamine mutase  54.32 
 
 
445 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140787  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3553  phosphoglucosamine mutase  54.77 
 
 
445 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03041  phosphoglucosamine mutase  54.32 
 
 
445 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0250482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0531  phosphoglucosamine mutase  54.32 
 
 
445 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0782231  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3594  phosphoglucosamine mutase  54.32 
 
 
445 aa  468  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000289716  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1022  phosphoglucosamine mutase  53.32 
 
 
448 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00540573  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3350  phosphoglucosamine mutase  53.57 
 
 
445 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0843387  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3661  phosphoglucosamine mutase  54.32 
 
 
445 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000185546  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3018  phosphoglucosamine mutase  53.66 
 
 
450 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0396425 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1264  phosphoglucosamine mutase  52.64 
 
 
452 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.595538 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1967  phosphoglucosamine mutase  52.65 
 
 
446 aa  468  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000194402  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0485  phosphoglucosamine mutase  53.79 
 
 
445 aa  466  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00237844  normal  0.220868 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02992  hypothetical protein  54.32 
 
 
445 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0265797  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3368  phosphoglucosamine mutase  54.32 
 
 
445 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000272746  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1719  phosphoglucosamine mutase  52.36 
 
 
447 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.905768 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1573  phosphoglucosamine mutase  51.45 
 
 
447 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126154  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2832  phosphoglucosamine mutase  53.08 
 
 
443 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0011182  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1398  phosphoglucosamine mutase  53.56 
 
 
450 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.033665 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2860  phosphoglucosamine mutase  51.98 
 
 
452 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321505  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0716  phosphoglucosamine mutase  52.33 
 
 
446 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.149315 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2888  phosphoglucosamine mutase  53.88 
 
 
450 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2609  phosphoglucosamine mutase  52.46 
 
 
443 aa  467  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0524  phosphoglucosamine mutase  54.32 
 
 
445 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0662864  hitchhiker  0.00167255 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1528  phosphoglucosamine mutase  51.78 
 
 
447 aa  463  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.226614  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1484  phosphoglucosamine mutase  51.1 
 
 
452 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4495  phosphoglucosamine mutase  51.88 
 
 
447 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.235157  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42860  phosphoglucosamine mutase  53.41 
 
 
445 aa  462  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4185  phosphoglucosamine mutase  52.1 
 
 
447 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3566  phosphoglucosamine mutase  52.86 
 
 
445 aa  463  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0054919  hitchhiker  0.00000589779 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3065  phosphoglucosamine mutase  53.52 
 
 
445 aa  464  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2027  phosphoglucosamine mutase  52.36 
 
 
447 aa  464  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2021  phosphoglucosamine mutase  51.54 
 
 
451 aa  464  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1270  phosphoglucosamine mutase  51.2 
 
 
457 aa  462  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190809  normal  0.380438 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4582  phosphoglucosamine mutase  51.54 
 
 
446 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.922342  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4716  phosphoglucosamine mutase  51.76 
 
 
446 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1514  phosphoglucosamine mutase  51.1 
 
 
452 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149991  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3734  phosphoglucosamine mutase  54.12 
 
 
446 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0349041  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0779  phosphoglucosamine mutase  51.1 
 
 
452 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2840  phosphoglucosamine mutase  52.77 
 
 
455 aa  461  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2709  phosphoglucosamine mutase  52.77 
 
 
455 aa  461  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0946  phosphoglucosamine mutase  51.67 
 
 
450 aa  458  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3987  phosphoglucosamine mutase  54.12 
 
 
446 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304021  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1617  phosphoglucosamine mutase  51.1 
 
 
452 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0774  phosphoglucosamine mutase  51.87 
 
 
445 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000226413  normal  0.0239811 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1188  phosphoglucosamine mutase  51.22 
 
 
451 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.282955 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3600  phosphoglucosamine mutase  54.12 
 
 
446 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434443  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4923  phosphoglucosamine mutase  51 
 
 
447 aa  459  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.106408 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0785  phosphoglucosamine mutase  53.66 
 
 
453 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3079  phosphoglucosamine mutase  53.61 
 
 
453 aa  460  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.7667  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3394  phosphoglucosamine mutase  52.86 
 
 
443 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000763461  hitchhiker  0.000140936 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0573  phosphoglucosamine mutase  51.1 
 
 
467 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0791443  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0730  phosphoglucosamine mutase  53.45 
 
 
444 aa  459  9.999999999999999e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1021  phosphoglucosamine mutase  53.76 
 
 
445 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000107828  hitchhiker  0.000573147 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1333  phosphoglucosamine mutase  53.11 
 
 
450 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.951592  hitchhiker  0.00110502 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1086  phosphoglucosamine mutase  53.76 
 
 
445 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00718811  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1176  phosphoglucosamine mutase  51.22 
 
 
451 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873875  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1290  phosphoglucosamine mutase  51.1 
 
 
452 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.985716  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0881  phosphoglucosamine mutase  51.1 
 
 
452 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.389268  normal  0.0916323 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0578  phosphoglucosamine mutase  51.1 
 
 
452 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2839  phosphoglucosamine mutase  53.76 
 
 
445 aa  456  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000184945  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3244  phosphoglucosamine mutase  53.32 
 
 
445 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000220965  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1199  phosphoglucosamine mutase  53.98 
 
 
445 aa  456  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0814  phosphoglucosamine mutase  51.89 
 
 
444 aa  458  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000566204  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2774  phosphoglucosamine mutase  51.1 
 
 
452 aa  458  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0322399  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3285  phosphoglucosamine mutase  53.64 
 
 
445 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526752  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3422  phosphoglucosamine mutase  53.32 
 
 
445 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000143803  decreased coverage  0.000132803 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1123  phosphoglucosamine mutase  53.64 
 
 
445 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000138646  unclonable  0.0000000000053894 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0985  phosphoglucosamine mutase  54.55 
 
 
445 aa  456  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000240064  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1025  phosphoglucosamine mutase  53.76 
 
 
445 aa  455  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0055133  hitchhiker  0.0000634577 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4441  phosphoglucosamine mutase  50.56 
 
 
451 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2822  phosphoglucosamine mutase  51.88 
 
 
450 aa  451  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0856  phosphoglucosamine mutase  51.01 
 
 
450 aa  448  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.304504  normal  0.368726 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2619  phosphoglucosamine mutase  50.67 
 
 
444 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317995  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0485  phosphoglucosamine mutase  49.78 
 
 
463 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.519608  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2850  phosphoglucosamine mutase  51.22 
 
 
443 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.45347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>