More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1270 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4923  phosphoglucosamine mutase  71.55 
 
 		 447 aa  655    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106408 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1477  phosphoglucosamine mutase  73.19 
 
 		 444 aa  671    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2815  phosphoglucosamine mutase  72.97 
 
 		 444 aa  650    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1270  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 		 457 aa  913    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190809  normal  0.380438 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2619  phosphoglucosamine mutase  71.87 
 
 		 444 aa  648    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317995  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2013  phosphoglucosamine mutase  73.63 
 
 		 443 aa  670    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.993566  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2850  phosphoglucosamine mutase  74.51 
 
 		 443 aa  671    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.45347 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2626  phosphoglucosamine mutase  74.78 
 
 		 445 aa  664    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122301  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2609  phosphoglucosamine mutase  73.85 
 
 		 443 aa  675    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2381  phosphoglucosamine mutase  73.41 
 
 		 444 aa  673    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0209  phosphoglucosamine mutase  71.21 
 
 		 460 aa  634  1e-180  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1528  phosphoglucosamine mutase  68.36 
 
 		 447 aa  616  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.226614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4441  phosphoglucosamine mutase  67.9 
 
 		 451 aa  615  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2021  phosphoglucosamine mutase  68.12 
 
 		 451 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0818  phosphoglucosamine mutase  68.78 
 
 		 451 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1270  phosphoglucosamine mutase  68.78 
 
 		 451 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1299  phosphoglucosamine mutase  68.78 
 
 		 451 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61277  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1719  phosphoglucosamine mutase  67.48 
 
 		 447 aa  608  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.905768 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1484  phosphoglucosamine mutase  67.76 
 
 		 452 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0779  phosphoglucosamine mutase  67.76 
 
 		 452 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2027  phosphoglucosamine mutase  67.48 
 
 		 447 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1617  phosphoglucosamine mutase  67.76 
 
 		 452 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2774  phosphoglucosamine mutase  67.97 
 
 		 452 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0322399  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0573  phosphoglucosamine mutase  67.76 
 
 		 467 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0791443  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1176  phosphoglucosamine mutase  67.47 
 
 		 451 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873875  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1514  phosphoglucosamine mutase  67.76 
 
 		 452 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149991  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0578  phosphoglucosamine mutase  67.76 
 
 		 452 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1290  phosphoglucosamine mutase  67.76 
 
 		 452 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.985716  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1188  phosphoglucosamine mutase  67.47 
 
 		 451 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.282955 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2186  phosphoglucosamine mutase  67.25 
 
 		 447 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2168  phosphoglucosamine mutase  66.59 
 
 		 447 aa  601  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0881  phosphoglucosamine mutase  65.58 
 
 		 452 aa  597  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.389268  normal  0.0916323 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2860  phosphoglucosamine mutase  65.58 
 
 		 452 aa  591  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1264  phosphoglucosamine mutase  65.36 
 
 		 452 aa  589  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.595538 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0856  phosphoglucosamine mutase  60.79 
 
 		 450 aa  549  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.304504  normal  0.368726 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0946  phosphoglucosamine mutase  59.83 
 
 		 450 aa  545  1e-154  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1011  phosphoglucosamine mutase  61.89 
 
 		 450 aa  540  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.79008  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1738  phosphoglucosamine mutase  61.79 
 
 		 450 aa  535  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.738973  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0485  phosphoglucosamine mutase  58.39 
 
 		 463 aa  525  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.519608  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1135  phosphoglucosamine mutase  59.11 
 
 		 458 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3018  phosphoglucosamine mutase  56.34 
 
 		 450 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0396425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1398  phosphoglucosamine mutase  57.33 
 
 		 450 aa  502  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.033665 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2888  phosphoglucosamine mutase  55.91 
 
 		 450 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1333  phosphoglucosamine mutase  57.11 
 
 		 450 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.951592  hitchhiker  0.00110502 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1487  phosphoglucosamine mutase  56.16 
 
 		 450 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.152305  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0785  phosphoglucosamine mutase  54.8 
 
 		 453 aa  495  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3079  phosphoglucosamine mutase  58.21 
 
 		 453 aa  494  9.999999999999999e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.7667  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2243  phosphoglucosamine mutase  56.62 
 
 		 452 aa  488  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.6083  normal  0.124274 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1573  phosphoglucosamine mutase  54.29 
 
 		 447 aa  483  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126154  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1973  phosphoglucosamine mutase  56.11 
 
 		 451 aa  484  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100286 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3610  phosphoglucosamine mutase  55.08 
 
 		 445 aa  481  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00189073  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0983  phosphoglucosamine mutase  56.77 
 
 		 451 aa  482  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0995172  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3449  phosphoglucosamine mutase  54.08 
 
 		 445 aa  480  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2822  phosphoglucosamine mutase  54.45 
 
 		 450 aa  481  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0814  phosphoglucosamine mutase  51.88 
 
 		 444 aa  478  1e-133  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000566204  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2567  phosphoglucosamine mutase  53.52 
 
 		 451 aa  472  1e-132  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.474953  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0594  phosphoglucosamine mutase  54.29 
 
 		 445 aa  472  1e-132  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1967  phosphoglucosamine mutase  56 
 
 		 446 aa  473  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000194402  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1847  phosphoglucosamine mutase  55.36 
 
 		 447 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.310353  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002605  phosphoglucosamine mutase  55.95 
 
 		 446 aa  471  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000248269  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01688  phosphoglucosamine mutase  52.53 
 
 		 447 aa  470  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000297141  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0705  phosphoglucosamine mutase  55 
 
 		 446 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0611837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5469  phosphoglucosamine mutase  53.52 
 
 		 445 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0956  phosphoglucosamine mutase  54.47 
 
 		 445 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0280063  normal  0.292928 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03402  phosphoglucosamine mutase  55.73 
 
 		 446 aa  468  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0168  phosphoglucosamine mutase  56.17 
 
 		 446 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000649392  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62840  phosphoglucosamine mutase  53.3 
 
 		 445 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1260  phosphoglucosamine mutase  51.2 
 
 		 451 aa  462  1e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000461219  normal  0.0582076 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2840  phosphoglucosamine mutase  52.85 
 
 		 455 aa  463  1e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2709  phosphoglucosamine mutase  52.85 
 
 		 455 aa  462  1e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3469  phosphoglucosamine mutase  55.24 
 
 		 445 aa  461  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0716  phosphoglucosamine mutase  53.63 
 
 		 446 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.149315 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3651  phosphoglucosamine mutase  56.02 
 
 		 445 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3483  phosphoglucosamine mutase  56.02 
 
 		 445 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0848624  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3065  phosphoglucosamine mutase  53.74 
 
 		 445 aa  464  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3553  phosphoglucosamine mutase  56.02 
 
 		 445 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3589  phosphoglucosamine mutase  56.02 
 
 		 445 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3483  phosphoglucosamine mutase  56.02 
 
 		 445 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03041  phosphoglucosamine mutase  55.36 
 
 		 445 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0250482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0531  phosphoglucosamine mutase  55.36 
 
 		 445 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0782231  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3368  phosphoglucosamine mutase  55.36 
 
 		 445 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000272746  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4716  phosphoglucosamine mutase  53.19 
 
 		 446 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3472  phosphoglucosamine mutase  55.36 
 
 		 445 aa  458  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000247168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0524  phosphoglucosamine mutase  55.36 
 
 		 445 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0662864  hitchhiker  0.00167255 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3661  phosphoglucosamine mutase  55.36 
 
 		 445 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000185546  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4582  phosphoglucosamine mutase  52.97 
 
 		 446 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.922342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3594  phosphoglucosamine mutase  55.36 
 
 		 445 aa  459  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000289716  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02992  hypothetical protein  55.36 
 
 		 445 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0265797  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42860  phosphoglucosamine mutase  53.52 
 
 		 445 aa  460  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1768  phosphoglucosamine mutase  54.49 
 
 		 455 aa  460  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0730  phosphoglucosamine mutase  54.3 
 
 		 444 aa  459  9.999999999999999e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4498  phosphoglucosamine mutase  55.14 
 
 		 445 aa  457  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3566  phosphoglucosamine mutase  52.2 
 
 		 445 aa  458  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0054919  hitchhiker  0.00000589779 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0568  phosphoglucosamine mutase  54.15 
 
 		 445 aa  455  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.468081  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2832  phosphoglucosamine mutase  51.88 
 
 		 443 aa  457  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0011182  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4185  phosphoglucosamine mutase  51.85 
 
 		 447 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1022  phosphoglucosamine mutase  52.71 
 
 		 448 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00540573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0803  phosphoglucosamine mutase  54.17 
 
 		 445 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0442046  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2260  phosphoglucosamine mutase  55.73 
 
 		 454 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0324957  hitchhiker  0.0000000138006 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3353  phosphoglucosamine mutase  55.16 
 
 		 447 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>