More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1011 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0856  phosphoglucosamine mutase  87.5 
 
 		 450 aa  813    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.304504  normal  0.368726 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1011  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 		 450 aa  914    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.79008  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4441  phosphoglucosamine mutase  67.49 
 
 		 451 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1176  phosphoglucosamine mutase  67.04 
 
 		 451 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873875  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1188  phosphoglucosamine mutase  67.04 
 
 		 451 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.282955 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1719  phosphoglucosamine mutase  65.24 
 
 		 447 aa  601  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.905768 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2027  phosphoglucosamine mutase  65.69 
 
 		 447 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1264  phosphoglucosamine mutase  66.22 
 
 		 452 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.595538 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2860  phosphoglucosamine mutase  66 
 
 		 452 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2021  phosphoglucosamine mutase  67.04 
 
 		 451 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1528  phosphoglucosamine mutase  65.69 
 
 		 447 aa  600  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.226614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0573  phosphoglucosamine mutase  66.22 
 
 		 467 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0791443  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0779  phosphoglucosamine mutase  66.22 
 
 		 452 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1484  phosphoglucosamine mutase  66.22 
 
 		 452 aa  597  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1617  phosphoglucosamine mutase  66.22 
 
 		 452 aa  597  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0578  phosphoglucosamine mutase  66.22 
 
 		 452 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1514  phosphoglucosamine mutase  66.22 
 
 		 452 aa  597  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149991  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1290  phosphoglucosamine mutase  66.22 
 
 		 452 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.985716  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1270  phosphoglucosamine mutase  66.82 
 
 		 451 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2168  phosphoglucosamine mutase  64.56 
 
 		 447 aa  594  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2774  phosphoglucosamine mutase  66 
 
 		 452 aa  593  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0322399  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2186  phosphoglucosamine mutase  64.71 
 
 		 447 aa  593  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0818  phosphoglucosamine mutase  66.82 
 
 		 451 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1299  phosphoglucosamine mutase  66.82 
 
 		 451 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61277  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0881  phosphoglucosamine mutase  64.65 
 
 		 452 aa  588  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.389268  normal  0.0916323 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2850  phosphoglucosamine mutase  64.64 
 
 		 443 aa  577  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.45347 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2609  phosphoglucosamine mutase  62.25 
 
 		 443 aa  568  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1477  phosphoglucosamine mutase  63.57 
 
 		 444 aa  568  1e-161  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2626  phosphoglucosamine mutase  63.57 
 
 		 445 aa  568  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122301  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2619  phosphoglucosamine mutase  63.57 
 
 		 444 aa  568  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317995  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2381  phosphoglucosamine mutase  63.35 
 
 		 444 aa  567  1e-160  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1270  phosphoglucosamine mutase  61.89 
 
 		 457 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190809  normal  0.380438 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4923  phosphoglucosamine mutase  62.47 
 
 		 447 aa  556  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106408 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2815  phosphoglucosamine mutase  61 
 
 		 444 aa  554  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2013  phosphoglucosamine mutase  62.3 
 
 		 443 aa  550  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.993566  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0946  phosphoglucosamine mutase  60.09 
 
 		 450 aa  543  1e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1135  phosphoglucosamine mutase  56.43 
 
 		 458 aa  532  1e-150  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0485  phosphoglucosamine mutase  59.51 
 
 		 463 aa  533  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.519608  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1738  phosphoglucosamine mutase  62.11 
 
 		 450 aa  531  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.738973  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0209  phosphoglucosamine mutase  59.95 
 
 		 460 aa  531  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3449  phosphoglucosamine mutase  58.82 
 
 		 445 aa  525  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01688  phosphoglucosamine mutase  57.4 
 
 		 447 aa  523  1e-147  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000297141  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1967  phosphoglucosamine mutase  58.5 
 
 		 446 aa  514  1e-144  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000194402  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0785  phosphoglucosamine mutase  57.72 
 
 		 453 aa  513  1e-144  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1573  phosphoglucosamine mutase  57.24 
 
 		 447 aa  510  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126154  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0956  phosphoglucosamine mutase  56.88 
 
 		 445 aa  508  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0280063  normal  0.292928 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2840  phosphoglucosamine mutase  57.6 
 
 		 455 aa  506  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2709  phosphoglucosamine mutase  57.6 
 
 		 455 aa  507  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3610  phosphoglucosamine mutase  57.34 
 
 		 445 aa  506  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00189073  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3079  phosphoglucosamine mutase  56.85 
 
 		 453 aa  502  1e-141  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.7667  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3065  phosphoglucosamine mutase  57.11 
 
 		 445 aa  499  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3566  phosphoglucosamine mutase  57.34 
 
 		 445 aa  500  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0054919  hitchhiker  0.00000589779 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0730  phosphoglucosamine mutase  57.34 
 
 		 444 aa  499  1e-140  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1973  phosphoglucosamine mutase  55.41 
 
 		 451 aa  498  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100286 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3469  phosphoglucosamine mutase  57.47 
 
 		 445 aa  497  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3018  phosphoglucosamine mutase  56.61 
 
 		 450 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0396425 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0568  phosphoglucosamine mutase  57.47 
 
 		 445 aa  496  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.468081  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2888  phosphoglucosamine mutase  56.39 
 
 		 450 aa  495  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002605  phosphoglucosamine mutase  58.33 
 
 		 446 aa  495  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000248269  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0803  phosphoglucosamine mutase  57.69 
 
 		 445 aa  495  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0442046  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2822  phosphoglucosamine mutase  56.36 
 
 		 450 aa  496  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1847  phosphoglucosamine mutase  58.22 
 
 		 447 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.310353  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0168  phosphoglucosamine mutase  57.79 
 
 		 446 aa  492  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000649392  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1487  phosphoglucosamine mutase  56.61 
 
 		 450 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.152305  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0814  phosphoglucosamine mutase  55.73 
 
 		 444 aa  491  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000566204  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2832  phosphoglucosamine mutase  56.66 
 
 		 443 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0011182  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03402  phosphoglucosamine mutase  57.11 
 
 		 446 aa  492  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1022  phosphoglucosamine mutase  58.04 
 
 		 448 aa  492  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00540573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3394  phosphoglucosamine mutase  55.98 
 
 		 443 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000763461  hitchhiker  0.000140936 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2243  phosphoglucosamine mutase  56.89 
 
 		 452 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.6083  normal  0.124274 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1333  phosphoglucosamine mutase  56.61 
 
 		 450 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.951592  hitchhiker  0.00110502 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1398  phosphoglucosamine mutase  56.39 
 
 		 450 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.033665 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0594  phosphoglucosamine mutase  57.34 
 
 		 445 aa  493  9.999999999999999e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3350  phosphoglucosamine mutase  55.86 
 
 		 445 aa  489  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0843387  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0983  phosphoglucosamine mutase  56.6 
 
 		 451 aa  491  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0995172  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3651  phosphoglucosamine mutase  58.11 
 
 		 445 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3589  phosphoglucosamine mutase  58.11 
 
 		 445 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3483  phosphoglucosamine mutase  58.11 
 
 		 445 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0848624  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3553  phosphoglucosamine mutase  58.11 
 
 		 445 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3483  phosphoglucosamine mutase  58.11 
 
 		 445 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0485  phosphoglucosamine mutase  56.63 
 
 		 445 aa  491  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00237844  normal  0.220868 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0705  phosphoglucosamine mutase  55.66 
 
 		 446 aa  484  1e-135  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0611837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3734  phosphoglucosamine mutase  57.08 
 
 		 446 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0349041  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3987  phosphoglucosamine mutase  57.08 
 
 		 446 aa  483  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3600  phosphoglucosamine mutase  57.08 
 
 		 446 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434443  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03041  phosphoglucosamine mutase  57.34 
 
 		 445 aa  481  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0250482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0531  phosphoglucosamine mutase  57.34 
 
 		 445 aa  481  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0782231  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02992  hypothetical protein  57.34 
 
 		 445 aa  481  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0265797  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3472  phosphoglucosamine mutase  57.34 
 
 		 445 aa  480  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000247168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4498  phosphoglucosamine mutase  57.11 
 
 		 445 aa  478  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2567  phosphoglucosamine mutase  52.77 
 
 		 451 aa  479  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.474953  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3594  phosphoglucosamine mutase  57.34 
 
 		 445 aa  481  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000289716  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3368  phosphoglucosamine mutase  57.34 
 
 		 445 aa  481  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000272746  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1002  phosphoglucosamine mutase  56.36 
 
 		 445 aa  481  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0206827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0524  phosphoglucosamine mutase  57.34 
 
 		 445 aa  481  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0662864  hitchhiker  0.00167255 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3661  phosphoglucosamine mutase  57.34 
 
 		 445 aa  481  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000185546  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3285  phosphoglucosamine mutase  56.05 
 
 		 445 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526752  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0636  phosphoglucosamine mutase  52.37 
 
 		 445 aa  475  1e-133  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.605562  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0716  phosphoglucosamine mutase  53.26 
 
 		 446 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.149315 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3244  phosphoglucosamine mutase  56.05 
 
 		 445 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000220965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>