More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3629 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1690  phosphoglucosamine mutase  72.89 
 
 		 451 aa  689    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3195  phosphoglucosamine mutase  83.78 
 
 		 450 aa  769    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2622  phosphoglucosamine mutase  81.56 
 
 		 451 aa  755    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.412287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1224  phosphoglucosamine mutase  74.22 
 
 		 459 aa  694    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3166  phosphoglucosamine mutase  72.27 
 
 		 465 aa  667    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3490  phosphoglucosamine mutase  84.44 
 
 		 450 aa  773    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731606  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1634  phosphoglucosamine mutase  72.89 
 
 		 451 aa  689    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3629  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 		 450 aa  907    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.917297  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2566  phosphoglucosamine mutase  68.85 
 
 		 466 aa  633  1e-180  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.711802  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0171  phosphoglucosamine mutase  68.76 
 
 		 450 aa  628  1e-179  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0284476  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3635  phosphoglucosamine mutase  68.56 
 
 		 451 aa  623  1e-177  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0777  phosphoglucosamine mutase  68.22 
 
 		 449 aa  620  1e-176  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0601478 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1307  phosphoglucosamine mutase  65.17 
 
 		 450 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.537701  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4798  phosphoglucosamine mutase  65.62 
 
 		 450 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624556  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2973  phosphoglucosamine mutase  65.17 
 
 		 448 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1817  phosphoglucosamine mutase  65.17 
 
 		 449 aa  606  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4337  phosphoglucosamine mutase  67.82 
 
 		 447 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163728  normal  0.0707849 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4549  phosphoglucosamine mutase  67.68 
 
 		 446 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4838  phosphoglucosamine mutase  67.92 
 
 		 446 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4113  phosphoglucosamine mutase  65.46 
 
 		 450 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0304964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5306  phosphoglucosamine mutase  67.92 
 
 		 446 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.462537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5384  phosphoglucosamine mutase  68.22 
 
 		 446 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2131  phosphoglucosamine mutase  65.7 
 
 		 448 aa  598  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.361612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3067  phosphoglucosamine mutase  67.92 
 
 		 446 aa  597  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0481  phosphoglucosamine mutase  65.91 
 
 		 445 aa  593  1e-168  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1114  phosphoglucosamine mutase  64.33 
 
 		 448 aa  594  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3914  phosphoglucosamine mutase  65.97 
 
 		 450 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0081  phosphoglucosamine mutase  66.14 
 
 		 445 aa  585  1e-166  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.494438  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0960  phosphoglucosamine mutase  66.9 
 
 		 444 aa  570  1e-161  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.381116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4597  phosphoglucosamine mutase  62.9 
 
 		 448 aa  564  1e-160  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503943  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0817  phosphoglucosamine mutase  63.49 
 
 		 456 aa  551  1e-156  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0832094  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1100  phosphoglucosamine mutase  61.02 
 
 		 452 aa  546  1e-154  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.445304  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2305  phosphoglucosamine mutase  60.05 
 
 		 447 aa  545  1e-154  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.181279  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1205  phosphoglucosamine mutase  61.02 
 
 		 452 aa  541  9.999999999999999e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.713344  normal  0.913107 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2725  phosphoglucosamine mutase  58.48 
 
 		 447 aa  535  1e-151  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.949023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2490  phosphoglucosamine mutase  58.33 
 
 		 449 aa  528  1e-149  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0545  phosphoglucosamine mutase  58.65 
 
 		 447 aa  531  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1863  phosphoglucosamine mutase  58.93 
 
 		 447 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0512  phosphoglucosamine mutase  58.93 
 
 		 447 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0649  phosphoglucosamine mutase  58.26 
 
 		 447 aa  521  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.19519 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0360  phosphoglucosamine mutase  57.87 
 
 		 483 aa  505  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.943264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2397  phosphoglucosamine mutase  58.99 
 
 		 447 aa  499  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.793208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1783  phosphoglucosamine mutase  53.74 
 
 		 450 aa  473  1e-132  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.363404  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0059  phosphoglucosamine mutase  52.61 
 
 		 450 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1517  phosphoglucosamine mutase  52.61 
 
 		 450 aa  464  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.862212  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2635  phosphoglucosamine mutase  50.67 
 
 		 454 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1713  phosphoglucosamine mutase  52.58 
 
 		 450 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1599  phosphoglucosamine mutase  51.47 
 
 		 454 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1723  phosphoglucosamine mutase  50.79 
 
 		 450 aa  456  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2334  phosphoglucosamine mutase  51 
 
 		 469 aa  455  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.877927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0956  phosphoglucosamine mutase  52.34 
 
 		 445 aa  456  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0280063  normal  0.292928 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1805  phosphoglucosamine mutase  51.61 
 
 		 451 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1001  phosphoglucosamine mutase  51.12 
 
 		 460 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00128114  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1886  phosphoglucosamine mutase  51.85 
 
 		 451 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000764387  hitchhiker  0.00000000296737 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2730  phosphoglucosamine mutase  52.3 
 
 		 454 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2256  phosphoglucosamine mutase  50.23 
 
 		 453 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2525  phosphoglucosamine mutase  51.36 
 
 		 452 aa  443  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.620742  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0257  phosphoglucosamine mutase  51.12 
 
 		 449 aa  444  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497563  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0785  phosphoglucosamine mutase  49.89 
 
 		 453 aa  436  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1333  phosphoglucosamine mutase  50.23 
 
 		 450 aa  435  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.951592  hitchhiker  0.00110502 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1398  phosphoglucosamine mutase  50.23 
 
 		 450 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.033665 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2822  phosphoglucosamine mutase  50.56 
 
 		 450 aa  436  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2456  phosphoglucosamine mutase  49.34 
 
 		 496 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.406799  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3610  phosphoglucosamine mutase  50.81 
 
 		 445 aa  432  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00189073  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1768  phosphoglucosamine mutase  51.6 
 
 		 455 aa  432  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2368  phosphoglucosamine mutase  49.34 
 
 		 496 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.529976  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4716  phosphoglucosamine mutase  50.23 
 
 		 446 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1847  phosphoglucosamine mutase  50.67 
 
 		 447 aa  429  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.310353  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3018  phosphoglucosamine mutase  50.22 
 
 		 450 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0396425 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4185  phosphoglucosamine mutase  47.97 
 
 		 447 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2888  phosphoglucosamine mutase  50.45 
 
 		 450 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2567  phosphoglucosamine mutase  49.89 
 
 		 451 aa  430  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.474953  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1499  phosphoglucosamine mutase  49.46 
 
 		 458 aa  428  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1967  phosphoglucosamine mutase  50.69 
 
 		 446 aa  429  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000194402  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4582  phosphoglucosamine mutase  50.23 
 
 		 446 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.922342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1973  phosphoglucosamine mutase  50.89 
 
 		 451 aa  431  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100286 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0983  phosphoglucosamine mutase  51.13 
 
 		 451 aa  428  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0995172  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4495  phosphoglucosamine mutase  47.76 
 
 		 447 aa  428  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.235157  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2634  phosphoglucosamine mutase  51.29 
 
 		 454 aa  426  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2260  phosphoglucosamine mutase  51.29 
 
 		 454 aa  426  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0324957  hitchhiker  0.0000000138006 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0716  phosphoglucosamine mutase  48.77 
 
 		 446 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.149315 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3469  phosphoglucosamine mutase  50.57 
 
 		 445 aa  426  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1477  phosphoglucosamine mutase  50.57 
 
 		 444 aa  426  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2381  phosphoglucosamine mutase  50.34 
 
 		 444 aa  427  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1487  phosphoglucosamine mutase  50 
 
 		 450 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.152305  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3079  phosphoglucosamine mutase  50.44 
 
 		 453 aa  423  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.7667  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3353  phosphoglucosamine mutase  51.01 
 
 		 447 aa  422  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3483  phosphoglucosamine mutase  51.5 
 
 		 445 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0568  phosphoglucosamine mutase  50.8 
 
 		 445 aa  420  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.468081  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2832  phosphoglucosamine mutase  49.08 
 
 		 443 aa  420  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0011182  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3651  phosphoglucosamine mutase  51.5 
 
 		 445 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3483  phosphoglucosamine mutase  51.5 
 
 		 445 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0848624  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0803  phosphoglucosamine mutase  50.8 
 
 		 445 aa  418  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0442046  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0814  phosphoglucosamine mutase  48.87 
 
 		 444 aa  419  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000566204  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0485  phosphoglucosamine mutase  49.23 
 
 		 463 aa  420  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.519608  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5469  phosphoglucosamine mutase  48.76 
 
 		 445 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3553  phosphoglucosamine mutase  51.5 
 
 		 445 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3589  phosphoglucosamine mutase  51.5 
 
 		 445 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2243  phosphoglucosamine mutase  48.96 
 
 		 452 aa  421  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.6083  normal  0.124274 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3472  phosphoglucosamine mutase  51.5 
 
 		 445 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000247168  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>