More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4798 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4798  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 		 450 aa  902    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624556  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4838  phosphoglucosamine mutase  72.2 
 
 		 446 aa  647    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2566  phosphoglucosamine mutase  76.96 
 
 		 466 aa  708    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.711802  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2973  phosphoglucosamine mutase  86.16 
 
 		 448 aa  790    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3635  phosphoglucosamine mutase  70.44 
 
 		 451 aa  656    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0777  phosphoglucosamine mutase  71.71 
 
 		 449 aa  664    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0601478 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1307  phosphoglucosamine mutase  90.32 
 
 		 450 aa  825    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.537701  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4113  phosphoglucosamine mutase  88.51 
 
 		 450 aa  801    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0304964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5306  phosphoglucosamine mutase  72.2 
 
 		 446 aa  647    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.462537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3914  phosphoglucosamine mutase  92.29 
 
 		 450 aa  803    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1114  phosphoglucosamine mutase  86.38 
 
 		 448 aa  793    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3067  phosphoglucosamine mutase  74.83 
 
 		 446 aa  673    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1817  phosphoglucosamine mutase  89.19 
 
 		 449 aa  808    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5384  phosphoglucosamine mutase  73.18 
 
 		 446 aa  650    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4337  phosphoglucosamine mutase  75.41 
 
 		 447 aa  672    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163728  normal  0.0707849 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4549  phosphoglucosamine mutase  74.83 
 
 		 446 aa  674    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3166  phosphoglucosamine mutase  67.8 
 
 		 465 aa  632  1e-180  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3490  phosphoglucosamine mutase  66.89 
 
 		 450 aa  626  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731606  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2622  phosphoglucosamine mutase  66.52 
 
 		 451 aa  621  1e-177  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.412287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3195  phosphoglucosamine mutase  66.67 
 
 		 450 aa  624  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2131  phosphoglucosamine mutase  66.52 
 
 		 448 aa  614  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.361612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3629  phosphoglucosamine mutase  65.33 
 
 		 450 aa  610  1e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.917297  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1690  phosphoglucosamine mutase  64.75 
 
 		 451 aa  602  1.0000000000000001e-171  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1634  phosphoglucosamine mutase  64.75 
 
 		 451 aa  602  1.0000000000000001e-171  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1224  phosphoglucosamine mutase  64.75 
 
 		 459 aa  600  1e-170  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0081  phosphoglucosamine mutase  66 
 
 		 445 aa  587  1e-166  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.494438  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0481  phosphoglucosamine mutase  66.89 
 
 		 445 aa  585  1e-166  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0817  phosphoglucosamine mutase  65.98 
 
 		 456 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0832094  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0960  phosphoglucosamine mutase  65.08 
 
 		 444 aa  558  1e-158  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.381116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4597  phosphoglucosamine mutase  63.6 
 
 		 448 aa  555  1e-157  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503943  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0171  phosphoglucosamine mutase  61 
 
 		 450 aa  554  1e-156  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0284476  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1100  phosphoglucosamine mutase  62.05 
 
 		 452 aa  546  1e-154  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.445304  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1205  phosphoglucosamine mutase  60.8 
 
 		 452 aa  540  9.999999999999999e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.713344  normal  0.913107 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0649  phosphoglucosamine mutase  60.27 
 
 		 447 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.19519 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2725  phosphoglucosamine mutase  60.13 
 
 		 447 aa  521  1e-147  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.949023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2305  phosphoglucosamine mutase  58.92 
 
 		 447 aa  520  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.181279  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2490  phosphoglucosamine mutase  58.04 
 
 		 449 aa  518  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0545  phosphoglucosamine mutase  58.8 
 
 		 447 aa  516  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1863  phosphoglucosamine mutase  59.6 
 
 		 447 aa  514  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0512  phosphoglucosamine mutase  59.38 
 
 		 447 aa  514  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2397  phosphoglucosamine mutase  59.53 
 
 		 447 aa  484  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.793208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0360  phosphoglucosamine mutase  55.26 
 
 		 483 aa  481  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.943264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1599  phosphoglucosamine mutase  53.97 
 
 		 454 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2334  phosphoglucosamine mutase  53.08 
 
 		 469 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.877927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2635  phosphoglucosamine mutase  53.27 
 
 		 454 aa  451  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1886  phosphoglucosamine mutase  52.68 
 
 		 451 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000764387  hitchhiker  0.00000000296737 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1713  phosphoglucosamine mutase  52.83 
 
 		 450 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1805  phosphoglucosamine mutase  52.91 
 
 		 451 aa  443  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1001  phosphoglucosamine mutase  51.12 
 
 		 460 aa  442  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00128114  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1783  phosphoglucosamine mutase  52.13 
 
 		 450 aa  443  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.363404  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2730  phosphoglucosamine mutase  53.61 
 
 		 454 aa  444  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2256  phosphoglucosamine mutase  51.58 
 
 		 453 aa  443  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1517  phosphoglucosamine mutase  51.46 
 
 		 450 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.862212  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1723  phosphoglucosamine mutase  51.91 
 
 		 450 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0257  phosphoglucosamine mutase  52.13 
 
 		 449 aa  435  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497563  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2368  phosphoglucosamine mutase  51.44 
 
 		 496 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.529976  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2456  phosphoglucosamine mutase  51.44 
 
 		 496 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.406799  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1499  phosphoglucosamine mutase  51.75 
 
 		 458 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2525  phosphoglucosamine mutase  52.26 
 
 		 452 aa  436  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.620742  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2840  phosphoglucosamine mutase  51.93 
 
 		 455 aa  432  1e-120  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2709  phosphoglucosamine mutase  51.93 
 
 		 455 aa  432  1e-120  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0059  phosphoglucosamine mutase  51.01 
 
 		 450 aa  432  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2718  phosphoglucosamine mutase  51.11 
 
 		 446 aa  426  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.286925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1973  phosphoglucosamine mutase  53.01 
 
 		 451 aa  428  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100286 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2634  phosphoglucosamine mutase  52.69 
 
 		 454 aa  424  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2260  phosphoglucosamine mutase  52.69 
 
 		 454 aa  424  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0324957  hitchhiker  0.0000000138006 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3610  phosphoglucosamine mutase  50.34 
 
 		 445 aa  419  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00189073  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1438  phosphoglucosamine mutase  49.44 
 
 		 446 aa  421  1e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.628979  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1504  phosphoglucosamine mutase  49.44 
 
 		 446 aa  421  1e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0956  phosphoglucosamine mutase  49.33 
 
 		 445 aa  421  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0280063  normal  0.292928 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2567  phosphoglucosamine mutase  49.11 
 
 		 451 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.474953  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0814  phosphoglucosamine mutase  50.11 
 
 		 444 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000566204  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1022  phosphoglucosamine mutase  49.56 
 
 		 448 aa  418  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00540573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1398  phosphoglucosamine mutase  49.67 
 
 		 450 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.033665 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0294  phosphoglucosamine mutase  48.98 
 
 		 444 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000894137  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0983  phosphoglucosamine mutase  50.66 
 
 		 451 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0995172  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1719  phosphoglucosamine mutase  49.22 
 
 		 447 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.905768 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0485  phosphoglucosamine mutase  50 
 
 		 463 aa  413  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.519608  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3553  phosphoglucosamine mutase  52.03 
 
 		 445 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3483  phosphoglucosamine mutase  52.03 
 
 		 445 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0636  phosphoglucosamine mutase  49.55 
 
 		 445 aa  414  1e-114  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.605562  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1573  phosphoglucosamine mutase  48.55 
 
 		 447 aa  412  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126154  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3589  phosphoglucosamine mutase  52.03 
 
 		 445 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1333  phosphoglucosamine mutase  49.44 
 
 		 450 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.951592  hitchhiker  0.00110502 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3483  phosphoglucosamine mutase  52.03 
 
 		 445 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0848624  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3651  phosphoglucosamine mutase  52.03 
 
 		 445 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1768  phosphoglucosamine mutase  51.11 
 
 		 455 aa  412  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3469  phosphoglucosamine mutase  50.9 
 
 		 445 aa  412  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4716  phosphoglucosamine mutase  48.32 
 
 		 446 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4185  phosphoglucosamine mutase  48.33 
 
 		 447 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0946  phosphoglucosamine mutase  52.07 
 
 		 450 aa  411  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3018  phosphoglucosamine mutase  49.22 
 
 		 450 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0396425 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2039  phosphoglucosamine mutase  47.99 
 
 		 446 aa  409  1e-113  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4582  phosphoglucosamine mutase  49.54 
 
 		 446 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.922342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0154  phosphoglucosamine mutase  46.03 
 
 		 449 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1967  phosphoglucosamine mutase  51.72 
 
 		 446 aa  410  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000194402  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2888  phosphoglucosamine mutase  49.44 
 
 		 450 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1270  phosphoglucosamine mutase  48.58 
 
 		 457 aa  409  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190809  normal  0.380438 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4495  phosphoglucosamine mutase  48.11 
 
 		 447 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.235157  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1135  phosphoglucosamine mutase  50.78 
 
 		 458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>