More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0059 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1723  phosphoglucosamine mutase  74.89 
 
 		 450 aa  694    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1517  phosphoglucosamine mutase  79.78 
 
 		 450 aa  735    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.862212  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1713  phosphoglucosamine mutase  72.67 
 
 		 450 aa  661    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0059  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 		 450 aa  918    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1783  phosphoglucosamine mutase  85.11 
 
 		 450 aa  796    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.363404  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0257  phosphoglucosamine mutase  68.39 
 
 		 449 aa  610  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497563  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1805  phosphoglucosamine mutase  58.84 
 
 		 451 aa  537  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2730  phosphoglucosamine mutase  57.72 
 
 		 454 aa  535  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1001  phosphoglucosamine mutase  57.33 
 
 		 460 aa  532  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00128114  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1886  phosphoglucosamine mutase  58.39 
 
 		 451 aa  530  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000764387  hitchhiker  0.00000000296737 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2525  phosphoglucosamine mutase  57.59 
 
 		 452 aa  528  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.620742  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1599  phosphoglucosamine mutase  57.05 
 
 		 454 aa  525  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2256  phosphoglucosamine mutase  56.92 
 
 		 453 aa  526  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2635  phosphoglucosamine mutase  56.82 
 
 		 454 aa  524  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2622  phosphoglucosamine mutase  54.38 
 
 		 451 aa  492  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.412287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2334  phosphoglucosamine mutase  53.64 
 
 		 469 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.877927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3166  phosphoglucosamine mutase  54.69 
 
 		 465 aa  489  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3604  phosphoglucosamine mutase  53.9 
 
 		 454 aa  486  1e-136  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.623174  hitchhiker  0.000672034 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0081  phosphoglucosamine mutase  56.15 
 
 		 445 aa  487  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.494438  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3195  phosphoglucosamine mutase  53.47 
 
 		 450 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3490  phosphoglucosamine mutase  53.69 
 
 		 450 aa  487  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731606  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0360  phosphoglucosamine mutase  56.63 
 
 		 483 aa  484  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.943264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1205  phosphoglucosamine mutase  55.98 
 
 		 452 aa  478  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.713344  normal  0.913107 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1499  phosphoglucosamine mutase  53.83 
 
 		 458 aa  478  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0481  phosphoglucosamine mutase  55.03 
 
 		 445 aa  474  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2368  phosphoglucosamine mutase  53.1 
 
 		 496 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.529976  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2456  phosphoglucosamine mutase  53.1 
 
 		 496 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.406799  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2131  phosphoglucosamine mutase  53.57 
 
 		 448 aa  469  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.361612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3629  phosphoglucosamine mutase  52.61 
 
 		 450 aa  471  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.917297  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2566  phosphoglucosamine mutase  54.36 
 
 		 466 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.711802  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4597  phosphoglucosamine mutase  55.13 
 
 		 448 aa  466  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503943  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2397  phosphoglucosamine mutase  56.84 
 
 		 447 aa  465  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.793208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0817  phosphoglucosamine mutase  55.41 
 
 		 456 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0832094  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0202  phosphoglucosamine mutase  50.67 
 
 		 459 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0649  phosphoglucosamine mutase  57.87 
 
 		 447 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.19519 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0545  phosphoglucosamine mutase  54.12 
 
 		 447 aa  461  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0960  phosphoglucosamine mutase  54.05 
 
 		 444 aa  457  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.381116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4838  phosphoglucosamine mutase  54.44 
 
 		 446 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1634  phosphoglucosamine mutase  51.12 
 
 		 451 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1690  phosphoglucosamine mutase  51.12 
 
 		 451 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1863  phosphoglucosamine mutase  57.18 
 
 		 447 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2305  phosphoglucosamine mutase  54.82 
 
 		 447 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.181279  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5306  phosphoglucosamine mutase  54.44 
 
 		 446 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.462537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1224  phosphoglucosamine mutase  51.79 
 
 		 459 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0512  phosphoglucosamine mutase  57.41 
 
 		 447 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1100  phosphoglucosamine mutase  52.78 
 
 		 452 aa  451  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.445304  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0171  phosphoglucosamine mutase  51.45 
 
 		 450 aa  451  1e-125  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0284476  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3067  phosphoglucosamine mutase  54.21 
 
 		 446 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2490  phosphoglucosamine mutase  53.38 
 
 		 449 aa  445  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2913  phosphoglucosamine mutase  50.9 
 
 		 449 aa  447  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4549  phosphoglucosamine mutase  54.44 
 
 		 446 aa  444  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5384  phosphoglucosamine mutase  54.21 
 
 		 446 aa  443  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4337  phosphoglucosamine mutase  53.49 
 
 		 447 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163728  normal  0.0707849 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0956  phosphoglucosamine mutase  51.12 
 
 		 445 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0280063  normal  0.292928 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2973  phosphoglucosamine mutase  52.33 
 
 		 448 aa  437  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1307  phosphoglucosamine mutase  51.91 
 
 		 450 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.537701  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4113  phosphoglucosamine mutase  51.01 
 
 		 450 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0304964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4798  phosphoglucosamine mutase  51.01 
 
 		 450 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624556  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3914  phosphoglucosamine mutase  53.02 
 
 		 450 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1817  phosphoglucosamine mutase  51.24 
 
 		 449 aa  431  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3635  phosphoglucosamine mutase  50.89 
 
 		 451 aa  430  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1967  phosphoglucosamine mutase  51.36 
 
 		 446 aa  429  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000194402  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0777  phosphoglucosamine mutase  50 
 
 		 449 aa  429  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0601478 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1114  phosphoglucosamine mutase  51.4 
 
 		 448 aa  428  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0835  phosphoglucosamine mutase  49.89 
 
 		 445 aa  431  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2725  phosphoglucosamine mutase  53.83 
 
 		 447 aa  426  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.949023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2567  phosphoglucosamine mutase  49.89 
 
 		 451 aa  423  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.474953  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2832  phosphoglucosamine mutase  48.54 
 
 		 443 aa  419  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0011182  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0949  phosphoglucosamine mutase  49.56 
 
 		 447 aa  421  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3394  phosphoglucosamine mutase  48.67 
 
 		 443 aa  419  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000763461  hitchhiker  0.000140936 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1807  phosphoglucosamine mutase  48.28 
 
 		 446 aa  419  1e-116  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.109286  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1973  phosphoglucosamine mutase  51.12 
 
 		 451 aa  420  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100286 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3469  phosphoglucosamine mutase  50.79 
 
 		 445 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1768  phosphoglucosamine mutase  51.56 
 
 		 455 aa  416  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0983  phosphoglucosamine mutase  49.89 
 
 		 451 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0995172  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0730  phosphoglucosamine mutase  50.45 
 
 		 444 aa  415  1e-114  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3065  phosphoglucosamine mutase  48.21 
 
 		 445 aa  410  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0294  phosphoglucosamine mutase  47.52 
 
 		 444 aa  411  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000894137  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4923  phosphoglucosamine mutase  48.55 
 
 		 447 aa  409  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106408 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3422  phosphoglucosamine mutase  48.88 
 
 		 445 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000143803  decreased coverage  0.000132803 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2839  phosphoglucosamine mutase  48.88 
 
 		 445 aa  409  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000184945  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2039  phosphoglucosamine mutase  46.65 
 
 		 446 aa  411  1e-113  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1123  phosphoglucosamine mutase  49.1 
 
 		 445 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000138646  unclonable  0.0000000000053894 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1573  phosphoglucosamine mutase  47.33 
 
 		 447 aa  411  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126154  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3610  phosphoglucosamine mutase  48.32 
 
 		 445 aa  411  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00189073  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3285  phosphoglucosamine mutase  49.1 
 
 		 445 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526752  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1719  phosphoglucosamine mutase  48.67 
 
 		 447 aa  408  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.905768 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3244  phosphoglucosamine mutase  48.88 
 
 		 445 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000220965  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1717  phosphoglucosamine mutase  48.41 
 
 		 446 aa  411  1e-113  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.7778  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1847  phosphoglucosamine mutase  49.22 
 
 		 447 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.310353  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0409  phosphoglucosamine mutase  45.98 
 
 		 445 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3350  phosphoglucosamine mutase  50.11 
 
 		 445 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0843387  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0946  phosphoglucosamine mutase  48.67 
 
 		 450 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1438  phosphoglucosamine mutase  47.33 
 
 		 446 aa  405  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.628979  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0785  phosphoglucosamine mutase  47.68 
 
 		 453 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1002  phosphoglucosamine mutase  48.76 
 
 		 445 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0206827  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0636  phosphoglucosamine mutase  46.52 
 
 		 445 aa  406  1.0000000000000001e-112  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.605562  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0383  phosphoglucosamine mutase  45.54 
 
 		 451 aa  405  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1022  phosphoglucosamine mutase  49.44 
 
 		 448 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00540573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1025  phosphoglucosamine mutase  48.43 
 
 		 445 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0055133  hitchhiker  0.0000634577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>