More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0512 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1863  phosphoglucosamine mutase  99.55 
 
 
447 aa  895    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2725  phosphoglucosamine mutase  75.34 
 
 
447 aa  652    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.949023  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2305  phosphoglucosamine mutase  74.32 
 
 
447 aa  661    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.181279  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0649  phosphoglucosamine mutase  94.85 
 
 
447 aa  860    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.19519 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0512  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 
447 aa  897    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2397  phosphoglucosamine mutase  76.85 
 
 
447 aa  657    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.793208  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0545  phosphoglucosamine mutase  80.31 
 
 
447 aa  714    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0481  phosphoglucosamine mutase  62.86 
 
 
445 aa  551  1e-156  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0081  phosphoglucosamine mutase  63.09 
 
 
445 aa  541  9.999999999999999e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.494438  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2622  phosphoglucosamine mutase  60.18 
 
 
451 aa  535  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.412287  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1205  phosphoglucosamine mutase  62.05 
 
 
452 aa  535  1e-151  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.713344  normal  0.913107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4597  phosphoglucosamine mutase  60.81 
 
 
448 aa  536  1e-151  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503943  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2131  phosphoglucosamine mutase  63.25 
 
 
448 aa  537  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.361612  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1634  phosphoglucosamine mutase  60.22 
 
 
451 aa  531  1e-150  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1690  phosphoglucosamine mutase  60.22 
 
 
451 aa  531  1e-150  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3490  phosphoglucosamine mutase  60.18 
 
 
450 aa  533  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731606  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1100  phosphoglucosamine mutase  61.78 
 
 
452 aa  530  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.445304  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3195  phosphoglucosamine mutase  59.73 
 
 
450 aa  530  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0960  phosphoglucosamine mutase  62.39 
 
 
444 aa  526  1e-148  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.381116  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1224  phosphoglucosamine mutase  59.78 
 
 
459 aa  525  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3166  phosphoglucosamine mutase  59.5 
 
 
465 aa  526  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2566  phosphoglucosamine mutase  60.36 
 
 
466 aa  524  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.711802  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3629  phosphoglucosamine mutase  58.93 
 
 
450 aa  523  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.917297  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2490  phosphoglucosamine mutase  58.44 
 
 
449 aa  522  1e-147  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566654  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0817  phosphoglucosamine mutase  63.43 
 
 
456 aa  523  1e-147  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0832094  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1307  phosphoglucosamine mutase  59.78 
 
 
450 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.537701  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4549  phosphoglucosamine mutase  60.85 
 
 
446 aa  514  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2973  phosphoglucosamine mutase  58.8 
 
 
448 aa  513  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1817  phosphoglucosamine mutase  59.1 
 
 
449 aa  514  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1114  phosphoglucosamine mutase  59.55 
 
 
448 aa  514  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4798  phosphoglucosamine mutase  59.38 
 
 
450 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624556  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4838  phosphoglucosamine mutase  60.56 
 
 
446 aa  508  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530312  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5384  phosphoglucosamine mutase  61.48 
 
 
446 aa  509  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5306  phosphoglucosamine mutase  60.56 
 
 
446 aa  508  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.462537  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4337  phosphoglucosamine mutase  60.83 
 
 
447 aa  509  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163728  normal  0.0707849 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4113  phosphoglucosamine mutase  58.43 
 
 
450 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0304964  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3067  phosphoglucosamine mutase  60.63 
 
 
446 aa  510  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3914  phosphoglucosamine mutase  59.35 
 
 
450 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1001  phosphoglucosamine mutase  55.43 
 
 
460 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00128114  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0777  phosphoglucosamine mutase  57.46 
 
 
449 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0601478 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0171  phosphoglucosamine mutase  55.83 
 
 
450 aa  492  9.999999999999999e-139  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0284476  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3635  phosphoglucosamine mutase  57.14 
 
 
451 aa  491  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2635  phosphoglucosamine mutase  55.41 
 
 
454 aa  486  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1599  phosphoglucosamine mutase  55.41 
 
 
454 aa  482  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2730  phosphoglucosamine mutase  55.18 
 
 
454 aa  479  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1886  phosphoglucosamine mutase  55.23 
 
 
451 aa  475  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000764387  hitchhiker  0.00000000296737 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2525  phosphoglucosamine mutase  55.06 
 
 
452 aa  475  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.620742  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2256  phosphoglucosamine mutase  54.16 
 
 
453 aa  477  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1805  phosphoglucosamine mutase  55 
 
 
451 aa  472  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0360  phosphoglucosamine mutase  55.8 
 
 
483 aa  472  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.943264  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1517  phosphoglucosamine mutase  56.55 
 
 
450 aa  464  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.862212  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0257  phosphoglucosamine mutase  54.18 
 
 
449 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497563  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1499  phosphoglucosamine mutase  54.7 
 
 
458 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2456  phosphoglucosamine mutase  54.2 
 
 
496 aa  455  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.406799  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2368  phosphoglucosamine mutase  54.2 
 
 
496 aa  455  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.529976  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2334  phosphoglucosamine mutase  53.96 
 
 
469 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.877927  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0059  phosphoglucosamine mutase  57.41 
 
 
450 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1723  phosphoglucosamine mutase  53.67 
 
 
450 aa  449  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822287  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1713  phosphoglucosamine mutase  54.71 
 
 
450 aa  442  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1783  phosphoglucosamine mutase  55.81 
 
 
450 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.363404  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1573  phosphoglucosamine mutase  50.68 
 
 
447 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126154  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3604  phosphoglucosamine mutase  51.24 
 
 
454 aa  436  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.623174  hitchhiker  0.000672034 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1973  phosphoglucosamine mutase  52.02 
 
 
451 aa  436  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0100286 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0956  phosphoglucosamine mutase  50.9 
 
 
445 aa  434  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0280063  normal  0.292928 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1022  phosphoglucosamine mutase  50.57 
 
 
448 aa  429  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00540573  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3483  phosphoglucosamine mutase  52.25 
 
 
445 aa  425  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01688  phosphoglucosamine mutase  49.33 
 
 
447 aa  426  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000297141  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4185  phosphoglucosamine mutase  48.77 
 
 
447 aa  425  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1504  phosphoglucosamine mutase  48.11 
 
 
446 aa  427  1e-118  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3589  phosphoglucosamine mutase  52.25 
 
 
445 aa  425  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3350  phosphoglucosamine mutase  49.77 
 
 
445 aa  427  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0843387  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0785  phosphoglucosamine mutase  49.56 
 
 
453 aa  427  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1438  phosphoglucosamine mutase  48.11 
 
 
446 aa  427  1e-118  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.628979  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0730  phosphoglucosamine mutase  50.68 
 
 
444 aa  427  1e-118  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3483  phosphoglucosamine mutase  52.25 
 
 
445 aa  425  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0848624  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3553  phosphoglucosamine mutase  52.25 
 
 
445 aa  425  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1398  phosphoglucosamine mutase  49.67 
 
 
450 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.033665 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3651  phosphoglucosamine mutase  52.25 
 
 
445 aa  425  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3610  phosphoglucosamine mutase  50 
 
 
445 aa  428  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00189073  normal  0.0821499 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03041  phosphoglucosamine mutase  52.03 
 
 
445 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0250482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0531  phosphoglucosamine mutase  52.03 
 
 
445 aa  422  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0782231  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0524  phosphoglucosamine mutase  52.03 
 
 
445 aa  422  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0662864  hitchhiker  0.00167255 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4495  phosphoglucosamine mutase  49.21 
 
 
447 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.235157  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3594  phosphoglucosamine mutase  52.03 
 
 
445 aa  422  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000289716  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3368  phosphoglucosamine mutase  52.03 
 
 
445 aa  422  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000272746  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2260  phosphoglucosamine mutase  52.71 
 
 
454 aa  424  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0324957  hitchhiker  0.0000000138006 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3469  phosphoglucosamine mutase  50.34 
 
 
445 aa  424  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3661  phosphoglucosamine mutase  52.03 
 
 
445 aa  422  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000185546  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0983  phosphoglucosamine mutase  51.11 
 
 
451 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0995172  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2634  phosphoglucosamine mutase  52.71 
 
 
454 aa  424  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1333  phosphoglucosamine mutase  49.67 
 
 
450 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.951592  hitchhiker  0.00110502 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02992  hypothetical protein  52.03 
 
 
445 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0265797  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4498  phosphoglucosamine mutase  52.03 
 
 
445 aa  422  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140787  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3472  phosphoglucosamine mutase  52.03 
 
 
445 aa  422  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000247168  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2832  phosphoglucosamine mutase  50.59 
 
 
443 aa  419  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0011182  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2324  phosphoglucosamine mutase  52.19 
 
 
449 aa  419  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.4434  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1002  phosphoglucosamine mutase  50.23 
 
 
445 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0206827  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2186  phosphoglucosamine mutase  48.77 
 
 
447 aa  416  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2839  phosphoglucosamine mutase  50.11 
 
 
445 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000184945  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1123  phosphoglucosamine mutase  50.11 
 
 
445 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000138646  unclonable  0.0000000000053894 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>