More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1517 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1517  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 		 450 aa  918    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.862212  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1723  phosphoglucosamine mutase  75.11 
 
 		 450 aa  707    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1783  phosphoglucosamine mutase  78 
 
 		 450 aa  723    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.363404  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0059  phosphoglucosamine mutase  79.78 
 
 		 450 aa  735    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1713  phosphoglucosamine mutase  71.56 
 
 		 450 aa  660    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0257  phosphoglucosamine mutase  70.4 
 
 		 449 aa  627  1e-178  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497563  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1001  phosphoglucosamine mutase  57.56 
 
 		 460 aa  547  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00128114  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2635  phosphoglucosamine mutase  56.28 
 
 		 454 aa  534  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1599  phosphoglucosamine mutase  56.05 
 
 		 454 aa  533  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1805  phosphoglucosamine mutase  54.71 
 
 		 451 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2730  phosphoglucosamine mutase  54.93 
 
 		 454 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1886  phosphoglucosamine mutase  54.71 
 
 		 451 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000764387  hitchhiker  0.00000000296737 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2256  phosphoglucosamine mutase  55.03 
 
 		 453 aa  514  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2525  phosphoglucosamine mutase  54.59 
 
 		 452 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.620742  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2334  phosphoglucosamine mutase  52.76 
 
 		 469 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.877927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2456  phosphoglucosamine mutase  53.1 
 
 		 496 aa  480  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.406799  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1499  phosphoglucosamine mutase  53.83 
 
 		 458 aa  480  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2368  phosphoglucosamine mutase  53.1 
 
 		 496 aa  480  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.529976  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1205  phosphoglucosamine mutase  56.08 
 
 		 452 aa  478  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.713344  normal  0.913107 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0649  phosphoglucosamine mutase  57.01 
 
 		 447 aa  472  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.19519 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3195  phosphoglucosamine mutase  51.9 
 
 		 450 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3490  phosphoglucosamine mutase  52.13 
 
 		 450 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731606  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0360  phosphoglucosamine mutase  53.81 
 
 		 483 aa  468  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.943264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2622  phosphoglucosamine mutase  52.13 
 
 		 451 aa  468  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.412287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3604  phosphoglucosamine mutase  52.01 
 
 		 454 aa  465  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.623174  hitchhiker  0.000672034 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1863  phosphoglucosamine mutase  56.09 
 
 		 447 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1100  phosphoglucosamine mutase  52.69 
 
 		 452 aa  464  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.445304  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3629  phosphoglucosamine mutase  52.61 
 
 		 450 aa  464  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.917297  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0512  phosphoglucosamine mutase  56.55 
 
 		 447 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0817  phosphoglucosamine mutase  56.15 
 
 		 456 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0832094  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0545  phosphoglucosamine mutase  54.94 
 
 		 447 aa  459  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2566  phosphoglucosamine mutase  53.02 
 
 		 466 aa  456  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.711802  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3166  phosphoglucosamine mutase  51.02 
 
 		 465 aa  458  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4113  phosphoglucosamine mutase  53.46 
 
 		 450 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0304964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2305  phosphoglucosamine mutase  54.61 
 
 		 447 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.181279  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2131  phosphoglucosamine mutase  52.01 
 
 		 448 aa  454  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.361612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0081  phosphoglucosamine mutase  54.57 
 
 		 445 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.494438  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_002620  TC0202  phosphoglucosamine mutase  48.88 
 
 		 459 aa  451  1e-125  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1690  phosphoglucosamine mutase  50.22 
 
 		 451 aa  450  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2973  phosphoglucosamine mutase  52.76 
 
 		 448 aa  450  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1307  phosphoglucosamine mutase  52.81 
 
 		 450 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.537701  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2397  phosphoglucosamine mutase  54.02 
 
 		 447 aa  450  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.793208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4337  phosphoglucosamine mutase  54.15 
 
 		 447 aa  449  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163728  normal  0.0707849 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5306  phosphoglucosamine mutase  53.65 
 
 		 446 aa  449  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.462537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1634  phosphoglucosamine mutase  50.22 
 
 		 451 aa  450  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4838  phosphoglucosamine mutase  53.65 
 
 		 446 aa  449  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5384  phosphoglucosamine mutase  53.97 
 
 		 446 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1817  phosphoglucosamine mutase  52.76 
 
 		 449 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0481  phosphoglucosamine mutase  53.72 
 
 		 445 aa  447  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1114  phosphoglucosamine mutase  52.76 
 
 		 448 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3067  phosphoglucosamine mutase  53.4 
 
 		 446 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2913  phosphoglucosamine mutase  50.23 
 
 		 449 aa  447  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1224  phosphoglucosamine mutase  50 
 
 		 459 aa  443  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4549  phosphoglucosamine mutase  53.63 
 
 		 446 aa  444  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4597  phosphoglucosamine mutase  52.49 
 
 		 448 aa  444  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503943  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4798  phosphoglucosamine mutase  51.46 
 
 		 450 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624556  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3914  phosphoglucosamine mutase  53.02 
 
 		 450 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3635  phosphoglucosamine mutase  49.78 
 
 		 451 aa  436  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0960  phosphoglucosamine mutase  53.46 
 
 		 444 aa  436  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.381116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0835  phosphoglucosamine mutase  49.77 
 
 		 445 aa  432  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0171  phosphoglucosamine mutase  48.44 
 
 		 450 aa  434  1e-120  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0284476  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0949  phosphoglucosamine mutase  50.44 
 
 		 447 aa  434  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0777  phosphoglucosamine mutase  48.89 
 
 		 449 aa  431  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0601478 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2725  phosphoglucosamine mutase  53.09 
 
 		 447 aa  431  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.949023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2490  phosphoglucosamine mutase  50.58 
 
 		 449 aa  422  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0605  phosphoglucosamine mutase  48.99 
 
 		 451 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000599128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1022  phosphoglucosamine mutase  50.45 
 
 		 448 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00540573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1768  phosphoglucosamine mutase  50.56 
 
 		 455 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1973  phosphoglucosamine mutase  51.34 
 
 		 451 aa  418  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100286 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2840  phosphoglucosamine mutase  48.42 
 
 		 455 aa  414  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2709  phosphoglucosamine mutase  48.42 
 
 		 455 aa  413  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1438  phosphoglucosamine mutase  47.58 
 
 		 446 aa  412  1e-114  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.628979  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1504  phosphoglucosamine mutase  47.58 
 
 		 446 aa  412  1e-114  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1967  phosphoglucosamine mutase  49.77 
 
 		 446 aa  409  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000194402  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2634  phosphoglucosamine mutase  51.17 
 
 		 454 aa  409  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2260  phosphoglucosamine mutase  51.17 
 
 		 454 aa  409  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0324957  hitchhiker  0.0000000138006 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0956  phosphoglucosamine mutase  48.54 
 
 		 445 aa  411  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0280063  normal  0.292928 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0294  phosphoglucosamine mutase  46.38 
 
 		 444 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000894137  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0359  phosphoglucosamine mutase  47.86 
 
 		 452 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0705  phosphoglucosamine mutase  49.21 
 
 		 446 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0611837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0785  phosphoglucosamine mutase  48.79 
 
 		 453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1789  phosphoglucosamine mutase  44.65 
 
 		 446 aa  404  1e-111  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1204  phosphoglucosamine mutase  46.24 
 
 		 449 aa  404  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01560  phosphoglucosamine mutase  45.66 
 
 		 449 aa  403  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0983  phosphoglucosamine mutase  49 
 
 		 451 aa  403  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0995172  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1717  phosphoglucosamine mutase  46.38 
 
 		 446 aa  404  1e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.7778  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1528  phosphoglucosamine mutase  47.23 
 
 		 447 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.226614  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0409  phosphoglucosamine mutase  44.57 
 
 		 445 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3469  phosphoglucosamine mutase  49.22 
 
 		 445 aa  401  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2567  phosphoglucosamine mutase  47.22 
 
 		 451 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.474953  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2718  phosphoglucosamine mutase  48.21 
 
 		 446 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.286925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0636  phosphoglucosamine mutase  46.4 
 
 		 445 aa  400  9.999999999999999e-111  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.605562  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1573  phosphoglucosamine mutase  47.44 
 
 		 447 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126154  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0730  phosphoglucosamine mutase  48.76 
 
 		 444 aa  401  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4923  phosphoglucosamine mutase  46.98 
 
 		 447 aa  399  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106408 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1398  phosphoglucosamine mutase  46.34 
 
 		 450 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.033665 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2027  phosphoglucosamine mutase  47.89 
 
 		 447 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4495  phosphoglucosamine mutase  46.55 
 
 		 447 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.235157  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2168  phosphoglucosamine mutase  48 
 
 		 447 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1264  phosphoglucosamine mutase  46.48 
 
 		 452 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.595538 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>