More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3635 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3067  phosphoglucosamine mutase  76.64 
 
 
446 aa  678    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3635  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 
451 aa  912    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4337  phosphoglucosamine mutase  74.25 
 
 
447 aa  665    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163728  normal  0.0707849 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1817  phosphoglucosamine mutase  72.62 
 
 
449 aa  669    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5306  phosphoglucosamine mutase  75 
 
 
446 aa  671    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.462537  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2973  phosphoglucosamine mutase  70.81 
 
 
448 aa  650    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4838  phosphoglucosamine mutase  75 
 
 
446 aa  671    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530312  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1307  phosphoglucosamine mutase  71.27 
 
 
450 aa  651    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.537701  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4113  phosphoglucosamine mutase  71.27 
 
 
450 aa  657    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0304964  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4798  phosphoglucosamine mutase  71.04 
 
 
450 aa  653    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624556  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5384  phosphoglucosamine mutase  73.83 
 
 
446 aa  660    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1114  phosphoglucosamine mutase  70.22 
 
 
448 aa  650    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0777  phosphoglucosamine mutase  81.36 
 
 
449 aa  738    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0601478 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2566  phosphoglucosamine mutase  73.36 
 
 
466 aa  676    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.711802  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4549  phosphoglucosamine mutase  75.93 
 
 
446 aa  674    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3914  phosphoglucosamine mutase  70.79 
 
 
450 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1224  phosphoglucosamine mutase  66.96 
 
 
459 aa  621  1e-177  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3629  phosphoglucosamine mutase  68.56 
 
 
450 aa  623  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.917297  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3195  phosphoglucosamine mutase  67.65 
 
 
450 aa  619  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3166  phosphoglucosamine mutase  67.8 
 
 
465 aa  618  1e-176  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3490  phosphoglucosamine mutase  67.88 
 
 
450 aa  619  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731606  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_004310  BR1690  phosphoglucosamine mutase  66.08 
 
 
451 aa  617  1e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1634  phosphoglucosamine mutase  66.08 
 
 
451 aa  617  1e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2622  phosphoglucosamine mutase  66.96 
 
 
451 aa  610  1e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.412287  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2131  phosphoglucosamine mutase  66.74 
 
 
448 aa  605  9.999999999999999e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.361612  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0481  phosphoglucosamine mutase  65.02 
 
 
445 aa  572  1.0000000000000001e-162  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0171  phosphoglucosamine mutase  64.09 
 
 
450 aa  570  1e-161  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0284476  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0081  phosphoglucosamine mutase  63 
 
 
445 aa  559  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.494438  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0817  phosphoglucosamine mutase  61.8 
 
 
456 aa  560  1e-158  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0832094  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1205  phosphoglucosamine mutase  60.94 
 
 
452 aa  536  1e-151  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.713344  normal  0.913107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4597  phosphoglucosamine mutase  60.59 
 
 
448 aa  532  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503943  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0960  phosphoglucosamine mutase  61.49 
 
 
444 aa  524  1e-147  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.381116  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2490  phosphoglucosamine mutase  59.01 
 
 
449 aa  523  1e-147  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566654  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2305  phosphoglucosamine mutase  57.49 
 
 
447 aa  512  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.181279  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1100  phosphoglucosamine mutase  56.7 
 
 
452 aa  510  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.445304  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2725  phosphoglucosamine mutase  58.26 
 
 
447 aa  508  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.949023  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0545  phosphoglucosamine mutase  56.92 
 
 
447 aa  508  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0649  phosphoglucosamine mutase  57.81 
 
 
447 aa  502  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.19519 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1863  phosphoglucosamine mutase  57.14 
 
 
447 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0512  phosphoglucosamine mutase  57.14 
 
 
447 aa  491  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0360  phosphoglucosamine mutase  54.93 
 
 
483 aa  487  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.943264  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2397  phosphoglucosamine mutase  57.8 
 
 
447 aa  477  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.793208  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1001  phosphoglucosamine mutase  51.57 
 
 
460 aa  441  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00128114  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1517  phosphoglucosamine mutase  49.78 
 
 
450 aa  436  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.862212  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1599  phosphoglucosamine mutase  51.03 
 
 
454 aa  437  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2334  phosphoglucosamine mutase  50.11 
 
 
469 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.877927  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2635  phosphoglucosamine mutase  50.8 
 
 
454 aa  434  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1713  phosphoglucosamine mutase  51.24 
 
 
450 aa  432  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1805  phosphoglucosamine mutase  51.72 
 
 
451 aa  429  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1723  phosphoglucosamine mutase  48.31 
 
 
450 aa  430  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822287  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0059  phosphoglucosamine mutase  50.89 
 
 
450 aa  430  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1783  phosphoglucosamine mutase  50.22 
 
 
450 aa  429  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.363404  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1886  phosphoglucosamine mutase  51.38 
 
 
451 aa  427  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000764387  hitchhiker  0.00000000296737 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2730  phosphoglucosamine mutase  51.01 
 
 
454 aa  427  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1967  phosphoglucosamine mutase  51.61 
 
 
446 aa  426  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000194402  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2525  phosphoglucosamine mutase  52.09 
 
 
452 aa  424  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.620742  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2256  phosphoglucosamine mutase  50.58 
 
 
453 aa  422  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0956  phosphoglucosamine mutase  49.78 
 
 
445 aa  421  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0280063  normal  0.292928 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0257  phosphoglucosamine mutase  49.21 
 
 
449 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497563  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0157  phosphoglucosamine mutase  48.09 
 
 
448 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0158  phosphoglucosamine mutase  48.09 
 
 
448 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0152  phosphoglucosamine mutase  48.09 
 
 
448 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0150  phosphoglucosamine mutase  48.09 
 
 
448 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.160931  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2368  phosphoglucosamine mutase  48.45 
 
 
496 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.529976  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0157  phosphoglucosamine mutase  48.09 
 
 
448 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2456  phosphoglucosamine mutase  48.45 
 
 
496 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.406799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0180  phosphoglucosamine mutase  48.09 
 
 
448 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0201  phosphoglucosamine mutase  48.09 
 
 
448 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0154  phosphoglucosamine mutase  47.63 
 
 
449 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0150  phosphoglucosamine mutase  47.87 
 
 
448 aa  414  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.250899  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3610  phosphoglucosamine mutase  50 
 
 
445 aa  414  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00189073  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0189  phosphoglucosamine mutase  47.87 
 
 
448 aa  414  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165004  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0814  phosphoglucosamine mutase  48.98 
 
 
444 aa  412  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000566204  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1499  phosphoglucosamine mutase  48.36 
 
 
458 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0151  phosphoglucosamine mutase  47.87 
 
 
448 aa  412  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.205668  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5135  phosphoglucosamine mutase  47.87 
 
 
448 aa  414  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1847  phosphoglucosamine mutase  50.11 
 
 
447 aa  410  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.310353  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2840  phosphoglucosamine mutase  48.86 
 
 
455 aa  409  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2709  phosphoglucosamine mutase  48.86 
 
 
455 aa  409  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0158  phosphoglucosamine mutase  48.09 
 
 
448 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135407  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2260  phosphoglucosamine mutase  50.82 
 
 
454 aa  411  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0324957  hitchhiker  0.0000000138006 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2718  phosphoglucosamine mutase  48.67 
 
 
446 aa  409  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.286925  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1573  phosphoglucosamine mutase  48.54 
 
 
447 aa  409  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126154  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2634  phosphoglucosamine mutase  50.82 
 
 
454 aa  411  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3079  phosphoglucosamine mutase  49.78 
 
 
453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.7667  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4923  phosphoglucosamine mutase  50.11 
 
 
447 aa  407  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.106408 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0983  phosphoglucosamine mutase  49.33 
 
 
451 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0995172  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1807  phosphoglucosamine mutase  46.21 
 
 
446 aa  402  1e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.109286  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2567  phosphoglucosamine mutase  47.74 
 
 
451 aa  404  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.474953  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3353  phosphoglucosamine mutase  48.32 
 
 
447 aa  404  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1768  phosphoglucosamine mutase  49.56 
 
 
455 aa  404  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0531  phosphoglucosamine mutase  50.56 
 
 
445 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0782231  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3472  phosphoglucosamine mutase  50.56 
 
 
445 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000247168  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2619  phosphoglucosamine mutase  48.46 
 
 
444 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317995  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3553  phosphoglucosamine mutase  50.34 
 
 
445 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2381  phosphoglucosamine mutase  49.77 
 
 
444 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4498  phosphoglucosamine mutase  50.56 
 
 
445 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140787  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0524  phosphoglucosamine mutase  50.56 
 
 
445 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0662864  hitchhiker  0.00167255 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3661  phosphoglucosamine mutase  50.56 
 
 
445 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000185546  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3594  phosphoglucosamine mutase  50.56 
 
 
445 aa  399  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000289716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>