More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3914 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0777  phosphoglucosamine mutase  71.27 
 
 		 449 aa  657    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0601478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4838  phosphoglucosamine mutase  73.94 
 
 		 446 aa  654    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4798  phosphoglucosamine mutase  91.67 
 
 		 450 aa  824    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624556  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5384  phosphoglucosamine mutase  73.83 
 
 		 446 aa  656    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4549  phosphoglucosamine mutase  75.73 
 
 		 446 aa  679    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3067  phosphoglucosamine mutase  75.73 
 
 		 446 aa  678    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2973  phosphoglucosamine mutase  86.61 
 
 		 448 aa  795    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1817  phosphoglucosamine mutase  89.19 
 
 		 449 aa  808    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1307  phosphoglucosamine mutase  94.14 
 
 		 450 aa  846    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.537701  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4113  phosphoglucosamine mutase  89.84 
 
 		 450 aa  811    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0304964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5306  phosphoglucosamine mutase  73.94 
 
 		 446 aa  654    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.462537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2566  phosphoglucosamine mutase  76.29 
 
 		 466 aa  696    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.711802  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3914  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 		 450 aa  904    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1114  phosphoglucosamine mutase  86.83 
 
 		 448 aa  797    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4337  phosphoglucosamine mutase  76.57 
 
 		 447 aa  674    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163728  normal  0.0707849 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3635  phosphoglucosamine mutase  69.56 
 
 		 451 aa  643    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3490  phosphoglucosamine mutase  66.44 
 
 		 450 aa  621  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731606  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2131  phosphoglucosamine mutase  67.88 
 
 		 448 aa  619  1e-176  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.361612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3195  phosphoglucosamine mutase  66 
 
 		 450 aa  618  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3166  phosphoglucosamine mutase  66.44 
 
 		 465 aa  617  1e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2622  phosphoglucosamine mutase  66.08 
 
 		 451 aa  613  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.412287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1634  phosphoglucosamine mutase  64.52 
 
 		 451 aa  602  1.0000000000000001e-171  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1690  phosphoglucosamine mutase  64.52 
 
 		 451 aa  602  1.0000000000000001e-171  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1224  phosphoglucosamine mutase  64.52 
 
 		 459 aa  598  1e-170  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3629  phosphoglucosamine mutase  63.78 
 
 		 450 aa  600  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.917297  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0081  phosphoglucosamine mutase  65.55 
 
 		 445 aa  578  1e-164  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.494438  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0481  phosphoglucosamine mutase  66.22 
 
 		 445 aa  577  1.0000000000000001e-163  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0817  phosphoglucosamine mutase  65.25 
 
 		 456 aa  569  1e-161  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0832094  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0171  phosphoglucosamine mutase  62.13 
 
 		 450 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0284476  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0960  phosphoglucosamine mutase  64.64 
 
 		 444 aa  556  1e-157  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.381116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4597  phosphoglucosamine mutase  63.15 
 
 		 448 aa  553  1e-156  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503943  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1205  phosphoglucosamine mutase  61.92 
 
 		 452 aa  550  1e-155  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.713344  normal  0.913107 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1100  phosphoglucosamine mutase  61.47 
 
 		 452 aa  541  1e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.445304  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2725  phosphoglucosamine mutase  61.69 
 
 		 447 aa  526  1e-148  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.949023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2305  phosphoglucosamine mutase  59.06 
 
 		 447 aa  525  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.181279  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0649  phosphoglucosamine mutase  59.69 
 
 		 447 aa  524  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.19519 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2490  phosphoglucosamine mutase  59.68 
 
 		 449 aa  523  1e-147  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0545  phosphoglucosamine mutase  58.8 
 
 		 447 aa  516  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0512  phosphoglucosamine mutase  58.57 
 
 		 447 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1863  phosphoglucosamine mutase  58.35 
 
 		 447 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2397  phosphoglucosamine mutase  60.14 
 
 		 447 aa  494  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.793208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0360  phosphoglucosamine mutase  55.93 
 
 		 483 aa  489  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.943264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1599  phosphoglucosamine mutase  52.9 
 
 		 454 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2635  phosphoglucosamine mutase  51.79 
 
 		 454 aa  462  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1001  phosphoglucosamine mutase  52.43 
 
 		 460 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00128114  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2730  phosphoglucosamine mutase  52.22 
 
 		 454 aa  456  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1805  phosphoglucosamine mutase  51.56 
 
 		 451 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1886  phosphoglucosamine mutase  51.12 
 
 		 451 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000764387  hitchhiker  0.00000000296737 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2334  phosphoglucosamine mutase  53.3 
 
 		 469 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.877927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1783  phosphoglucosamine mutase  53.26 
 
 		 450 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.363404  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2525  phosphoglucosamine mutase  52.56 
 
 		 452 aa  449  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.620742  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2256  phosphoglucosamine mutase  51.89 
 
 		 453 aa  451  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1517  phosphoglucosamine mutase  52.76 
 
 		 450 aa  442  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.862212  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1723  phosphoglucosamine mutase  53.72 
 
 		 450 aa  442  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0257  phosphoglucosamine mutase  52.13 
 
 		 449 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497563  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1713  phosphoglucosamine mutase  53 
 
 		 450 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2368  phosphoglucosamine mutase  51.88 
 
 		 496 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.529976  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2456  phosphoglucosamine mutase  51.88 
 
 		 496 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.406799  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1499  phosphoglucosamine mutase  52.19 
 
 		 458 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2718  phosphoglucosamine mutase  51.77 
 
 		 446 aa  434  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.286925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0059  phosphoglucosamine mutase  51.46 
 
 		 450 aa  434  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2840  phosphoglucosamine mutase  51.7 
 
 		 455 aa  427  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2709  phosphoglucosamine mutase  51.7 
 
 		 455 aa  428  1e-118  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3018  phosphoglucosamine mutase  50.88 
 
 		 450 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0396425 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2888  phosphoglucosamine mutase  50.66 
 
 		 450 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1973  phosphoglucosamine mutase  53.01 
 
 		 451 aa  424  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100286 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3610  phosphoglucosamine mutase  50.78 
 
 		 445 aa  423  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00189073  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1022  phosphoglucosamine mutase  50.44 
 
 		 448 aa  424  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00540573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1333  phosphoglucosamine mutase  50.33 
 
 		 450 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.951592  hitchhiker  0.00110502 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1398  phosphoglucosamine mutase  50.11 
 
 		 450 aa  420  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.033665 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0956  phosphoglucosamine mutase  50.11 
 
 		 445 aa  421  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0280063  normal  0.292928 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1719  phosphoglucosamine mutase  51.61 
 
 		 447 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.905768 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2027  phosphoglucosamine mutase  51.38 
 
 		 447 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0814  phosphoglucosamine mutase  50.11 
 
 		 444 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000566204  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0636  phosphoglucosamine mutase  50 
 
 		 445 aa  417  9.999999999999999e-116  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.605562  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1487  phosphoglucosamine mutase  50.78 
 
 		 450 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.152305  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3483  phosphoglucosamine mutase  52.03 
 
 		 445 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0848624  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1528  phosphoglucosamine mutase  49.22 
 
 		 447 aa  415  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.226614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3483  phosphoglucosamine mutase  52.03 
 
 		 445 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3589  phosphoglucosamine mutase  52.03 
 
 		 445 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0946  phosphoglucosamine mutase  51.48 
 
 		 450 aa  413  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0983  phosphoglucosamine mutase  50.44 
 
 		 451 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0995172  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0158  phosphoglucosamine mutase  46.86 
 
 		 448 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135407  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3553  phosphoglucosamine mutase  52.03 
 
 		 445 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0485  phosphoglucosamine mutase  49.89 
 
 		 463 aa  413  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.519608  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1438  phosphoglucosamine mutase  48.56 
 
 		 446 aa  414  1e-114  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.628979  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1573  phosphoglucosamine mutase  48.77 
 
 		 447 aa  414  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126154  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0730  phosphoglucosamine mutase  50.68 
 
 		 444 aa  412  1e-114  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3651  phosphoglucosamine mutase  52.03 
 
 		 445 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3469  phosphoglucosamine mutase  50.9 
 
 		 445 aa  412  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1504  phosphoglucosamine mutase  48.56 
 
 		 446 aa  414  1e-114  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0294  phosphoglucosamine mutase  48.76 
 
 		 444 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000894137  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4498  phosphoglucosamine mutase  51.8 
 
 		 445 aa  410  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0150  phosphoglucosamine mutase  46.76 
 
 		 448 aa  410  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.250899  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2634  phosphoglucosamine mutase  51.05 
 
 		 454 aa  409  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1617  phosphoglucosamine mutase  49.12 
 
 		 452 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0578  phosphoglucosamine mutase  49.12 
 
 		 452 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2013  phosphoglucosamine mutase  48.88 
 
 		 443 aa  409  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.993566  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1264  phosphoglucosamine mutase  50.22 
 
 		 452 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.595538 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1290  phosphoglucosamine mutase  49.12 
 
 		 452 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.985716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>