More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0481 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0481  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 
445 aa  895    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0081  phosphoglucosamine mutase  74.61 
 
 
445 aa  672    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.494438  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0960  phosphoglucosamine mutase  75.57 
 
 
444 aa  652    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.381116  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2566  phosphoglucosamine mutase  66.44 
 
 
466 aa  607  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.711802  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3629  phosphoglucosamine mutase  65.91 
 
 
450 aa  593  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.917297  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4113  phosphoglucosamine mutase  66.82 
 
 
450 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0304964  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1817  phosphoglucosamine mutase  67.27 
 
 
449 aa  588  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4549  phosphoglucosamine mutase  68.09 
 
 
446 aa  590  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2622  phosphoglucosamine mutase  65.11 
 
 
451 aa  587  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.412287  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3166  phosphoglucosamine mutase  65.76 
 
 
465 aa  587  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5384  phosphoglucosamine mutase  68.78 
 
 
446 aa  585  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5306  phosphoglucosamine mutase  67.76 
 
 
446 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.462537  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3490  phosphoglucosamine mutase  65.15 
 
 
450 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731606  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3067  phosphoglucosamine mutase  67.42 
 
 
446 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4838  phosphoglucosamine mutase  67.76 
 
 
446 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530312  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1307  phosphoglucosamine mutase  65.91 
 
 
450 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.537701  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3195  phosphoglucosamine mutase  64.46 
 
 
450 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2131  phosphoglucosamine mutase  65.32 
 
 
448 aa  581  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.361612  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4798  phosphoglucosamine mutase  67.04 
 
 
450 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624556  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0545  phosphoglucosamine mutase  64.88 
 
 
447 aa  582  1.0000000000000001e-165  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4597  phosphoglucosamine mutase  66.67 
 
 
448 aa  579  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503943  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_004310  BR1690  phosphoglucosamine mutase  65.69 
 
 
451 aa  577  1.0000000000000001e-163  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0777  phosphoglucosamine mutase  66 
 
 
449 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0601478 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1224  phosphoglucosamine mutase  66.14 
 
 
459 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1634  phosphoglucosamine mutase  65.69 
 
 
451 aa  577  1.0000000000000001e-163  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4337  phosphoglucosamine mutase  67.29 
 
 
447 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163728  normal  0.0707849 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3635  phosphoglucosamine mutase  65.02 
 
 
451 aa  572  1.0000000000000001e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1114  phosphoglucosamine mutase  65.24 
 
 
448 aa  571  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2973  phosphoglucosamine mutase  64.79 
 
 
448 aa  570  1e-161  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3914  phosphoglucosamine mutase  67.06 
 
 
450 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0817  phosphoglucosamine mutase  65.31 
 
 
456 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0832094  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0649  phosphoglucosamine mutase  63.31 
 
 
447 aa  559  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.19519 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1205  phosphoglucosamine mutase  63.29 
 
 
452 aa  556  1e-157  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.713344  normal  0.913107 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0512  phosphoglucosamine mutase  62.86 
 
 
447 aa  551  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1863  phosphoglucosamine mutase  62.86 
 
 
447 aa  551  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2305  phosphoglucosamine mutase  62.39 
 
 
447 aa  552  1e-156  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.181279  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2725  phosphoglucosamine mutase  62.56 
 
 
447 aa  550  1e-155  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.949023  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2397  phosphoglucosamine mutase  63.79 
 
 
447 aa  535  1e-151  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.793208  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1100  phosphoglucosamine mutase  60.71 
 
 
452 aa  535  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.445304  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2490  phosphoglucosamine mutase  60.27 
 
 
449 aa  531  1e-150  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566654  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0171  phosphoglucosamine mutase  59.77 
 
 
450 aa  526  1e-148  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0284476  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0360  phosphoglucosamine mutase  57.17 
 
 
483 aa  508  1e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.943264  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1713  phosphoglucosamine mutase  56.38 
 
 
450 aa  485  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1783  phosphoglucosamine mutase  55.48 
 
 
450 aa  478  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.363404  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1599  phosphoglucosamine mutase  53.26 
 
 
454 aa  475  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0059  phosphoglucosamine mutase  55.03 
 
 
450 aa  474  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0257  phosphoglucosamine mutase  55.06 
 
 
449 aa  472  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497563  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2334  phosphoglucosamine mutase  53.32 
 
 
469 aa  471  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.877927  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2635  phosphoglucosamine mutase  52.82 
 
 
454 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1886  phosphoglucosamine mutase  53.69 
 
 
451 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000764387  hitchhiker  0.00000000296737 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2525  phosphoglucosamine mutase  54.71 
 
 
452 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.620742  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2730  phosphoglucosamine mutase  53.69 
 
 
454 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1805  phosphoglucosamine mutase  53.48 
 
 
451 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1001  phosphoglucosamine mutase  52.67 
 
 
460 aa  468  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00128114  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0956  phosphoglucosamine mutase  53.95 
 
 
445 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0280063  normal  0.292928 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1723  phosphoglucosamine mutase  53.12 
 
 
450 aa  462  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822287  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2256  phosphoglucosamine mutase  53.24 
 
 
453 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2456  phosphoglucosamine mutase  52.77 
 
 
496 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.406799  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2368  phosphoglucosamine mutase  52.77 
 
 
496 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.529976  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1499  phosphoglucosamine mutase  52.85 
 
 
458 aa  455  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3610  phosphoglucosamine mutase  52.25 
 
 
445 aa  454  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00189073  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0983  phosphoglucosamine mutase  52.44 
 
 
451 aa  449  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0995172  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1573  phosphoglucosamine mutase  51.47 
 
 
447 aa  450  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126154  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2832  phosphoglucosamine mutase  52.38 
 
 
443 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0011182  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1517  phosphoglucosamine mutase  53.72 
 
 
450 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.862212  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03041  phosphoglucosamine mutase  53.17 
 
 
445 aa  443  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0250482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0531  phosphoglucosamine mutase  53.17 
 
 
445 aa  443  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0782231  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3661  phosphoglucosamine mutase  53.17 
 
 
445 aa  443  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000185546  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3589  phosphoglucosamine mutase  52.71 
 
 
445 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3483  phosphoglucosamine mutase  52.71 
 
 
445 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0848624  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3483  phosphoglucosamine mutase  52.71 
 
 
445 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3651  phosphoglucosamine mutase  52.71 
 
 
445 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02992  hypothetical protein  53.17 
 
 
445 aa  443  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0265797  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0524  phosphoglucosamine mutase  53.17 
 
 
445 aa  443  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0662864  hitchhiker  0.00167255 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3594  phosphoglucosamine mutase  53.17 
 
 
445 aa  443  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000289716  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3368  phosphoglucosamine mutase  53.17 
 
 
445 aa  443  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000272746  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3553  phosphoglucosamine mutase  52.71 
 
 
445 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3472  phosphoglucosamine mutase  53.17 
 
 
445 aa  443  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000247168  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4498  phosphoglucosamine mutase  52.94 
 
 
445 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140787  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3469  phosphoglucosamine mutase  52.03 
 
 
445 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1199  phosphoglucosamine mutase  52.7 
 
 
445 aa  437  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3422  phosphoglucosamine mutase  52.7 
 
 
445 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000143803  decreased coverage  0.000132803 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1123  phosphoglucosamine mutase  52.48 
 
 
445 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000138646  unclonable  0.0000000000053894 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2839  phosphoglucosamine mutase  52.48 
 
 
445 aa  437  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000184945  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3244  phosphoglucosamine mutase  52.7 
 
 
445 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000220965  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3079  phosphoglucosamine mutase  52 
 
 
453 aa  436  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.7667  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1021  phosphoglucosamine mutase  52.48 
 
 
445 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000107828  hitchhiker  0.000573147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1086  phosphoglucosamine mutase  52.48 
 
 
445 aa  437  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00718811  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1398  phosphoglucosamine mutase  50.88 
 
 
450 aa  438  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.033665 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0985  phosphoglucosamine mutase  52.58 
 
 
445 aa  436  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000240064  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3285  phosphoglucosamine mutase  52.48 
 
 
445 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526752  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1025  phosphoglucosamine mutase  52.48 
 
 
445 aa  437  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0055133  hitchhiker  0.0000634577 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1847  phosphoglucosamine mutase  51.91 
 
 
447 aa  433  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.310353  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3065  phosphoglucosamine mutase  50.9 
 
 
445 aa  434  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3394  phosphoglucosamine mutase  51.81 
 
 
443 aa  435  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000763461  hitchhiker  0.000140936 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1002  phosphoglucosamine mutase  51.7 
 
 
445 aa  431  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0206827  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0568  phosphoglucosamine mutase  51.47 
 
 
445 aa  432  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.468081  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0730  phosphoglucosamine mutase  51.58 
 
 
444 aa  433  1e-120  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1333  phosphoglucosamine mutase  50.44 
 
 
450 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.951592  hitchhiker  0.00110502 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1973  phosphoglucosamine mutase  52.13 
 
 
451 aa  434  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0100286 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>