More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5384 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1817  phosphoglucosamine mutase  75.23 
 
 		 449 aa  685    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4337  phosphoglucosamine mutase  89.01 
 
 		 447 aa  790    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163728  normal  0.0707849 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2973  phosphoglucosamine mutase  72.97 
 
 		 448 aa  674    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2131  phosphoglucosamine mutase  68.16 
 
 		 448 aa  635    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.361612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4798  phosphoglucosamine mutase  72.5 
 
 		 450 aa  665    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624556  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4549  phosphoglucosamine mutase  86.77 
 
 		 446 aa  780    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1307  phosphoglucosamine mutase  73.86 
 
 		 450 aa  676    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.537701  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4113  phosphoglucosamine mutase  73.41 
 
 		 450 aa  676    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0304964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3914  phosphoglucosamine mutase  73.83 
 
 		 450 aa  655    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1114  phosphoglucosamine mutase  73.93 
 
 		 448 aa  679    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4838  phosphoglucosamine mutase  96.19 
 
 		 446 aa  843    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0777  phosphoglucosamine mutase  73.42 
 
 		 449 aa  674    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0601478 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5384  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 		 446 aa  895    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5306  phosphoglucosamine mutase  96.19 
 
 		 446 aa  843    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.462537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2566  phosphoglucosamine mutase  75.06 
 
 		 466 aa  680    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.711802  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3067  phosphoglucosamine mutase  86.55 
 
 		 446 aa  777    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3635  phosphoglucosamine mutase  72.46 
 
 		 451 aa  671    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3166  phosphoglucosamine mutase  68.56 
 
 		 465 aa  627  1e-179  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1690  phosphoglucosamine mutase  67.49 
 
 		 451 aa  623  1e-177  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3195  phosphoglucosamine mutase  67.19 
 
 		 450 aa  622  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1634  phosphoglucosamine mutase  67.49 
 
 		 451 aa  623  1e-177  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3490  phosphoglucosamine mutase  67.19 
 
 		 450 aa  622  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731606  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1224  phosphoglucosamine mutase  67.87 
 
 		 459 aa  619  1e-176  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3629  phosphoglucosamine mutase  65.99 
 
 		 450 aa  607  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.917297  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0481  phosphoglucosamine mutase  67.87 
 
 		 445 aa  598  1e-170  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2622  phosphoglucosamine mutase  65.92 
 
 		 451 aa  598  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.412287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0817  phosphoglucosamine mutase  64.35 
 
 		 456 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0832094  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0081  phosphoglucosamine mutase  64.94 
 
 		 445 aa  574  1.0000000000000001e-162  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.494438  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1205  phosphoglucosamine mutase  64.41 
 
 		 452 aa  565  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.713344  normal  0.913107 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0171  phosphoglucosamine mutase  62.61 
 
 		 450 aa  561  1e-158  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0284476  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2305  phosphoglucosamine mutase  62.64 
 
 		 447 aa  546  1e-154  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.181279  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4597  phosphoglucosamine mutase  62.67 
 
 		 448 aa  547  1e-154  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503943  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0960  phosphoglucosamine mutase  63.68 
 
 		 444 aa  543  1e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.381116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0545  phosphoglucosamine mutase  62.42 
 
 		 447 aa  543  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1100  phosphoglucosamine mutase  60.49 
 
 		 452 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.445304  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0649  phosphoglucosamine mutase  62.42 
 
 		 447 aa  536  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.19519 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2725  phosphoglucosamine mutase  62.56 
 
 		 447 aa  528  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.949023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2490  phosphoglucosamine mutase  59.42 
 
 		 449 aa  529  1e-149  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0512  phosphoglucosamine mutase  61.07 
 
 		 447 aa  522  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1863  phosphoglucosamine mutase  60.85 
 
 		 447 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2397  phosphoglucosamine mutase  62.73 
 
 		 447 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.793208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0360  phosphoglucosamine mutase  57.4 
 
 		 483 aa  497  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.943264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2525  phosphoglucosamine mutase  53.26 
 
 		 452 aa  462  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.620742  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1001  phosphoglucosamine mutase  53.02 
 
 		 460 aa  463  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00128114  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2256  phosphoglucosamine mutase  52.13 
 
 		 453 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2334  phosphoglucosamine mutase  51.88 
 
 		 469 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.877927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0257  phosphoglucosamine mutase  53.01 
 
 		 449 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497563  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1805  phosphoglucosamine mutase  51.57 
 
 		 451 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1599  phosphoglucosamine mutase  53.12 
 
 		 454 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1886  phosphoglucosamine mutase  52.01 
 
 		 451 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000764387  hitchhiker  0.00000000296737 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2730  phosphoglucosamine mutase  52.69 
 
 		 454 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1723  phosphoglucosamine mutase  52.95 
 
 		 450 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2635  phosphoglucosamine mutase  53.12 
 
 		 454 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1783  phosphoglucosamine mutase  52.81 
 
 		 450 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.363404  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1517  phosphoglucosamine mutase  53.7 
 
 		 450 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.862212  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2456  phosphoglucosamine mutase  53.12 
 
 		 496 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.406799  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2368  phosphoglucosamine mutase  53.12 
 
 		 496 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.529976  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1713  phosphoglucosamine mutase  52.26 
 
 		 450 aa  442  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0059  phosphoglucosamine mutase  52.58 
 
 		 450 aa  444  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1499  phosphoglucosamine mutase  52.98 
 
 		 458 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3610  phosphoglucosamine mutase  50.45 
 
 		 445 aa  436  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00189073  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1573  phosphoglucosamine mutase  48.76 
 
 		 447 aa  433  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126154  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0956  phosphoglucosamine mutase  50.11 
 
 		 445 aa  429  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0280063  normal  0.292928 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1847  phosphoglucosamine mutase  52.36 
 
 		 447 aa  426  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.310353  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3483  phosphoglucosamine mutase  51.47 
 
 		 445 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3651  phosphoglucosamine mutase  51.47 
 
 		 445 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2840  phosphoglucosamine mutase  48.87 
 
 		 455 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2709  phosphoglucosamine mutase  48.87 
 
 		 455 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3553  phosphoglucosamine mutase  51.47 
 
 		 445 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4498  phosphoglucosamine mutase  51.47 
 
 		 445 aa  422  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3483  phosphoglucosamine mutase  51.47 
 
 		 445 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0848624  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3589  phosphoglucosamine mutase  51.47 
 
 		 445 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3472  phosphoglucosamine mutase  51.47 
 
 		 445 aa  422  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000247168  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03041  phosphoglucosamine mutase  51.47 
 
 		 445 aa  421  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0250482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0531  phosphoglucosamine mutase  51.47 
 
 		 445 aa  421  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0782231  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02992  hypothetical protein  51.47 
 
 		 445 aa  421  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0265797  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0524  phosphoglucosamine mutase  51.47 
 
 		 445 aa  421  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0662864  hitchhiker  0.00167255 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3594  phosphoglucosamine mutase  51.47 
 
 		 445 aa  421  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000289716  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3661  phosphoglucosamine mutase  51.47 
 
 		 445 aa  421  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000185546  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2718  phosphoglucosamine mutase  50.44 
 
 		 446 aa  421  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.286925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3368  phosphoglucosamine mutase  51.47 
 
 		 445 aa  421  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000272746  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1123  phosphoglucosamine mutase  50.9 
 
 		 445 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000138646  unclonable  0.0000000000053894 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3065  phosphoglucosamine mutase  48.42 
 
 		 445 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2832  phosphoglucosamine mutase  50.12 
 
 		 443 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0011182  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3469  phosphoglucosamine mutase  50.34 
 
 		 445 aa  418  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3394  phosphoglucosamine mutase  49.21 
 
 		 443 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000763461  hitchhiker  0.000140936 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1504  phosphoglucosamine mutase  49.11 
 
 		 446 aa  416  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3285  phosphoglucosamine mutase  50.9 
 
 		 445 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526752  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3422  phosphoglucosamine mutase  50.67 
 
 		 445 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000143803  decreased coverage  0.000132803 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2839  phosphoglucosamine mutase  50.45 
 
 		 445 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000184945  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2260  phosphoglucosamine mutase  51.53 
 
 		 454 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0324957  hitchhiker  0.0000000138006 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1738  phosphoglucosamine mutase  52.54 
 
 		 450 aa  417  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.738973  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3244  phosphoglucosamine mutase  50.67 
 
 		 445 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000220965  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1438  phosphoglucosamine mutase  49.11 
 
 		 446 aa  416  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.628979  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2634  phosphoglucosamine mutase  51.53 
 
 		 454 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1398  phosphoglucosamine mutase  48.67 
 
 		 450 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.033665 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3566  phosphoglucosamine mutase  48.76 
 
 		 445 aa  412  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0054919  hitchhiker  0.00000589779 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3350  phosphoglucosamine mutase  50.22 
 
 		 445 aa  414  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0843387  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01688  phosphoglucosamine mutase  46.76 
 
 		 447 aa  414  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000297141  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0985  phosphoglucosamine mutase  50.22 
 
 		 445 aa  414  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000240064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>