More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3604 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3604  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 
454 aa  926    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.623174  hitchhiker  0.000672034 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2334  phosphoglucosamine mutase  61.92 
 
 
469 aa  564  1e-160  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.877927  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1001  phosphoglucosamine mutase  58.61 
 
 
460 aa  547  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00128114  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2635  phosphoglucosamine mutase  60.31 
 
 
454 aa  543  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2456  phosphoglucosamine mutase  60.31 
 
 
496 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.406799  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2368  phosphoglucosamine mutase  60.31 
 
 
496 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.529976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1599  phosphoglucosamine mutase  60.86 
 
 
454 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1499  phosphoglucosamine mutase  60.44 
 
 
458 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2256  phosphoglucosamine mutase  58.39 
 
 
453 aa  535  1e-151  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2525  phosphoglucosamine mutase  58.5 
 
 
452 aa  533  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.620742  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1886  phosphoglucosamine mutase  60.54 
 
 
451 aa  531  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000764387  hitchhiker  0.00000000296737 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2730  phosphoglucosamine mutase  59.87 
 
 
454 aa  527  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1805  phosphoglucosamine mutase  60.09 
 
 
451 aa  524  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1783  phosphoglucosamine mutase  53.9 
 
 
450 aa  490  1e-137  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.363404  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0059  phosphoglucosamine mutase  53.9 
 
 
450 aa  486  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1713  phosphoglucosamine mutase  54.73 
 
 
450 aa  472  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1723  phosphoglucosamine mutase  52.44 
 
 
450 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822287  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0257  phosphoglucosamine mutase  53.74 
 
 
449 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497563  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1517  phosphoglucosamine mutase  52.01 
 
 
450 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.862212  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0360  phosphoglucosamine mutase  54.07 
 
 
483 aa  462  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.943264  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2131  phosphoglucosamine mutase  53.24 
 
 
448 aa  448  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.361612  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1205  phosphoglucosamine mutase  51.33 
 
 
452 aa  445  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.713344  normal  0.913107 
 
 
-
 
NC_002620  TC0202  phosphoglucosamine mutase  50.8 
 
 
459 aa  444  1e-123  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1100  phosphoglucosamine mutase  53.69 
 
 
452 aa  444  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.445304  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1863  phosphoglucosamine mutase  51.24 
 
 
447 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0512  phosphoglucosamine mutase  51.24 
 
 
447 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0649  phosphoglucosamine mutase  51.02 
 
 
447 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.19519 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2622  phosphoglucosamine mutase  50.56 
 
 
451 aa  432  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.412287  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2397  phosphoglucosamine mutase  53.81 
 
 
447 aa  431  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.793208  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3490  phosphoglucosamine mutase  50.11 
 
 
450 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731606  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3195  phosphoglucosamine mutase  50.56 
 
 
450 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2913  phosphoglucosamine mutase  49.77 
 
 
449 aa  429  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0545  phosphoglucosamine mutase  51.02 
 
 
447 aa  426  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2566  phosphoglucosamine mutase  51.87 
 
 
466 aa  424  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.711802  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0481  phosphoglucosamine mutase  50.68 
 
 
445 aa  423  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1333  phosphoglucosamine mutase  50 
 
 
450 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.951592  hitchhiker  0.00110502 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1398  phosphoglucosamine mutase  49.78 
 
 
450 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.033665 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1224  phosphoglucosamine mutase  50.11 
 
 
459 aa  422  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4597  phosphoglucosamine mutase  50.11 
 
 
448 aa  421  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503943  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3079  phosphoglucosamine mutase  50.33 
 
 
453 aa  418  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.7667  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0817  phosphoglucosamine mutase  51.81 
 
 
456 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0832094  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1690  phosphoglucosamine mutase  48.75 
 
 
451 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1634  phosphoglucosamine mutase  48.75 
 
 
451 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3018  phosphoglucosamine mutase  49.55 
 
 
450 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0396425 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0785  phosphoglucosamine mutase  50.56 
 
 
453 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1973  phosphoglucosamine mutase  49.56 
 
 
451 aa  418  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0100286 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1847  phosphoglucosamine mutase  49.33 
 
 
447 aa  413  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.310353  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1487  phosphoglucosamine mutase  49.55 
 
 
450 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.152305  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0946  phosphoglucosamine mutase  49.01 
 
 
450 aa  412  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2888  phosphoglucosamine mutase  49.66 
 
 
450 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2567  phosphoglucosamine mutase  47.56 
 
 
451 aa  414  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.474953  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1967  phosphoglucosamine mutase  49.89 
 
 
446 aa  413  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000194402  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2305  phosphoglucosamine mutase  51.29 
 
 
447 aa  414  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.181279  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2243  phosphoglucosamine mutase  49.21 
 
 
452 aa  412  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.6083  normal  0.124274 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2027  phosphoglucosamine mutase  49.33 
 
 
447 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1528  phosphoglucosamine mutase  49.22 
 
 
447 aa  410  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.226614  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0835  phosphoglucosamine mutase  49.77 
 
 
445 aa  410  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1573  phosphoglucosamine mutase  48.42 
 
 
447 aa  408  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126154  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3166  phosphoglucosamine mutase  48.75 
 
 
465 aa  409  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0081  phosphoglucosamine mutase  50.23 
 
 
445 aa  409  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.494438  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2490  phosphoglucosamine mutase  51.29 
 
 
449 aa  410  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566654  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1719  phosphoglucosamine mutase  49.33 
 
 
447 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.905768 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1807  phosphoglucosamine mutase  47.33 
 
 
446 aa  409  1e-113  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.109286  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1307  phosphoglucosamine mutase  48.78 
 
 
450 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.537701  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4113  phosphoglucosamine mutase  48.99 
 
 
450 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0304964  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2609  phosphoglucosamine mutase  48.31 
 
 
443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0983  phosphoglucosamine mutase  49.13 
 
 
451 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0995172  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0158  phosphoglucosamine mutase  47.09 
 
 
448 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135407  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0956  phosphoglucosamine mutase  48.99 
 
 
445 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0280063  normal  0.292928 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2634  phosphoglucosamine mutase  50.82 
 
 
454 aa  404  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3449  phosphoglucosamine mutase  48.99 
 
 
445 aa  403  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2260  phosphoglucosamine mutase  50.82 
 
 
454 aa  404  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0324957  hitchhiker  0.0000000138006 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3914  phosphoglucosamine mutase  51.15 
 
 
450 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1768  phosphoglucosamine mutase  48.34 
 
 
455 aa  403  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3629  phosphoglucosamine mutase  48.85 
 
 
450 aa  404  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.917297  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2822  phosphoglucosamine mutase  48.77 
 
 
450 aa  404  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4716  phosphoglucosamine mutase  47.56 
 
 
446 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1199  phosphoglucosamine mutase  49.66 
 
 
445 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3065  phosphoglucosamine mutase  48.31 
 
 
445 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1817  phosphoglucosamine mutase  48.56 
 
 
449 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2013  phosphoglucosamine mutase  47.98 
 
 
443 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.993566  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2850  phosphoglucosamine mutase  48.31 
 
 
443 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.45347 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5469  phosphoglucosamine mutase  48.11 
 
 
445 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1438  phosphoglucosamine mutase  45.64 
 
 
446 aa  401  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.628979  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1504  phosphoglucosamine mutase  45.64 
 
 
446 aa  400  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4582  phosphoglucosamine mutase  47.56 
 
 
446 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.922342  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1086  phosphoglucosamine mutase  49.89 
 
 
445 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00718811  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0716  phosphoglucosamine mutase  47.56 
 
 
446 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.149315 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1025  phosphoglucosamine mutase  50.11 
 
 
445 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0055133  hitchhiker  0.0000634577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4549  phosphoglucosamine mutase  50.82 
 
 
446 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3566  phosphoglucosamine mutase  48.99 
 
 
445 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0054919  hitchhiker  0.00000589779 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2839  phosphoglucosamine mutase  49.1 
 
 
445 aa  396  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000184945  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4495  phosphoglucosamine mutase  45.35 
 
 
447 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.235157  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5306  phosphoglucosamine mutase  50 
 
 
446 aa  398  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.462537  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3610  phosphoglucosamine mutase  47.76 
 
 
445 aa  396  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00189073  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2725  phosphoglucosamine mutase  50.11 
 
 
447 aa  398  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.949023  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3635  phosphoglucosamine mutase  47.43 
 
 
451 aa  395  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2832  phosphoglucosamine mutase  48.75 
 
 
443 aa  395  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0011182  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4337  phosphoglucosamine mutase  49.19 
 
 
447 aa  397  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163728  normal  0.0707849 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0171  phosphoglucosamine mutase  47.66 
 
 
450 aa  396  1e-109  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0284476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>