More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6563 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6563  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 
444 aa  858    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13365  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04460  phosphoglucosamine mutase  75.4 
 
 
444 aa  594  1e-169  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.340959 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4947  phosphoglucosamine mutase  66.82 
 
 
445 aa  569  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0784803  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3862  phosphoglucosamine mutase  69.61 
 
 
451 aa  566  1e-160  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0924  phosphoglucosamine mutase  68.17 
 
 
439 aa  563  1.0000000000000001e-159  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4252  phosphoglucosamine mutase  69.61 
 
 
451 aa  558  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0742492  normal  0.0187767 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1687  phosphoglucosamine mutase  66.67 
 
 
447 aa  551  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1472  phosphoglucosamine mutase  67.42 
 
 
445 aa  549  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0996099  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0973  phosphoglucosamine mutase  64.33 
 
 
447 aa  544  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0440805 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2612  phosphoglucosamine mutase  66.67 
 
 
449 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4466  phosphoglucosamine mutase  67.71 
 
 
447 aa  540  9.999999999999999e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13478  phosphoglucosamine mutase  66.82 
 
 
448 aa  536  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0118272  hitchhiker  0.000211923 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1134  phosphoglucosamine mutase  67.64 
 
 
466 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1161  phosphoglucosamine mutase  67.64 
 
 
466 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1151  phosphoglucosamine mutase  67.64 
 
 
466 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.911038 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4282  phosphoglucosamine mutase  65.61 
 
 
446 aa  526  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2916  phosphoglucosamine mutase  63.66 
 
 
452 aa  525  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0722  phosphoglucosamine mutase  64.06 
 
 
454 aa  522  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0601  phosphoglucosamine mutase  63.78 
 
 
451 aa  520  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.260261  normal  0.720834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1127  Phosphoglucosamine mutase  62.64 
 
 
451 aa  519  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0871  phosphoglucosamine mutase  66.37 
 
 
444 aa  515  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0343  phosphoglucosamine mutase  65.68 
 
 
461 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.241522  normal  0.0301144 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0891  phosphoglucosamine mutase  62.75 
 
 
448 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2625  phosphoglucosamine mutase  63.43 
 
 
453 aa  509  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.629933 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5160  phosphoglucosamine mutase  64.25 
 
 
445 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.24824 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0616  phosphoglucosamine mutase  64.21 
 
 
455 aa  506  9.999999999999999e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.508325 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1178  phosphoglucosamine mutase  63.28 
 
 
463 aa  507  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.623682 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16830  phosphoglucosamine mutase  63.27 
 
 
448 aa  501  1e-141  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23210  phosphoglucosamine mutase  60.63 
 
 
448 aa  492  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0474709  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2611  phosphoglucosamine mutase  65.46 
 
 
448 aa  491  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20510  phosphoglucosamine mutase  59.65 
 
 
462 aa  486  1e-136  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131347  normal  0.723855 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29340  phosphoglucosamine mutase  60.18 
 
 
452 aa  472  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.313893  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3104  phosphoglucosamine mutase  61.43 
 
 
452 aa  469  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0663  phosphoglucosamine mutase  59.6 
 
 
454 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.183799  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0945  phosphoglucosamine mutase  54.17 
 
 
461 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0835  phosphoglucosamine mutase  53.36 
 
 
445 aa  450  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1148  phosphoglucosamine mutase  53.53 
 
 
470 aa  445  1.0000000000000001e-124  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6016  phosphoglucosamine mutase  60.04 
 
 
467 aa  441  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0619  phosphoglucosamine mutase  59.73 
 
 
450 aa  435  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0294  phosphoglucosamine mutase  51.57 
 
 
444 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000894137  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0158  phosphoglucosamine mutase  48.99 
 
 
448 aa  428  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0152  phosphoglucosamine mutase  48.99 
 
 
448 aa  428  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0150  phosphoglucosamine mutase  48.99 
 
 
448 aa  428  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.160931  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2670  phosphoglucosamine mutase  52.57 
 
 
446 aa  430  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5135  phosphoglucosamine mutase  48.99 
 
 
448 aa  428  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0189  phosphoglucosamine mutase  48.99 
 
 
448 aa  428  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165004  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0157  phosphoglucosamine mutase  48.99 
 
 
448 aa  428  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0180  phosphoglucosamine mutase  48.99 
 
 
448 aa  428  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0359  phosphoglucosamine mutase  52.91 
 
 
452 aa  431  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1163  phosphoglucosamine mutase  49.21 
 
 
449 aa  431  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0201  phosphoglucosamine mutase  48.99 
 
 
448 aa  428  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2231  phosphoglucosamine mutase  49.1 
 
 
451 aa  425  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.450292  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0157  phosphoglucosamine mutase  48.99 
 
 
448 aa  428  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0151  phosphoglucosamine mutase  48.99 
 
 
448 aa  428  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.205668  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2193  phosphoglucosamine mutase  49.1 
 
 
451 aa  425  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.516388  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0150  phosphoglucosamine mutase  48.99 
 
 
448 aa  427  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.250899  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2324  phosphoglucosamine mutase  49.11 
 
 
449 aa  426  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.4434  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0605  phosphoglucosamine mutase  52.47 
 
 
451 aa  428  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000599128  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2100  hypothetical protein  50.34 
 
 
450 aa  425  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000873821  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1001  phosphoglucosamine mutase  52.47 
 
 
460 aa  424  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00128114  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1762  phosphoglucosamine mutase  49.66 
 
 
451 aa  419  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0409  phosphoglucosamine mutase  49.66 
 
 
451 aa  418  1e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000346871  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0949  phosphoglucosamine mutase  48.42 
 
 
447 aa  418  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1204  phosphoglucosamine mutase  48.77 
 
 
449 aa  420  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2246  phosphoglucosamine mutase  52.24 
 
 
444 aa  420  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000153354  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0158  phosphoglucosamine mutase  49.66 
 
 
448 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135407  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0154  phosphoglucosamine mutase  49.32 
 
 
449 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2635  phosphoglucosamine mutase  48.89 
 
 
454 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2256  phosphoglucosamine mutase  49.77 
 
 
453 aa  409  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2324  phosphoglucosamine mutase  49.44 
 
 
448 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1286  phosphoglucosamine mutase  48.05 
 
 
451 aa  407  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0527928  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1566  phosphoglucosamine mutase  47.86 
 
 
455 aa  405  1.0000000000000001e-112  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1805  phosphoglucosamine mutase  48.88 
 
 
451 aa  402  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2730  phosphoglucosamine mutase  49.1 
 
 
454 aa  402  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2525  phosphoglucosamine mutase  49.44 
 
 
452 aa  403  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.620742  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2638  phosphoglucosamine mutase  48.99 
 
 
448 aa  405  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1599  phosphoglucosamine mutase  49.1 
 
 
454 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1886  phosphoglucosamine mutase  48.88 
 
 
451 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000764387  hitchhiker  0.00000000296737 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0242  phosphoglucosamine mutase  47.29 
 
 
442 aa  395  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0887  phosphoglucosamine mutase  47.87 
 
 
450 aa  397  1e-109  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00143709  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0717  phosphoglucosamine mutase  51.23 
 
 
444 aa  389  1e-107  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0230  phosphoglucosamine mutase  49.1 
 
 
459 aa  390  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.116009  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03830  phosphoglucosamine mutase  47.66 
 
 
447 aa  386  1e-106  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.140538 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01560  phosphoglucosamine mutase  45.05 
 
 
449 aa  386  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1783  phosphoglucosamine mutase  48.31 
 
 
450 aa  382  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.363404  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2888  phosphoglucosamine mutase  46.44 
 
 
450 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3018  phosphoglucosamine mutase  46.67 
 
 
450 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0396425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1398  phosphoglucosamine mutase  46.77 
 
 
450 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.033665 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0191  phosphoglucosamine mutase  43.24 
 
 
453 aa  377  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.13045  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1517  phosphoglucosamine mutase  48.48 
 
 
450 aa  373  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.862212  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21950  phosphoglucosamine mutase  47.58 
 
 
450 aa  374  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.292895  hitchhiker  0.00779909 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1487  phosphoglucosamine mutase  46.67 
 
 
450 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.152305  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0375  phosphoglucosamine mutase  44.09 
 
 
448 aa  373  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2822  phosphoglucosamine mutase  45.9 
 
 
450 aa  374  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0479  phosphoglucosamine mutase  45.09 
 
 
452 aa  373  1e-102  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2913  phosphoglucosamine mutase  43.97 
 
 
449 aa  372  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0257  phosphoglucosamine mutase  47.1 
 
 
449 aa  370  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497563  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1713  phosphoglucosamine mutase  47.75 
 
 
450 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3604  phosphoglucosamine mutase  47.06 
 
 
454 aa  369  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.623174  hitchhiker  0.000672034 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1230  phosphoglucosamine mutase  48.1 
 
 
450 aa  369  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0513327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>