More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1148 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0945  phosphoglucosamine mutase  81.91 
 
 		 461 aa  783    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1148  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 		 470 aa  954    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0663  phosphoglucosamine mutase  60.21 
 
 		 454 aa  537  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.183799  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2611  phosphoglucosamine mutase  58.3 
 
 		 448 aa  489  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3104  phosphoglucosamine mutase  56.81 
 
 		 452 aa  474  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29340  phosphoglucosamine mutase  56.6 
 
 		 452 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.313893  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0601  phosphoglucosamine mutase  56.13 
 
 		 451 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.260261  normal  0.720834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1127  Phosphoglucosamine mutase  53.65 
 
 		 451 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23210  phosphoglucosamine mutase  54.26 
 
 		 448 aa  464  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0474709  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5160  phosphoglucosamine mutase  54.53 
 
 		 445 aa  457  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.24824 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4282  phosphoglucosamine mutase  55.17 
 
 		 446 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0619  phosphoglucosamine mutase  55.39 
 
 		 450 aa  449  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2612  phosphoglucosamine mutase  53.4 
 
 		 449 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2916  phosphoglucosamine mutase  53.63 
 
 		 452 aa  448  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0891  phosphoglucosamine mutase  53.83 
 
 		 448 aa  442  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20510  phosphoglucosamine mutase  52.64 
 
 		 462 aa  440  9.999999999999999e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131347  normal  0.723855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0973  phosphoglucosamine mutase  52.8 
 
 		 447 aa  441  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0440805 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6563  phosphoglucosamine mutase  53.53 
 
 		 444 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13365  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0343  phosphoglucosamine mutase  53.19 
 
 		 461 aa  435  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.241522  normal  0.0301144 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16830  phosphoglucosamine mutase  54.37 
 
 		 448 aa  433  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2625  phosphoglucosamine mutase  53.4 
 
 		 453 aa  433  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.629933 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04460  phosphoglucosamine mutase  53.1 
 
 		 444 aa  425  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.340959 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0722  phosphoglucosamine mutase  51.48 
 
 		 454 aa  424  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4947  phosphoglucosamine mutase  50.75 
 
 		 445 aa  419  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0784803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1687  phosphoglucosamine mutase  51.08 
 
 		 447 aa  416  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4252  phosphoglucosamine mutase  50.96 
 
 		 451 aa  412  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0742492  normal  0.0187767 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3862  phosphoglucosamine mutase  50.32 
 
 		 451 aa  414  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0835  phosphoglucosamine mutase  49.36 
 
 		 445 aa  412  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0924  phosphoglucosamine mutase  49.89 
 
 		 439 aa  412  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0949  phosphoglucosamine mutase  47.22 
 
 		 447 aa  409  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0359  phosphoglucosamine mutase  48.83 
 
 		 452 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4466  phosphoglucosamine mutase  50.11 
 
 		 447 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13478  phosphoglucosamine mutase  50.21 
 
 		 448 aa  402  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0118272  hitchhiker  0.000211923 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0605  phosphoglucosamine mutase  48.18 
 
 		 451 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000599128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2670  phosphoglucosamine mutase  48.18 
 
 		 446 aa  401  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2324  phosphoglucosamine mutase  46.2 
 
 		 449 aa  397  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.4434  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0158  phosphoglucosamine mutase  46.5 
 
 		 448 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135407  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0616  phosphoglucosamine mutase  51.18 
 
 		 455 aa  397  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.508325 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0154  phosphoglucosamine mutase  47.32 
 
 		 449 aa  398  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2193  phosphoglucosamine mutase  46.12 
 
 		 451 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.516388  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2231  phosphoglucosamine mutase  46.12 
 
 		 451 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.450292  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1472  phosphoglucosamine mutase  49.46 
 
 		 445 aa  397  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0996099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1163  phosphoglucosamine mutase  47.37 
 
 		 449 aa  397  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0294  phosphoglucosamine mutase  46.9 
 
 		 444 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000894137  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1161  phosphoglucosamine mutase  52.36 
 
 		 466 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1134  phosphoglucosamine mutase  52.36 
 
 		 466 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2638  phosphoglucosamine mutase  48.3 
 
 		 448 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1151  phosphoglucosamine mutase  52.36 
 
 		 466 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.911038 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1762  phosphoglucosamine mutase  45.7 
 
 		 451 aa  391  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0157  phosphoglucosamine mutase  45.4 
 
 		 448 aa  389  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0158  phosphoglucosamine mutase  45.4 
 
 		 448 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0152  phosphoglucosamine mutase  45.4 
 
 		 448 aa  390  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0150  phosphoglucosamine mutase  45.4 
 
 		 448 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.160931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0180  phosphoglucosamine mutase  45.4 
 
 		 448 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0201  phosphoglucosamine mutase  45.4 
 
 		 448 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0242  phosphoglucosamine mutase  45.69 
 
 		 442 aa  391  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0157  phosphoglucosamine mutase  45.4 
 
 		 448 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1178  phosphoglucosamine mutase  51.38 
 
 		 463 aa  390  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.623682 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2246  phosphoglucosamine mutase  49.14 
 
 		 444 aa  389  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000153354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2324  phosphoglucosamine mutase  48.09 
 
 		 448 aa  391  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0189  phosphoglucosamine mutase  45.18 
 
 		 448 aa  386  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165004  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0150  phosphoglucosamine mutase  45.4 
 
 		 448 aa  387  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.250899  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0871  phosphoglucosamine mutase  49.89 
 
 		 444 aa  388  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5135  phosphoglucosamine mutase  45.18 
 
 		 448 aa  386  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0151  phosphoglucosamine mutase  45.18 
 
 		 448 aa  383  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.205668  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0230  phosphoglucosamine mutase  46.47 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.116009  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1204  phosphoglucosamine mutase  46.07 
 
 		 449 aa  383  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01560  phosphoglucosamine mutase  44.8 
 
 		 449 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2100  hypothetical protein  45.82 
 
 		 450 aa  374  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000873821  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1286  phosphoglucosamine mutase  43.91 
 
 		 451 aa  373  1e-102  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0527928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0409  phosphoglucosamine mutase  44.99 
 
 		 451 aa  370  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000346871  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0479  phosphoglucosamine mutase  44.89 
 
 		 452 aa  366  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1566  phosphoglucosamine mutase  43.99 
 
 		 455 aa  363  5.0000000000000005e-99  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1001  phosphoglucosamine mutase  44.3 
 
 		 460 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00128114  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0191  phosphoglucosamine mutase  42.37 
 
 		 453 aa  360  2e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.13045  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03830  phosphoglucosamine mutase  45.09 
 
 		 447 aa  360  2e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.140538 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6016  phosphoglucosamine mutase  48.84 
 
 		 467 aa  360  4e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2635  phosphoglucosamine mutase  44.86 
 
 		 454 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1783  phosphoglucosamine mutase  45.26 
 
 		 450 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.363404  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1886  phosphoglucosamine mutase  44.89 
 
 		 451 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000764387  hitchhiker  0.00000000296737 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1599  phosphoglucosamine mutase  45.61 
 
 		 454 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0887  phosphoglucosamine mutase  44.28 
 
 		 450 aa  357  2.9999999999999997e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00143709  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0717  phosphoglucosamine mutase  48.08 
 
 		 444 aa  357  2.9999999999999997e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1805  phosphoglucosamine mutase  44.44 
 
 		 451 aa  355  1e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2730  phosphoglucosamine mutase  43.22 
 
 		 454 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2525  phosphoglucosamine mutase  44.66 
 
 		 452 aa  353  4e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.620742  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0705  phosphoglucosamine mutase  46.09 
 
 		 446 aa  352  1e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0611837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3067  phosphoglucosamine mutase  44.17 
 
 		 446 aa  350  3e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1713  phosphoglucosamine mutase  43.46 
 
 		 450 aa  349  5e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4549  phosphoglucosamine mutase  43.95 
 
 		 446 aa  349  5e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1230  phosphoglucosamine mutase  45.42 
 
 		 450 aa  349  8e-95  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0513327  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4337  phosphoglucosamine mutase  44.14 
 
 		 447 aa  348  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163728  normal  0.0707849 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0586  phosphoglucosamine mutase  41.58 
 
 		 453 aa  347  3e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2567  phosphoglucosamine mutase  43.25 
 
 		 451 aa  344  2e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.474953  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2368  phosphoglucosamine mutase  44.54 
 
 		 496 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.529976  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2456  phosphoglucosamine mutase  44.54 
 
 		 496 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.406799  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3018  phosphoglucosamine mutase  43.75 
 
 		 450 aa  344  2e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0396425 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1517  phosphoglucosamine mutase  43.74 
 
 		 450 aa  343  4e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.862212  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1398  phosphoglucosamine mutase  43.28 
 
 		 450 aa  343  4e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.033665 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1499  phosphoglucosamine mutase  44.56 
 
 		 458 aa  342  5.999999999999999e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>