More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0375 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0375  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 
448 aa  914    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1248  phosphoglucosamine mutase  60.05 
 
 
447 aa  550  1e-155  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1152  phosphoglucosamine mutase  59.46 
 
 
448 aa  541  9.999999999999999e-153  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00023632  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0151  phosphoglucosamine mutase  48.42 
 
 
448 aa  425  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.205668  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0189  phosphoglucosamine mutase  48.42 
 
 
448 aa  422  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165004  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0150  phosphoglucosamine mutase  48.42 
 
 
448 aa  423  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.250899  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0157  phosphoglucosamine mutase  48.19 
 
 
448 aa  420  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0158  phosphoglucosamine mutase  48.42 
 
 
448 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0152  phosphoglucosamine mutase  48.42 
 
 
448 aa  421  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0150  phosphoglucosamine mutase  48.42 
 
 
448 aa  421  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.160931  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0157  phosphoglucosamine mutase  48.42 
 
 
448 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0201  phosphoglucosamine mutase  48.42 
 
 
448 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0180  phosphoglucosamine mutase  48.42 
 
 
448 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5135  phosphoglucosamine mutase  48.19 
 
 
448 aa  421  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0158  phosphoglucosamine mutase  47.52 
 
 
448 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135407  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0154  phosphoglucosamine mutase  46.97 
 
 
449 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2670  phosphoglucosamine mutase  46.29 
 
 
446 aa  402  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1163  phosphoglucosamine mutase  47.2 
 
 
449 aa  402  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0887  phosphoglucosamine mutase  47.65 
 
 
450 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00143709  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2324  phosphoglucosamine mutase  48.34 
 
 
449 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.4434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2231  phosphoglucosamine mutase  46.31 
 
 
451 aa  393  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.450292  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2193  phosphoglucosamine mutase  46.31 
 
 
451 aa  393  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.516388  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0409  phosphoglucosamine mutase  44.34 
 
 
451 aa  389  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000346871  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0294  phosphoglucosamine mutase  45.77 
 
 
444 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000894137  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1286  phosphoglucosamine mutase  46.1 
 
 
451 aa  386  1e-106  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0527928  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0230  phosphoglucosamine mutase  44.8 
 
 
459 aa  383  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.116009  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0479  phosphoglucosamine mutase  46.24 
 
 
452 aa  384  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0891  phosphoglucosamine mutase  45.56 
 
 
448 aa  382  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1762  phosphoglucosamine mutase  45.19 
 
 
451 aa  379  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1230  phosphoglucosamine mutase  47.43 
 
 
450 aa  381  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0513327  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0924  phosphoglucosamine mutase  44.67 
 
 
439 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0835  phosphoglucosamine mutase  44.84 
 
 
445 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2246  phosphoglucosamine mutase  44.86 
 
 
444 aa  375  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000153354  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1687  phosphoglucosamine mutase  43.43 
 
 
447 aa  374  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1566  phosphoglucosamine mutase  42.6 
 
 
455 aa  374  1e-102  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2913  phosphoglucosamine mutase  45.21 
 
 
449 aa  375  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0605  phosphoglucosamine mutase  47.41 
 
 
451 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000599128  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4947  phosphoglucosamine mutase  43.25 
 
 
445 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0784803  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6563  phosphoglucosamine mutase  43.92 
 
 
444 aa  369  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13365  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1204  phosphoglucosamine mutase  43.92 
 
 
449 aa  366  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0616  phosphoglucosamine mutase  42.44 
 
 
455 aa  361  1e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.508325 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4282  phosphoglucosamine mutase  43.56 
 
 
446 aa  360  2e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4466  phosphoglucosamine mutase  44.39 
 
 
447 aa  360  2e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0359  phosphoglucosamine mutase  42.66 
 
 
452 aa  360  4e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0949  phosphoglucosamine mutase  44.17 
 
 
447 aa  360  4e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0191  phosphoglucosamine mutase  44.12 
 
 
453 aa  360  4e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.13045  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5160  phosphoglucosamine mutase  43.95 
 
 
445 aa  359  4e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.24824 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2324  phosphoglucosamine mutase  42.6 
 
 
448 aa  359  5e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2638  phosphoglucosamine mutase  42.6 
 
 
448 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01560  phosphoglucosamine mutase  46.95 
 
 
449 aa  356  3.9999999999999996e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04460  phosphoglucosamine mutase  44.47 
 
 
444 aa  356  3.9999999999999996e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.340959 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13478  phosphoglucosamine mutase  43.54 
 
 
448 aa  356  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0118272  hitchhiker  0.000211923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1127  Phosphoglucosamine mutase  43.02 
 
 
451 aa  355  6.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1472  phosphoglucosamine mutase  42.82 
 
 
445 aa  355  1e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0996099  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0973  phosphoglucosamine mutase  40.58 
 
 
447 aa  353  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0440805 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2100  hypothetical protein  45.56 
 
 
450 aa  353  2.9999999999999997e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000873821  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3862  phosphoglucosamine mutase  41.28 
 
 
451 aa  353  4e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0871  phosphoglucosamine mutase  45.25 
 
 
444 aa  352  5.9999999999999994e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4252  phosphoglucosamine mutase  42.08 
 
 
451 aa  350  3e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0742492  normal  0.0187767 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0586  phosphoglucosamine mutase  43.67 
 
 
453 aa  350  4e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23210  phosphoglucosamine mutase  44.44 
 
 
448 aa  349  7e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0474709  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1690  phosphoglucosamine mutase  43.46 
 
 
451 aa  347  2e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1634  phosphoglucosamine mutase  43.46 
 
 
451 aa  347  2e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1178  phosphoglucosamine mutase  42.24 
 
 
463 aa  347  2e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.623682 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2916  phosphoglucosamine mutase  41.65 
 
 
452 aa  347  3e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0601  phosphoglucosamine mutase  43.36 
 
 
451 aa  346  6e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.260261  normal  0.720834 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1224  phosphoglucosamine mutase  43.56 
 
 
459 aa  345  7e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0663  phosphoglucosamine mutase  42.29 
 
 
454 aa  345  1e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.183799  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1599  phosphoglucosamine mutase  40.94 
 
 
454 aa  344  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1161  phosphoglucosamine mutase  43.18 
 
 
466 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1134  phosphoglucosamine mutase  43.18 
 
 
466 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1151  phosphoglucosamine mutase  43.18 
 
 
466 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.911038 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2635  phosphoglucosamine mutase  40.72 
 
 
454 aa  342  9e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3490  phosphoglucosamine mutase  41.69 
 
 
450 aa  342  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731606  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0343  phosphoglucosamine mutase  42.63 
 
 
461 aa  340  2e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.241522  normal  0.0301144 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3067  phosphoglucosamine mutase  44.04 
 
 
446 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0481  phosphoglucosamine mutase  42.47 
 
 
445 aa  340  2.9999999999999998e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16830  phosphoglucosamine mutase  42.57 
 
 
448 aa  339  8e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2456  phosphoglucosamine mutase  42 
 
 
496 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.406799  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0059  phosphoglucosamine mutase  42.69 
 
 
450 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2368  phosphoglucosamine mutase  42 
 
 
496 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.529976  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2566  phosphoglucosamine mutase  43.62 
 
 
466 aa  338  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.711802  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3195  phosphoglucosamine mutase  41.23 
 
 
450 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0545  phosphoglucosamine mutase  43.62 
 
 
447 aa  336  3.9999999999999995e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4495  phosphoglucosamine mutase  42.5 
 
 
447 aa  335  7e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.235157  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3604  phosphoglucosamine mutase  41.61 
 
 
454 aa  335  7.999999999999999e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.623174  hitchhiker  0.000672034 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2131  phosphoglucosamine mutase  42.31 
 
 
448 aa  335  7.999999999999999e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.361612  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0722  phosphoglucosamine mutase  40.27 
 
 
454 aa  335  7.999999999999999e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2622  phosphoglucosamine mutase  42.31 
 
 
451 aa  335  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.412287  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2525  phosphoglucosamine mutase  40.85 
 
 
452 aa  334  2e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.620742  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2973  phosphoglucosamine mutase  43.31 
 
 
448 aa  333  3e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3104  phosphoglucosamine mutase  41.37 
 
 
452 aa  333  3e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1783  phosphoglucosamine mutase  41.88 
 
 
450 aa  333  3e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.363404  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3166  phosphoglucosamine mutase  42.37 
 
 
465 aa  333  3e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5384  phosphoglucosamine mutase  44.94 
 
 
446 aa  333  3e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4185  phosphoglucosamine mutase  41.78 
 
 
447 aa  333  5e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4549  phosphoglucosamine mutase  43.37 
 
 
446 aa  332  6e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1499  phosphoglucosamine mutase  41.81 
 
 
458 aa  332  7.000000000000001e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2625  phosphoglucosamine mutase  41.96 
 
 
453 aa  332  7.000000000000001e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.629933 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4337  phosphoglucosamine mutase  44.44 
 
 
447 aa  332  8e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163728  normal  0.0707849 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>