More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2638 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2638  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 
448 aa  910    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2324  phosphoglucosamine mutase  99.11 
 
 
448 aa  903    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1204  phosphoglucosamine mutase  61.25 
 
 
449 aa  548  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0949  phosphoglucosamine mutase  60.71 
 
 
447 aa  543  1e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1163  phosphoglucosamine mutase  60.63 
 
 
449 aa  536  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2324  phosphoglucosamine mutase  56.98 
 
 
449 aa  512  1e-144  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.4434  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0294  phosphoglucosamine mutase  56.76 
 
 
444 aa  498  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000894137  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0605  phosphoglucosamine mutase  54.73 
 
 
451 aa  478  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000599128  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0154  phosphoglucosamine mutase  54.65 
 
 
449 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0158  phosphoglucosamine mutase  53.72 
 
 
448 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135407  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0409  phosphoglucosamine mutase  52.7 
 
 
451 aa  461  9.999999999999999e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000346871  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0835  phosphoglucosamine mutase  52.48 
 
 
445 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5135  phosphoglucosamine mutase  51.68 
 
 
448 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0180  phosphoglucosamine mutase  51.68 
 
 
448 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0157  phosphoglucosamine mutase  51.68 
 
 
448 aa  456  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0158  phosphoglucosamine mutase  51.68 
 
 
448 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0152  phosphoglucosamine mutase  51.68 
 
 
448 aa  456  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0150  phosphoglucosamine mutase  51.68 
 
 
448 aa  456  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.160931  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0189  phosphoglucosamine mutase  51.68 
 
 
448 aa  457  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165004  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0157  phosphoglucosamine mutase  51.68 
 
 
448 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0150  phosphoglucosamine mutase  51.68 
 
 
448 aa  456  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.250899  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0151  phosphoglucosamine mutase  51.68 
 
 
448 aa  457  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.205668  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0201  phosphoglucosamine mutase  51.68 
 
 
448 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0887  phosphoglucosamine mutase  51.79 
 
 
450 aa  451  1.0000000000000001e-126  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00143709  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0359  phosphoglucosamine mutase  51.24 
 
 
452 aa  452  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2246  phosphoglucosamine mutase  52.93 
 
 
444 aa  449  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000153354  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2670  phosphoglucosamine mutase  50.9 
 
 
446 aa  442  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01560  phosphoglucosamine mutase  50.99 
 
 
449 aa  443  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2231  phosphoglucosamine mutase  49.33 
 
 
451 aa  439  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.450292  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2193  phosphoglucosamine mutase  49.33 
 
 
451 aa  439  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.516388  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1762  phosphoglucosamine mutase  49.45 
 
 
451 aa  436  1e-121  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0230  phosphoglucosamine mutase  53.18 
 
 
459 aa  437  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.116009  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0479  phosphoglucosamine mutase  49.45 
 
 
452 aa  429  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1230  phosphoglucosamine mutase  52.01 
 
 
450 aa  425  1e-118  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0513327  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2100  hypothetical protein  50 
 
 
450 aa  422  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000873821  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1599  phosphoglucosamine mutase  50.11 
 
 
454 aa  419  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2635  phosphoglucosamine mutase  49.89 
 
 
454 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3104  phosphoglucosamine mutase  50.66 
 
 
452 aa  414  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1127  Phosphoglucosamine mutase  48.25 
 
 
451 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1286  phosphoglucosamine mutase  49.2 
 
 
451 aa  414  1e-114  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0527928  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4282  phosphoglucosamine mutase  50.67 
 
 
446 aa  409  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1001  phosphoglucosamine mutase  49.11 
 
 
460 aa  410  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00128114  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1886  phosphoglucosamine mutase  48.89 
 
 
451 aa  409  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000764387  hitchhiker  0.00000000296737 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1566  phosphoglucosamine mutase  47.44 
 
 
455 aa  411  1e-113  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1805  phosphoglucosamine mutase  48.11 
 
 
451 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21950  phosphoglucosamine mutase  49.01 
 
 
450 aa  407  1.0000000000000001e-112  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.292895  hitchhiker  0.00779909 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2730  phosphoglucosamine mutase  48.1 
 
 
454 aa  404  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2256  phosphoglucosamine mutase  48.88 
 
 
453 aa  405  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5160  phosphoglucosamine mutase  51.68 
 
 
445 aa  401  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.24824 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0191  phosphoglucosamine mutase  47.13 
 
 
453 aa  399  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.13045  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2611  phosphoglucosamine mutase  50.78 
 
 
448 aa  399  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0601  phosphoglucosamine mutase  49.02 
 
 
451 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.260261  normal  0.720834 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0360  phosphoglucosamine mutase  48.11 
 
 
483 aa  399  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.943264  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1148  phosphoglucosamine mutase  48.3 
 
 
470 aa  400  9.999999999999999e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0891  phosphoglucosamine mutase  50.45 
 
 
448 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4466  phosphoglucosamine mutase  49.66 
 
 
447 aa  399  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0663  phosphoglucosamine mutase  50.22 
 
 
454 aa  398  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.183799  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6563  phosphoglucosamine mutase  48.99 
 
 
444 aa  395  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13365  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4947  phosphoglucosamine mutase  47.22 
 
 
445 aa  397  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0784803  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04460  phosphoglucosamine mutase  52.22 
 
 
444 aa  397  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.340959 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29340  phosphoglucosamine mutase  48.67 
 
 
452 aa  398  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.313893  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0945  phosphoglucosamine mutase  48.7 
 
 
461 aa  396  1e-109  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0722  phosphoglucosamine mutase  47.25 
 
 
454 aa  392  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2525  phosphoglucosamine mutase  47.56 
 
 
452 aa  395  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.620742  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2612  phosphoglucosamine mutase  50.34 
 
 
449 aa  389  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0242  phosphoglucosamine mutase  48.43 
 
 
442 aa  391  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0717  phosphoglucosamine mutase  48.66 
 
 
444 aa  389  1e-107  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2916  phosphoglucosamine mutase  50.66 
 
 
452 aa  388  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2913  phosphoglucosamine mutase  46.65 
 
 
449 aa  389  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3862  phosphoglucosamine mutase  48.33 
 
 
451 aa  385  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03830  phosphoglucosamine mutase  48.22 
 
 
447 aa  387  1e-106  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.140538 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23210  phosphoglucosamine mutase  49.44 
 
 
448 aa  387  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0474709  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0973  phosphoglucosamine mutase  47.77 
 
 
447 aa  383  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0440805 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2973  phosphoglucosamine mutase  46.7 
 
 
448 aa  383  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4252  phosphoglucosamine mutase  49 
 
 
451 aa  384  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0742492  normal  0.0187767 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4113  phosphoglucosamine mutase  46.7 
 
 
450 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0304964  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4798  phosphoglucosamine mutase  47.15 
 
 
450 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624556  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3490  phosphoglucosamine mutase  46.17 
 
 
450 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731606  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1472  phosphoglucosamine mutase  48.21 
 
 
445 aa  384  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0996099  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3195  phosphoglucosamine mutase  45.95 
 
 
450 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1100  phosphoglucosamine mutase  47.19 
 
 
452 aa  382  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.445304  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1307  phosphoglucosamine mutase  46.7 
 
 
450 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.537701  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3067  phosphoglucosamine mutase  47.33 
 
 
446 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4337  phosphoglucosamine mutase  46.79 
 
 
447 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163728  normal  0.0707849 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2334  phosphoglucosamine mutase  45.8 
 
 
469 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.877927  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1687  phosphoglucosamine mutase  46.99 
 
 
447 aa  380  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2566  phosphoglucosamine mutase  46.97 
 
 
466 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.711802  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4549  phosphoglucosamine mutase  47.1 
 
 
446 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1817  phosphoglucosamine mutase  45.52 
 
 
449 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5306  phosphoglucosamine mutase  47.56 
 
 
446 aa  376  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.462537  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0616  phosphoglucosamine mutase  48.23 
 
 
455 aa  376  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.508325 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1713  phosphoglucosamine mutase  45.52 
 
 
450 aa  376  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3914  phosphoglucosamine mutase  47.55 
 
 
450 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1114  phosphoglucosamine mutase  46.05 
 
 
448 aa  376  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16830  phosphoglucosamine mutase  49.66 
 
 
448 aa  376  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4838  phosphoglucosamine mutase  47.56 
 
 
446 aa  376  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530312  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0924  phosphoglucosamine mutase  46.76 
 
 
439 aa  375  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0871  phosphoglucosamine mutase  47.65 
 
 
444 aa  372  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5384  phosphoglucosamine mutase  47.22 
 
 
446 aa  372  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13478  phosphoglucosamine mutase  48.21 
 
 
448 aa  374  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0118272  hitchhiker  0.000211923 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>