More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1163 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1163  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 
449 aa  909    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1204  phosphoglucosamine mutase  73.66 
 
 
449 aa  684    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0949  phosphoglucosamine mutase  63.11 
 
 
447 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2324  phosphoglucosamine mutase  60.04 
 
 
449 aa  534  1e-150  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.4434  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2638  phosphoglucosamine mutase  60.63 
 
 
448 aa  529  1e-149  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2324  phosphoglucosamine mutase  60.63 
 
 
448 aa  526  1e-148  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0294  phosphoglucosamine mutase  59.67 
 
 
444 aa  514  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000894137  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0835  phosphoglucosamine mutase  56.4 
 
 
445 aa  495  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0605  phosphoglucosamine mutase  55.38 
 
 
451 aa  496  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000599128  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0359  phosphoglucosamine mutase  54.48 
 
 
452 aa  490  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2246  phosphoglucosamine mutase  54.38 
 
 
444 aa  469  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000153354  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2100  hypothetical protein  53.12 
 
 
450 aa  462  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000873821  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2670  phosphoglucosamine mutase  52.34 
 
 
446 aa  461  9.999999999999999e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1599  phosphoglucosamine mutase  51.99 
 
 
454 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01560  phosphoglucosamine mutase  54.19 
 
 
449 aa  459  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2635  phosphoglucosamine mutase  51.33 
 
 
454 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0158  phosphoglucosamine mutase  52.76 
 
 
448 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135407  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0154  phosphoglucosamine mutase  53.62 
 
 
449 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0180  phosphoglucosamine mutase  51.45 
 
 
448 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1762  phosphoglucosamine mutase  52.55 
 
 
451 aa  451  1e-125  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0157  phosphoglucosamine mutase  51.45 
 
 
448 aa  449  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2231  phosphoglucosamine mutase  52.11 
 
 
451 aa  449  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.450292  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0887  phosphoglucosamine mutase  51.89 
 
 
450 aa  449  1e-125  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00143709  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0158  phosphoglucosamine mutase  51.45 
 
 
448 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0152  phosphoglucosamine mutase  51.45 
 
 
448 aa  449  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0150  phosphoglucosamine mutase  51.45 
 
 
448 aa  449  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.160931  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1001  phosphoglucosamine mutase  50.67 
 
 
460 aa  449  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00128114  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0157  phosphoglucosamine mutase  51.45 
 
 
448 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0201  phosphoglucosamine mutase  51.45 
 
 
448 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2193  phosphoglucosamine mutase  52.11 
 
 
451 aa  449  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.516388  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0189  phosphoglucosamine mutase  51 
 
 
448 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165004  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5135  phosphoglucosamine mutase  51 
 
 
448 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0150  phosphoglucosamine mutase  51.22 
 
 
448 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.250899  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0151  phosphoglucosamine mutase  51 
 
 
448 aa  444  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.205668  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0479  phosphoglucosamine mutase  51.11 
 
 
452 aa  442  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2730  phosphoglucosamine mutase  49.78 
 
 
454 aa  436  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1127  Phosphoglucosamine mutase  50.99 
 
 
451 aa  437  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1886  phosphoglucosamine mutase  49.56 
 
 
451 aa  436  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000764387  hitchhiker  0.00000000296737 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4282  phosphoglucosamine mutase  51.88 
 
 
446 aa  435  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0409  phosphoglucosamine mutase  50.91 
 
 
451 aa  437  1e-121  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000346871  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0230  phosphoglucosamine mutase  50.68 
 
 
459 aa  431  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.116009  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0973  phosphoglucosamine mutase  49.78 
 
 
447 aa  433  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0440805 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2256  phosphoglucosamine mutase  49.34 
 
 
453 aa  434  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1805  phosphoglucosamine mutase  48.89 
 
 
451 aa  429  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2525  phosphoglucosamine mutase  48.68 
 
 
452 aa  429  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.620742  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0191  phosphoglucosamine mutase  48.33 
 
 
453 aa  430  1e-119  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.13045  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2913  phosphoglucosamine mutase  49.56 
 
 
449 aa  431  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1230  phosphoglucosamine mutase  51.67 
 
 
450 aa  427  1e-118  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0513327  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6563  phosphoglucosamine mutase  49.21 
 
 
444 aa  421  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13365  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5160  phosphoglucosamine mutase  51.56 
 
 
445 aa  419  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.24824 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1286  phosphoglucosamine mutase  50.8 
 
 
451 aa  419  1e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0527928  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0891  phosphoglucosamine mutase  50.55 
 
 
448 aa  419  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0601  phosphoglucosamine mutase  49.89 
 
 
451 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.260261  normal  0.720834 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3104  phosphoglucosamine mutase  50.88 
 
 
452 aa  417  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3862  phosphoglucosamine mutase  49.33 
 
 
451 aa  412  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3629  phosphoglucosamine mutase  48.76 
 
 
450 aa  413  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.917297  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1783  phosphoglucosamine mutase  46.67 
 
 
450 aa  414  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.363404  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4252  phosphoglucosamine mutase  51.87 
 
 
451 aa  412  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0742492  normal  0.0187767 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2612  phosphoglucosamine mutase  49.56 
 
 
449 aa  411  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1687  phosphoglucosamine mutase  48.66 
 
 
447 aa  411  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2566  phosphoglucosamine mutase  48.55 
 
 
466 aa  409  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.711802  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2916  phosphoglucosamine mutase  50.78 
 
 
452 aa  409  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3490  phosphoglucosamine mutase  48.54 
 
 
450 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731606  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20510  phosphoglucosamine mutase  48.82 
 
 
462 aa  405  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131347  normal  0.723855 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0242  phosphoglucosamine mutase  48.32 
 
 
442 aa  407  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1723  phosphoglucosamine mutase  46.1 
 
 
450 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822287  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1499  phosphoglucosamine mutase  48.14 
 
 
458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4549  phosphoglucosamine mutase  50.58 
 
 
446 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4113  phosphoglucosamine mutase  49.78 
 
 
450 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0304964  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3195  phosphoglucosamine mutase  48.31 
 
 
450 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03830  phosphoglucosamine mutase  47.24 
 
 
447 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.140538 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1566  phosphoglucosamine mutase  46.67 
 
 
455 aa  407  1.0000000000000001e-112  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0722  phosphoglucosamine mutase  47.7 
 
 
454 aa  407  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0717  phosphoglucosamine mutase  47.88 
 
 
444 aa  405  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4947  phosphoglucosamine mutase  46.74 
 
 
445 aa  402  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0784803  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0375  phosphoglucosamine mutase  47.2 
 
 
448 aa  402  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2334  phosphoglucosamine mutase  47.58 
 
 
469 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.877927  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0924  phosphoglucosamine mutase  47.31 
 
 
439 aa  404  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1307  phosphoglucosamine mutase  48.78 
 
 
450 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.537701  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0059  phosphoglucosamine mutase  45.11 
 
 
450 aa  404  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4838  phosphoglucosamine mutase  50.58 
 
 
446 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530312  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4798  phosphoglucosamine mutase  49 
 
 
450 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624556  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3067  phosphoglucosamine mutase  50.58 
 
 
446 aa  405  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0360  phosphoglucosamine mutase  46.43 
 
 
483 aa  404  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.943264  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5306  phosphoglucosamine mutase  50.58 
 
 
446 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.462537  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0586  phosphoglucosamine mutase  47.01 
 
 
453 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4337  phosphoglucosamine mutase  49.19 
 
 
447 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163728  normal  0.0707849 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2456  phosphoglucosamine mutase  47.69 
 
 
496 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.406799  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2622  phosphoglucosamine mutase  48.76 
 
 
451 aa  401  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.412287  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2973  phosphoglucosamine mutase  48.55 
 
 
448 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1713  phosphoglucosamine mutase  45.88 
 
 
450 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5384  phosphoglucosamine mutase  50.58 
 
 
446 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1114  phosphoglucosamine mutase  49.43 
 
 
448 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3166  phosphoglucosamine mutase  48.39 
 
 
465 aa  400  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04460  phosphoglucosamine mutase  50.82 
 
 
444 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.340959 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0343  phosphoglucosamine mutase  50.44 
 
 
461 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.241522  normal  0.0301144 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2368  phosphoglucosamine mutase  47.69 
 
 
496 aa  402  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.529976  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1224  phosphoglucosamine mutase  47.64 
 
 
459 aa  398  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0945  phosphoglucosamine mutase  48.28 
 
 
461 aa  397  1e-109  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3914  phosphoglucosamine mutase  49.3 
 
 
450 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>