More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1248 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_1248  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 
447 aa  919    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1152  phosphoglucosamine mutase  58.68 
 
 
448 aa  551  1e-156  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00023632  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0375  phosphoglucosamine mutase  60.05 
 
 
448 aa  550  1e-155  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0887  phosphoglucosamine mutase  48.48 
 
 
450 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00143709  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0158  phosphoglucosamine mutase  48.84 
 
 
448 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135407  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0154  phosphoglucosamine mutase  49.42 
 
 
449 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0150  phosphoglucosamine mutase  46.15 
 
 
448 aa  411  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.250899  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0151  phosphoglucosamine mutase  46.39 
 
 
448 aa  408  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.205668  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0157  phosphoglucosamine mutase  45.25 
 
 
448 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0158  phosphoglucosamine mutase  45.25 
 
 
448 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0152  phosphoglucosamine mutase  45.25 
 
 
448 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0150  phosphoglucosamine mutase  45.25 
 
 
448 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.160931  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0201  phosphoglucosamine mutase  45.25 
 
 
448 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0180  phosphoglucosamine mutase  45.25 
 
 
448 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5135  phosphoglucosamine mutase  45.02 
 
 
448 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0157  phosphoglucosamine mutase  45.25 
 
 
448 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0189  phosphoglucosamine mutase  45.02 
 
 
448 aa  405  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165004  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2324  phosphoglucosamine mutase  48.12 
 
 
449 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.4434  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0479  phosphoglucosamine mutase  45.84 
 
 
452 aa  399  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0409  phosphoglucosamine mutase  46.19 
 
 
451 aa  399  9.999999999999999e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000346871  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2193  phosphoglucosamine mutase  44.8 
 
 
451 aa  387  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.516388  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2231  phosphoglucosamine mutase  44.8 
 
 
451 aa  387  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.450292  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1230  phosphoglucosamine mutase  47.55 
 
 
450 aa  381  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0513327  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1762  phosphoglucosamine mutase  44.12 
 
 
451 aa  375  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0191  phosphoglucosamine mutase  46.19 
 
 
453 aa  377  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.13045  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1286  phosphoglucosamine mutase  44.93 
 
 
451 aa  375  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0527928  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1566  phosphoglucosamine mutase  44.37 
 
 
455 aa  377  1e-103  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2670  phosphoglucosamine mutase  46.61 
 
 
446 aa  378  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2246  phosphoglucosamine mutase  46.6 
 
 
444 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000153354  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0294  phosphoglucosamine mutase  45.5 
 
 
444 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000894137  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2638  phosphoglucosamine mutase  45.02 
 
 
448 aa  366  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2324  phosphoglucosamine mutase  45.7 
 
 
448 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1163  phosphoglucosamine mutase  45.28 
 
 
449 aa  365  1e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0949  phosphoglucosamine mutase  43.94 
 
 
447 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1687  phosphoglucosamine mutase  45.08 
 
 
447 aa  362  7.0000000000000005e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0835  phosphoglucosamine mutase  44.39 
 
 
445 aa  361  1e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0359  phosphoglucosamine mutase  45.48 
 
 
452 aa  357  2.9999999999999997e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2718  phosphoglucosamine mutase  42.99 
 
 
446 aa  356  3.9999999999999996e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.286925  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2100  hypothetical protein  44.83 
 
 
450 aa  350  2e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000873821  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4282  phosphoglucosamine mutase  44.7 
 
 
446 aa  350  4e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0605  phosphoglucosamine mutase  44.29 
 
 
451 aa  348  9e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000599128  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6563  phosphoglucosamine mutase  43.18 
 
 
444 aa  347  2e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13365  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1599  phosphoglucosamine mutase  45.12 
 
 
454 aa  347  3e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01560  phosphoglucosamine mutase  43.27 
 
 
449 aa  347  4e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1690  phosphoglucosamine mutase  42.34 
 
 
451 aa  346  4e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1634  phosphoglucosamine mutase  42.34 
 
 
451 aa  346  4e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1127  Phosphoglucosamine mutase  43.48 
 
 
451 aa  346  5e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0924  phosphoglucosamine mutase  44.12 
 
 
439 aa  344  2e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13478  phosphoglucosamine mutase  43.08 
 
 
448 aa  343  2e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0118272  hitchhiker  0.000211923 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2635  phosphoglucosamine mutase  44.65 
 
 
454 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1578  phosphoglucosamine mutase  43.58 
 
 
436 aa  342  5.999999999999999e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.840977  normal  0.129452 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1204  phosphoglucosamine mutase  42.82 
 
 
449 aa  342  7e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0230  phosphoglucosamine mutase  42.24 
 
 
459 aa  342  7e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.116009  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2256  phosphoglucosamine mutase  43.18 
 
 
453 aa  342  1e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3490  phosphoglucosamine mutase  43.4 
 
 
450 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731606  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1224  phosphoglucosamine mutase  42.79 
 
 
459 aa  340  4e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2525  phosphoglucosamine mutase  43.51 
 
 
452 aa  339  5e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.620742  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3195  phosphoglucosamine mutase  43.16 
 
 
450 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0973  phosphoglucosamine mutase  43.19 
 
 
447 aa  339  7e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0440805 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0601  phosphoglucosamine mutase  45.21 
 
 
451 aa  338  8e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.260261  normal  0.720834 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4947  phosphoglucosamine mutase  41.76 
 
 
445 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0784803  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4597  phosphoglucosamine mutase  41.99 
 
 
448 aa  337  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503943  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0481  phosphoglucosamine mutase  43.15 
 
 
445 aa  336  5e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0891  phosphoglucosamine mutase  44.29 
 
 
448 aa  336  5.999999999999999e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2305  phosphoglucosamine mutase  42.12 
 
 
447 aa  335  7.999999999999999e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.181279  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2913  phosphoglucosamine mutase  42.51 
 
 
449 aa  335  9e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0586  phosphoglucosamine mutase  41.12 
 
 
453 aa  335  1e-90  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1151  phosphoglucosamine mutase  44.44 
 
 
466 aa  334  2e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.911038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1161  phosphoglucosamine mutase  44.44 
 
 
466 aa  334  2e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1134  phosphoglucosamine mutase  44.44 
 
 
466 aa  334  2e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0171  phosphoglucosamine mutase  42.82 
 
 
450 aa  334  2e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0284476  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3604  phosphoglucosamine mutase  42.42 
 
 
454 aa  333  5e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.623174  hitchhiker  0.000672034 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0871  phosphoglucosamine mutase  42.66 
 
 
444 aa  332  7.000000000000001e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3629  phosphoglucosamine mutase  42.69 
 
 
450 aa  332  8e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.917297  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2730  phosphoglucosamine mutase  44.47 
 
 
454 aa  332  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0663  phosphoglucosamine mutase  43.11 
 
 
454 aa  332  1e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.183799  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16830  phosphoglucosamine mutase  43.89 
 
 
448 aa  330  2e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4113  phosphoglucosamine mutase  42.18 
 
 
450 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0304964  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2622  phosphoglucosamine mutase  42.69 
 
 
451 aa  330  3e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.412287  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0649  phosphoglucosamine mutase  41.08 
 
 
447 aa  330  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.19519 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1205  phosphoglucosamine mutase  42.19 
 
 
452 aa  330  3e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.713344  normal  0.913107 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4466  phosphoglucosamine mutase  43.46 
 
 
447 aa  329  7e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1001  phosphoglucosamine mutase  41.26 
 
 
460 aa  328  9e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00128114  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1114  phosphoglucosamine mutase  42.63 
 
 
448 aa  328  9e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0545  phosphoglucosamine mutase  41.53 
 
 
447 aa  328  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2973  phosphoglucosamine mutase  41.95 
 
 
448 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1472  phosphoglucosamine mutase  41.8 
 
 
445 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0996099  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4252  phosphoglucosamine mutase  41.63 
 
 
451 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0742492  normal  0.0187767 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1178  phosphoglucosamine mutase  42.21 
 
 
463 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.623682 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5160  phosphoglucosamine mutase  44.88 
 
 
445 aa  327  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.24824 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1817  phosphoglucosamine mutase  42.23 
 
 
449 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2456  phosphoglucosamine mutase  43.19 
 
 
496 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.406799  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2916  phosphoglucosamine mutase  43.05 
 
 
452 aa  327  4.0000000000000003e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2368  phosphoglucosamine mutase  43.19 
 
 
496 aa  326  7e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.529976  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1148  phosphoglucosamine mutase  42.55 
 
 
470 aa  325  7e-88  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03830  phosphoglucosamine mutase  42.15 
 
 
447 aa  325  8.000000000000001e-88  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.140538 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1100  phosphoglucosamine mutase  44.47 
 
 
452 aa  325  9e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.445304  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3166  phosphoglucosamine mutase  40 
 
 
465 aa  325  1e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2839  phosphoglucosamine mutase  41.69 
 
 
453 aa  324  2e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3862  phosphoglucosamine mutase  41.15 
 
 
451 aa  324  2e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>