More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1578 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1578  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 
436 aa  888    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.840977  normal  0.129452 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2223  phosphoglucosamine mutase  80.09 
 
 
441 aa  694    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.810358  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1664  phosphoglucosamine mutase  59.36 
 
 
444 aa  509  1e-143  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.194728 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0835  phosphoglucosamine mutase  51.66 
 
 
445 aa  410  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0154  phosphoglucosamine mutase  51.05 
 
 
449 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0359  phosphoglucosamine mutase  50.79 
 
 
452 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1528  phosphoglucosamine mutase  49.22 
 
 
447 aa  404  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.226614  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2027  phosphoglucosamine mutase  49.66 
 
 
447 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1719  phosphoglucosamine mutase  49.22 
 
 
447 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.905768 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0158  phosphoglucosamine mutase  50.7 
 
 
448 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135407  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0605  phosphoglucosamine mutase  49.44 
 
 
451 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000599128  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0157  phosphoglucosamine mutase  49.06 
 
 
448 aa  397  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0158  phosphoglucosamine mutase  49.06 
 
 
448 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0152  phosphoglucosamine mutase  49.06 
 
 
448 aa  397  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0150  phosphoglucosamine mutase  49.06 
 
 
448 aa  397  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.160931  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0201  phosphoglucosamine mutase  49.06 
 
 
448 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0157  phosphoglucosamine mutase  49.06 
 
 
448 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2246  phosphoglucosamine mutase  52 
 
 
444 aa  396  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000153354  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0150  phosphoglucosamine mutase  49.53 
 
 
448 aa  398  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.250899  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0180  phosphoglucosamine mutase  49.06 
 
 
448 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5135  phosphoglucosamine mutase  48.83 
 
 
448 aa  395  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1477  phosphoglucosamine mutase  49.65 
 
 
444 aa  392  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2168  phosphoglucosamine mutase  50.35 
 
 
447 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2186  phosphoglucosamine mutase  48.98 
 
 
447 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0151  phosphoglucosamine mutase  48.83 
 
 
448 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.205668  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0189  phosphoglucosamine mutase  48.83 
 
 
448 aa  394  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165004  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0191  phosphoglucosamine mutase  47.01 
 
 
453 aa  392  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.13045  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1022  phosphoglucosamine mutase  49.21 
 
 
448 aa  392  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00540573  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0949  phosphoglucosamine mutase  46.5 
 
 
447 aa  392  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2381  phosphoglucosamine mutase  49.65 
 
 
444 aa  392  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1484  phosphoglucosamine mutase  48.25 
 
 
452 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2324  phosphoglucosamine mutase  47.64 
 
 
449 aa  389  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.4434  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0779  phosphoglucosamine mutase  48.48 
 
 
452 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2840  phosphoglucosamine mutase  47.75 
 
 
455 aa  388  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1514  phosphoglucosamine mutase  48.48 
 
 
452 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149991  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0573  phosphoglucosamine mutase  48.48 
 
 
467 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0791443  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1617  phosphoglucosamine mutase  48.48 
 
 
452 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2774  phosphoglucosamine mutase  48.03 
 
 
452 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0322399  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0294  phosphoglucosamine mutase  50.83 
 
 
444 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000894137  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0578  phosphoglucosamine mutase  48.48 
 
 
452 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0785  phosphoglucosamine mutase  47.88 
 
 
453 aa  390  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4923  phosphoglucosamine mutase  49.17 
 
 
447 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.106408 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1290  phosphoglucosamine mutase  48.48 
 
 
452 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.985716  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2709  phosphoglucosamine mutase  47.75 
 
 
455 aa  388  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2567  phosphoglucosamine mutase  48.01 
 
 
451 aa  386  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.474953  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1001  phosphoglucosamine mutase  47.32 
 
 
460 aa  388  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00128114  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2021  phosphoglucosamine mutase  47.9 
 
 
451 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0409  phosphoglucosamine mutase  47.46 
 
 
451 aa  387  1e-106  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000346871  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1768  phosphoglucosamine mutase  50.82 
 
 
455 aa  387  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1967  phosphoglucosamine mutase  49.54 
 
 
446 aa  388  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000194402  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2822  phosphoglucosamine mutase  46.53 
 
 
450 aa  385  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2609  phosphoglucosamine mutase  48.94 
 
 
443 aa  385  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3449  phosphoglucosamine mutase  46.85 
 
 
445 aa  384  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0887  phosphoglucosamine mutase  49.41 
 
 
450 aa  384  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00143709  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1270  phosphoglucosamine mutase  48.17 
 
 
457 aa  383  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190809  normal  0.380438 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2670  phosphoglucosamine mutase  49.21 
 
 
446 aa  384  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4441  phosphoglucosamine mutase  47.67 
 
 
451 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0814  phosphoglucosamine mutase  47.39 
 
 
444 aa  383  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000566204  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2888  phosphoglucosamine mutase  46.76 
 
 
450 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3079  phosphoglucosamine mutase  49.77 
 
 
453 aa  384  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.7667  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2635  phosphoglucosamine mutase  47.67 
 
 
454 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2100  hypothetical protein  48.77 
 
 
450 aa  385  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000873821  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0479  phosphoglucosamine mutase  48.76 
 
 
452 aa  385  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2256  phosphoglucosamine mutase  47.2 
 
 
453 aa  385  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0881  phosphoglucosamine mutase  47.31 
 
 
452 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.389268  normal  0.0916323 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1188  phosphoglucosamine mutase  47.66 
 
 
451 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.282955 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2013  phosphoglucosamine mutase  48.94 
 
 
443 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.993566  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3018  phosphoglucosamine mutase  46.53 
 
 
450 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0396425 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1176  phosphoglucosamine mutase  47.66 
 
 
451 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873875  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62840  phosphoglucosamine mutase  48.48 
 
 
445 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1487  phosphoglucosamine mutase  46.34 
 
 
450 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.152305  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1599  phosphoglucosamine mutase  45.96 
 
 
454 aa  378  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5469  phosphoglucosamine mutase  47.05 
 
 
445 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4716  phosphoglucosamine mutase  48.95 
 
 
446 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4185  phosphoglucosamine mutase  48.3 
 
 
447 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2815  phosphoglucosamine mutase  49.17 
 
 
444 aa  378  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1886  phosphoglucosamine mutase  47.09 
 
 
451 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000764387  hitchhiker  0.00000000296737 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1264  phosphoglucosamine mutase  48.02 
 
 
452 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.595538 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2525  phosphoglucosamine mutase  47.66 
 
 
452 aa  375  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.620742  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2730  phosphoglucosamine mutase  46.41 
 
 
454 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4582  phosphoglucosamine mutase  48.95 
 
 
446 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.922342  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2860  phosphoglucosamine mutase  47.79 
 
 
452 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321505  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3353  phosphoglucosamine mutase  47.96 
 
 
447 aa  378  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1398  phosphoglucosamine mutase  47.69 
 
 
450 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.033665 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1973  phosphoglucosamine mutase  47.03 
 
 
451 aa  378  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0100286 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1566  phosphoglucosamine mutase  47.07 
 
 
455 aa  377  1e-103  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2243  phosphoglucosamine mutase  46.86 
 
 
452 aa  375  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.6083  normal  0.124274 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2619  phosphoglucosamine mutase  48.94 
 
 
444 aa  378  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317995  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0230  phosphoglucosamine mutase  50.71 
 
 
459 aa  373  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.116009  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0983  phosphoglucosamine mutase  47.78 
 
 
451 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0995172  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4495  phosphoglucosamine mutase  48.3 
 
 
447 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.235157  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2718  phosphoglucosamine mutase  45.58 
 
 
446 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.286925  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1163  phosphoglucosamine mutase  47.88 
 
 
449 aa  374  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0716  phosphoglucosamine mutase  48.95 
 
 
446 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.149315 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0956  phosphoglucosamine mutase  47.75 
 
 
445 aa  372  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0280063  normal  0.292928 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2626  phosphoglucosamine mutase  46.83 
 
 
445 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122301  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2231  phosphoglucosamine mutase  47.32 
 
 
451 aa  368  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.450292  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0636  phosphoglucosamine mutase  45.07 
 
 
445 aa  369  1e-101  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.605562  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1299  phosphoglucosamine mutase  47.66 
 
 
451 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61277  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2913  phosphoglucosamine mutase  46.96 
 
 
449 aa  368  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>