More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6016 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6016  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 
467 aa  889    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0616  phosphoglucosamine mutase  76.71 
 
 
455 aa  634  1e-180  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.508325 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0722  phosphoglucosamine mutase  60.85 
 
 
454 aa  502  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1127  Phosphoglucosamine mutase  60.22 
 
 
451 aa  497  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0973  phosphoglucosamine mutase  60.52 
 
 
447 aa  493  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0440805 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4282  phosphoglucosamine mutase  61.8 
 
 
446 aa  487  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6563  phosphoglucosamine mutase  60.26 
 
 
444 aa  483  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13365  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0601  phosphoglucosamine mutase  61.16 
 
 
451 aa  483  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.260261  normal  0.720834 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2612  phosphoglucosamine mutase  59.79 
 
 
449 aa  479  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0891  phosphoglucosamine mutase  60.94 
 
 
448 aa  480  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0924  phosphoglucosamine mutase  58.75 
 
 
439 aa  474  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4466  phosphoglucosamine mutase  62.31 
 
 
447 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0343  phosphoglucosamine mutase  60.78 
 
 
461 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.241522  normal  0.0301144 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2625  phosphoglucosamine mutase  58.37 
 
 
453 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.629933 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5160  phosphoglucosamine mutase  60.3 
 
 
445 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.24824 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2916  phosphoglucosamine mutase  56.87 
 
 
452 aa  455  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23210  phosphoglucosamine mutase  57.11 
 
 
448 aa  451  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0474709  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04460  phosphoglucosamine mutase  60.39 
 
 
444 aa  455  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.340959 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16830  phosphoglucosamine mutase  58.84 
 
 
448 aa  453  1.0000000000000001e-126  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3862  phosphoglucosamine mutase  57.91 
 
 
451 aa  451  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4252  phosphoglucosamine mutase  58.12 
 
 
451 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0742492  normal  0.0187767 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1178  phosphoglucosamine mutase  59.91 
 
 
463 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.623682 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4947  phosphoglucosamine mutase  54.41 
 
 
445 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0784803  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1687  phosphoglucosamine mutase  57.14 
 
 
447 aa  443  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2611  phosphoglucosamine mutase  58.24 
 
 
448 aa  439  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20510  phosphoglucosamine mutase  55.41 
 
 
462 aa  439  9.999999999999999e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131347  normal  0.723855 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29340  phosphoglucosamine mutase  56.44 
 
 
452 aa  428  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.313893  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1472  phosphoglucosamine mutase  54.21 
 
 
445 aa  429  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0996099  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13478  phosphoglucosamine mutase  54.91 
 
 
448 aa  424  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0118272  hitchhiker  0.000211923 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3104  phosphoglucosamine mutase  56.75 
 
 
452 aa  421  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0871  phosphoglucosamine mutase  57.14 
 
 
444 aa  421  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1161  phosphoglucosamine mutase  55.08 
 
 
466 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1134  phosphoglucosamine mutase  55.08 
 
 
466 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0945  phosphoglucosamine mutase  49.89 
 
 
461 aa  417  9.999999999999999e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1151  phosphoglucosamine mutase  55.08 
 
 
466 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.911038 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0294  phosphoglucosamine mutase  47.84 
 
 
444 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000894137  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0158  phosphoglucosamine mutase  47.01 
 
 
448 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135407  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0663  phosphoglucosamine mutase  55.22 
 
 
454 aa  413  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.183799  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0154  phosphoglucosamine mutase  47.22 
 
 
449 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1148  phosphoglucosamine mutase  49.89 
 
 
470 aa  408  1.0000000000000001e-112  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0949  phosphoglucosamine mutase  45.24 
 
 
447 aa  404  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0150  phosphoglucosamine mutase  45.81 
 
 
448 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.250899  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0619  phosphoglucosamine mutase  55.36 
 
 
450 aa  395  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0835  phosphoglucosamine mutase  47.75 
 
 
445 aa  395  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0605  phosphoglucosamine mutase  49.55 
 
 
451 aa  398  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000599128  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0157  phosphoglucosamine mutase  45.16 
 
 
448 aa  391  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0158  phosphoglucosamine mutase  45.16 
 
 
448 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0152  phosphoglucosamine mutase  45.16 
 
 
448 aa  391  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0150  phosphoglucosamine mutase  45.16 
 
 
448 aa  391  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.160931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0180  phosphoglucosamine mutase  45.16 
 
 
448 aa  391  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0151  phosphoglucosamine mutase  44.95 
 
 
448 aa  389  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.205668  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0157  phosphoglucosamine mutase  45.16 
 
 
448 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2246  phosphoglucosamine mutase  50.98 
 
 
444 aa  391  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000153354  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0189  phosphoglucosamine mutase  44.73 
 
 
448 aa  389  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165004  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0201  phosphoglucosamine mutase  45.16 
 
 
448 aa  391  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2324  phosphoglucosamine mutase  45.34 
 
 
449 aa  387  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.4434  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2193  phosphoglucosamine mutase  45.3 
 
 
451 aa  388  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.516388  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5135  phosphoglucosamine mutase  44.73 
 
 
448 aa  388  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2231  phosphoglucosamine mutase  45.3 
 
 
451 aa  388  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.450292  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0359  phosphoglucosamine mutase  49.57 
 
 
452 aa  387  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2670  phosphoglucosamine mutase  47.65 
 
 
446 aa  384  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1762  phosphoglucosamine mutase  44.87 
 
 
451 aa  380  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1163  phosphoglucosamine mutase  44.47 
 
 
449 aa  378  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0409  phosphoglucosamine mutase  44.75 
 
 
451 aa  377  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000346871  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01560  phosphoglucosamine mutase  42.22 
 
 
449 aa  378  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1204  phosphoglucosamine mutase  43.31 
 
 
449 aa  372  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1001  phosphoglucosamine mutase  45.61 
 
 
460 aa  372  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00128114  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0230  phosphoglucosamine mutase  47.53 
 
 
459 aa  373  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.116009  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2638  phosphoglucosamine mutase  46.87 
 
 
448 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2324  phosphoglucosamine mutase  46.78 
 
 
448 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1566  phosphoglucosamine mutase  44.83 
 
 
455 aa  370  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2100  hypothetical protein  43.68 
 
 
450 aa  368  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000873821  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1286  phosphoglucosamine mutase  45.25 
 
 
451 aa  364  2e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0527928  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0717  phosphoglucosamine mutase  47.75 
 
 
444 aa  364  2e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0375  phosphoglucosamine mutase  41.2 
 
 
448 aa  362  5.0000000000000005e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2256  phosphoglucosamine mutase  44.35 
 
 
453 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0242  phosphoglucosamine mutase  42.06 
 
 
442 aa  360  3e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03830  phosphoglucosamine mutase  44.35 
 
 
447 aa  358  8e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.140538 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2635  phosphoglucosamine mutase  43.74 
 
 
454 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1599  phosphoglucosamine mutase  43.95 
 
 
454 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0479  phosphoglucosamine mutase  43.8 
 
 
452 aa  355  1e-96  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2730  phosphoglucosamine mutase  43.07 
 
 
454 aa  354  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2525  phosphoglucosamine mutase  43.4 
 
 
452 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.620742  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0887  phosphoglucosamine mutase  44.8 
 
 
450 aa  353  2.9999999999999997e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00143709  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0649  phosphoglucosamine mutase  46.47 
 
 
447 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.19519 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1886  phosphoglucosamine mutase  43.07 
 
 
451 aa  350  3e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000764387  hitchhiker  0.00000000296737 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1805  phosphoglucosamine mutase  43.07 
 
 
451 aa  347  3e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1398  phosphoglucosamine mutase  43.52 
 
 
450 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.033665 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0081  phosphoglucosamine mutase  43.78 
 
 
445 aa  344  2e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.494438  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0512  phosphoglucosamine mutase  46.71 
 
 
447 aa  344  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2888  phosphoglucosamine mutase  43.43 
 
 
450 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1863  phosphoglucosamine mutase  46.71 
 
 
447 aa  343  4e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1713  phosphoglucosamine mutase  46.37 
 
 
450 aa  343  4e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0545  phosphoglucosamine mutase  46.07 
 
 
447 aa  343  4e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3018  phosphoglucosamine mutase  43.64 
 
 
450 aa  343  5e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0396425 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1205  phosphoglucosamine mutase  45.49 
 
 
452 aa  342  1e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.713344  normal  0.913107 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1333  phosphoglucosamine mutase  43.4 
 
 
450 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.951592  hitchhiker  0.00110502 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2718  phosphoglucosamine mutase  42.31 
 
 
446 aa  340  4e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.286925  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1248  phosphoglucosamine mutase  43.81 
 
 
447 aa  340  5e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3604  phosphoglucosamine mutase  42.77 
 
 
454 aa  339  7e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.623174  hitchhiker  0.000672034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>