More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_469 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0528  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  94.88 
 
 		 430 aa  846    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_469  phosphomannomutase  100 
 
 		 430 aa  885    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0504  phosphoglucosamine mutase  94.65 
 
 		 430 aa  851    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.730223  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2021  phosphoglucomutase  44.95 
 
 		 434 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.63108 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2342  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  43.61 
 
 		 433 aa  349  6e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0286234  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2852  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  46.55 
 
 		 419 aa  339  7e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0667  hypothetical protein  42.72 
 
 		 419 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0315  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  41.59 
 
 		 418 aa  319  7e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.660935 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0255  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  43.21 
 
 		 416 aa  318  1e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2228  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  41.09 
 
 		 418 aa  311  1e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0512  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  37.36 
 
 		 447 aa  298  1e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0330  phosphoglucosamine mutase  37.3 
 
 		 437 aa  290  3e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.256489  hitchhiker  0.00063167 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1582  phosphoglucosamine mutase  37.15 
 
 		 437 aa  288  1e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0060705  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0433  phosphoglucosamine mutase  37 
 
 		 452 aa  287  2e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.732829  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0400  phosphoglucosamine mutase  36.94 
 
 		 446 aa  281  1e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0282  Phosphoglucosamine mutase  37.5 
 
 		 416 aa  271  1e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1344  Phosphoglucosamine mutase  41.51 
 
 		 446 aa  268  1e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1132  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  38.99 
 
 		 437 aa  266  7e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.303022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2253  Phosphoglucosamine mutase  39.58 
 
 		 434 aa  264  2e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.329457  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3046  Phosphoglucosamine mutase  40.62 
 
 		 445 aa  265  2e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2115  phosphoglucosamine mutase  37.19 
 
 		 448 aa  263  3e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1084  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  40 
 
 		 442 aa  263  4.999999999999999e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  36.81 
 
 		 450 aa  258  2e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  36.04 
 
 		 458 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0496  Phosphoglucosamine mutase  37.97 
 
 		 480 aa  249  6e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  34.54 
 
 		 452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0714  phosphomannomutase  33.88 
 
 		 460 aa  229  5e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.079186  normal  0.0391719 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0755  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  33.11 
 
 		 456 aa  224  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0117608  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1197  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  34 
 
 		 453 aa  219  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0464554 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0852  Phosphoglucosamine mutase  33.03 
 
 		 454 aa  215  9.999999999999999e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0486  Phosphoglucosamine mutase  33.26 
 
 		 455 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0150  phosphoglucosamine mutase  31.66 
 
 		 448 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.250899  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1785  Phosphomannomutase  33.97 
 
 		 458 aa  212  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0785  alpha-phosphoglucomutase / phosphomannomutase  32.73 
 
 		 458 aa  212  1e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00879985  unclonable  0.000000000000213638 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0158  phosphoglucosamine mutase  31.21 
 
 		 448 aa  209  6e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0157  phosphoglucosamine mutase  31.29 
 
 		 448 aa  208  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0158  phosphoglucosamine mutase  31.29 
 
 		 448 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0152  phosphoglucosamine mutase  31.29 
 
 		 448 aa  208  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0150  phosphoglucosamine mutase  31.29 
 
 		 448 aa  208  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.160931  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0201  phosphoglucosamine mutase  31.29 
 
 		 448 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0157  phosphoglucosamine mutase  31.29 
 
 		 448 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0180  phosphoglucosamine mutase  31.29 
 
 		 448 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5135  phosphoglucosamine mutase  31.51 
 
 		 448 aa  207  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0189  phosphoglucosamine mutase  31.22 
 
 		 448 aa  207  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165004  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0154  phosphoglucosamine mutase  30.91 
 
 		 449 aa  206  6e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0151  phosphoglucosamine mutase  31.29 
 
 		 448 aa  203  5e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.205668  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1384  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  36.3 
 
 		 454 aa  202  7e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0084  Phosphoglucosamine mutase  31.11 
 
 		 454 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0359  phosphoglucosamine mutase  33.26 
 
 		 452 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0409  phosphoglucosamine mutase  32.65 
 
 		 451 aa  197  3e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000346871  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0224  phosphoglucosamine mutase  31.03 
 
 		 449 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2256  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  32.88 
 
 		 453 aa  196  8.000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.361439  decreased coverage  0.00522565 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1740  Phosphoglucosamine mutase  31.17 
 
 		 454 aa  194  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.533946  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4549  phosphoglucosamine mutase  33.8 
 
 		 446 aa  193  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3067  phosphoglucosamine mutase  33.41 
 
 		 446 aa  192  8e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1886  phosphoglucosamine mutase  32.21 
 
 		 451 aa  191  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000764387  hitchhiker  0.00000000296737 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4337  phosphoglucosamine mutase  34.25 
 
 		 447 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163728  normal  0.0707849 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5160  phosphoglucosamine mutase  32.31 
 
 		 445 aa  190  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.24824 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6563  phosphoglucosamine mutase  33.48 
 
 		 444 aa  190  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13365  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0949  phosphoglucosamine mutase  31.14 
 
 		 447 aa  189  7e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0835  phosphoglucosamine mutase  31.87 
 
 		 445 aa  189  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2305  phosphoglucosamine mutase  33.49 
 
 		 447 aa  189  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.181279  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0294  phosphoglucosamine mutase  29.66 
 
 		 444 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000894137  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0605  phosphoglucosamine mutase  28.85 
 
 		 451 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000599128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2154  phosphomannomutase  33.94 
 
 		 449 aa  187  4e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0083  phosphomannomutase AlgC  34.09 
 
 		 465 aa  186  7e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2668  Phosphoglucosamine mutase  29.24 
 
 		 478 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000530484  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2324  phosphoglucosamine mutase  31.88 
 
 		 449 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.4434  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0191  phosphoglucosamine mutase  29.65 
 
 		 453 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.13045  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4838  phosphoglucosamine mutase  33.26 
 
 		 446 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5306  phosphoglucosamine mutase  33.26 
 
 		 446 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.462537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2730  phosphoglucosamine mutase  32.13 
 
 		 454 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1307  phosphoglucosamine mutase  32.59 
 
 		 450 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.537701  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1566  phosphoglucosamine mutase  30.3 
 
 		 455 aa  183  4.0000000000000006e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0171  phosphoglucosamine mutase  32.79 
 
 		 450 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0284476  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5384  phosphoglucosamine mutase  32.65 
 
 		 446 aa  182  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4113  phosphoglucosamine mutase  31.63 
 
 		 450 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0304964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1163  phosphoglucosamine mutase  31.18 
 
 		 449 aa  182  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0167  phosphomannomutase  34.17 
 
 		 456 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2635  phosphoglucosamine mutase  31.82 
 
 		 454 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0160  phosphomannomutase  34.4 
 
 		 456 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0230  phosphoglucosamine mutase  32.39 
 
 		 459 aa  181  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.116009  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1188  Phosphoglucosamine mutase  29.55 
 
 		 455 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2782  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  33.56 
 
 		 463 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0223  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  29.16 
 
 		 452 aa  180  4e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00762456  normal  0.0119193 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0219  phosphomannomutase  33.86 
 
 		 465 aa  180  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0178  Phosphomannomutase  34.17 
 
 		 456 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0059  phosphoglucosamine mutase  31.49 
 
 		 450 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2525  phosphoglucosamine mutase  30.93 
 
 		 452 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.620742  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2612  phosphoglucosamine mutase  31.94 
 
 		 449 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1001  phosphoglucosamine mutase  30.31 
 
 		 460 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00128114  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3195  phosphoglucosamine mutase  30.93 
 
 		 450 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1019  phosphoglucosamine mutase  29.4 
 
 		 447 aa  180  5.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1599  phosphoglucosamine mutase  31.26 
 
 		 454 aa  179  7e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1127  Phosphoglucosamine mutase  31.99 
 
 		 451 aa  179  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3490  phosphoglucosamine mutase  30.7 
 
 		 450 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731606  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2193  phosphoglucosamine mutase  28.41 
 
 		 451 aa  178  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.516388  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1316  Phosphoglucosamine mutase  30.73 
 
 		 450 aa  179  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0601  phosphoglucosamine mutase  31.18 
 
 		 451 aa  178  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.260261  normal  0.720834 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2231  phosphoglucosamine mutase  28.41 
 
 		 451 aa  178  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.450292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>