More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1785 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1785  Phosphomannomutase  100 
 
 		 458 aa  911    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1094  phosphomannomutase  48.58 
 
 		 462 aa  434  1e-120  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.205287 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4415  Phosphomannomutase  48.04 
 
 		 467 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08836  putative phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  49.56 
 
 		 462 aa  426  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0870555  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0454  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  46.85 
 
 		 467 aa  421  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1742  Phosphomannomutase  49.46 
 
 		 464 aa  416  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4504  phosphomannomutase  48.91 
 
 		 462 aa  413  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3484  phosphomannomutase  45 
 
 		 467 aa  414  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0611643 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0388  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  44.42 
 
 		 470 aa  412  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.477012  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1847  Phosphoglucosamine mutase  47.37 
 
 		 460 aa  412  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2856  Phosphomannomutase  48.71 
 
 		 468 aa  411  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0153907  normal  0.42329 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1412  Phosphoglucosamine mutase  47.38 
 
 		 462 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.130256 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0423  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  45.82 
 
 		 478 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1760  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  47.22 
 
 		 470 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00061927  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0420  Phosphomannomutase  44.42 
 
 		 471 aa  378  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.812169  normal  0.0593829 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0386  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  45.04 
 
 		 472 aa  375  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00260149  normal  0.0316294 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0319  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  44.52 
 
 		 492 aa  372  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2668  Phosphoglucosamine mutase  42.7 
 
 		 478 aa  367  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000530484  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0016  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  42.27 
 
 		 464 aa  360  3e-98  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1316  Phosphoglucosamine mutase  45.13 
 
 		 450 aa  339  5.9999999999999996e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  37.53 
 
 		 452 aa  281  2e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  36.3 
 
 		 458 aa  278  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  36.75 
 
 		 450 aa  275  1.0000000000000001e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0496  Phosphoglucosamine mutase  38.57 
 
 		 480 aa  251  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2115  phosphoglucosamine mutase  34.31 
 
 		 448 aa  247  3e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0714  phosphomannomutase  32.9 
 
 		 460 aa  218  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.079186  normal  0.0391719 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1197  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  32.04 
 
 		 453 aa  216  9e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0464554 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0755  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  33.33 
 
 		 456 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0117608  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2021  phosphoglucomutase  32.21 
 
 		 434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.63108 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_469  phosphomannomutase  33.97 
 
 		 430 aa  212  1e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1188  Phosphoglucosamine mutase  30.92 
 
 		 455 aa  211  2e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0223  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  31.44 
 
 		 452 aa  211  3e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00762456  normal  0.0119193 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0504  phosphoglucosamine mutase  33.01 
 
 		 430 aa  211  3e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.730223  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0528  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  32.82 
 
 		 430 aa  208  2e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0486  Phosphoglucosamine mutase  33.7 
 
 		 455 aa  204  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2342  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  31.94 
 
 		 433 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0286234  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0785  alpha-phosphoglucomutase / phosphomannomutase  31.36 
 
 		 458 aa  195  1e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00879985  unclonable  0.000000000000213638 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0224  phosphoglucosamine mutase  28.76 
 
 		 449 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0512  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  28.79 
 
 		 447 aa  189  9e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5288  phosphomannomutase  31.35 
 
 		 463 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5197  phosphomannomutase  31.35 
 
 		 466 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2652  phosphomannomutase  35 
 
 		 469 aa  187  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1582  phosphoglucosamine mutase  28.81 
 
 		 437 aa  186  7e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0060705  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5338  phosphomannomutase  31.13 
 
 		 466 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00384224 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1084  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  34.72 
 
 		 442 aa  182  9.000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0183  phosphomannomutase  30.68 
 
 		 465 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12891  decreased coverage  0.0000000447524 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0084  Phosphoglucosamine mutase  32.09 
 
 		 454 aa  180  5.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0400  phosphoglucosamine mutase  28.81 
 
 		 446 aa  179  9e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0433  phosphoglucosamine mutase  30.53 
 
 		 452 aa  178  1e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.732829  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2253  Phosphoglucosamine mutase  33.99 
 
 		 434 aa  178  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.329457  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0399  phosphomannomutase  31.28 
 
 		 471 aa  177  4e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.889065  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1786  phosphoglucomutase  31.28 
 
 		 471 aa  177  5e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2720  phosphomannomutase  34.13 
 
 		 468 aa  177  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2994  phosphomannomutase  30.82 
 
 		 468 aa  176  6e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02922  phosphomannomutase  33.77 
 
 		 782 aa  176  7e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.919523  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0330  phosphoglucosamine mutase  27.38 
 
 		 437 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.256489  hitchhiker  0.00063167 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1740  Phosphoglucosamine mutase  32.03 
 
 		 454 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.533946  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2154  phosphomannomutase  32.29 
 
 		 449 aa  175  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0255  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  32.17 
 
 		 416 aa  171  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1021  phosphomannomutase  31.64 
 
 		 472 aa  171  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1993  Phosphomannomutase  34.06 
 
 		 459 aa  170  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00229621 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0315  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  32.06 
 
 		 418 aa  170  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.660935 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0667  hypothetical protein  31.24 
 
 		 419 aa  170  6e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02910  Phosphomannomutase/phosphoglucomutase AlgC  30.13 
 
 		 488 aa  169  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0219  phosphomannomutase  29.52 
 
 		 465 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1768  Phosphomannomutase  33.41 
 
 		 451 aa  168  2e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2256  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  31.39 
 
 		 453 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.361439  decreased coverage  0.00522565 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2238  phosphomannomutase  28.85 
 
 		 455 aa  167  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.119559  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0282  Phosphoglucosamine mutase  29.6 
 
 		 416 aa  167  5e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1132  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  33.91 
 
 		 437 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.303022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0286  Phosphomannomutase  33.11 
 
 		 782 aa  166  6.9999999999999995e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.132974 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6098  phosphomannomutase AlgC  30.02 
 
 		 868 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21229  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2782  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  31.54 
 
 		 463 aa  164  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3046  Phosphoglucosamine mutase  33.77 
 
 		 445 aa  164  4.0000000000000004e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0083  phosphomannomutase AlgC  29.07 
 
 		 465 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2852  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  30.66 
 
 		 419 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2673  Phosphomannomutase  32.5 
 
 		 464 aa  163  6e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00943387 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0468  Phosphomannomutase  30.41 
 
 		 462 aa  162  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.489238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70270  phosphomannomutase AlgC  28.6 
 
 		 854 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1344  Phosphoglucosamine mutase  33.93 
 
 		 446 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1688  phosphoglucosamine mutase  29.16 
 
 		 465 aa  161  2e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0067  Phosphomannomutase  27.48 
 
 		 475 aa  160  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3001  phosphomannomutase  30.93 
 
 		 460 aa  160  6e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.324631  normal  0.16456 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2845  phosphomannomutase  32.05 
 
 		 469 aa  159  7e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.301586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3174  Phosphomannomutase  31.06 
 
 		 456 aa  159  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2278  phosphomannomutase  32.67 
 
 		 453 aa  159  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.984443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0852  Phosphoglucosamine mutase  30.72 
 
 		 454 aa  158  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198816  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2406  phosphomannomutase  30.22 
 
 		 462 aa  157  3e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4379  phosphomannomutase  28.88 
 
 		 863 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.124617 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1175  phosphomannomutase  27.75 
 
 		 447 aa  156  7e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2267  phosphomannomutase  30.97 
 
 		 464 aa  156  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434508  normal  0.220531 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1286  phosphoglucosamine mutase  30.18 
 
 		 451 aa  156  9e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0527928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0949  phosphoglucosamine mutase  29.3 
 
 		 447 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4694  phosphomannomutase  29.02 
 
 		 446 aa  155  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2791  phosphomannomutase  31.12 
 
 		 460 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.677839 
 
 
-
 
NC_002936  DET0510  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  27.66 
 
 		 475 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2550  phosphomannomutase  29.78 
 
 		 462 aa  154  4e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0409  phosphoglucosamine mutase  29.01 
 
 		 451 aa  154  5e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000346871  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0362  Phosphomannomutase  28.98 
 
 		 474 aa  154  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0191  phosphoglucosamine mutase  27.68 
 
 		 453 aa  153  5e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.13045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>