More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4504 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4504  phosphomannomutase  100 
 
 
462 aa  931    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08836  putative phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  75.43 
 
 
462 aa  693    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0870555  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1742  Phosphomannomutase  69.85 
 
 
464 aa  629  1e-179  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1412  Phosphoglucosamine mutase  67.83 
 
 
462 aa  622  1e-177  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.130256 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3484  phosphomannomutase  65.07 
 
 
467 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0611643 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4415  Phosphomannomutase  63.64 
 
 
467 aa  587  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2856  Phosphomannomutase  64.29 
 
 
468 aa  568  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0153907  normal  0.42329 
 
 
-
 
NC_002950  PG1094  phosphomannomutase  58.61 
 
 
462 aa  545  1e-154  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.205287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1847  Phosphoglucosamine mutase  62.01 
 
 
460 aa  540  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0016  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  52.71 
 
 
464 aa  479  1e-134  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0454  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  48.09 
 
 
467 aa  451  1e-125  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1785  Phosphomannomutase  48.91 
 
 
458 aa  437  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0423  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  47.28 
 
 
478 aa  436  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0388  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  45.67 
 
 
470 aa  432  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.477012  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1760  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  45.15 
 
 
470 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00061927  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0319  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  46.4 
 
 
492 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0420  Phosphomannomutase  45.06 
 
 
471 aa  395  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.812169  normal  0.0593829 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0386  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  44.28 
 
 
472 aa  385  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00260149  normal  0.0316294 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1316  Phosphoglucosamine mutase  40.35 
 
 
450 aa  318  1e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2668  Phosphoglucosamine mutase  40.13 
 
 
478 aa  316  6e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000530484  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  36.38 
 
 
452 aa  265  8.999999999999999e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  35.96 
 
 
458 aa  252  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2115  phosphoglucosamine mutase  34.16 
 
 
448 aa  241  2e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  34.19 
 
 
450 aa  240  4e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0496  Phosphoglucosamine mutase  32.72 
 
 
480 aa  228  3e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0223  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  31.66 
 
 
452 aa  212  9e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00762456  normal  0.0119193 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1197  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  30.35 
 
 
453 aa  211  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0464554 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0755  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  30.77 
 
 
456 aa  206  6e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0117608  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2256  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  31.32 
 
 
453 aa  204  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.361439  decreased coverage  0.00522565 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0084  Phosphoglucosamine mutase  31.56 
 
 
454 aa  203  6e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0852  Phosphoglucosamine mutase  31.02 
 
 
454 aa  197  3e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198816  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0067  Phosphomannomutase  31.07 
 
 
475 aa  197  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1188  Phosphoglucosamine mutase  31.32 
 
 
455 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0486  Phosphoglucosamine mutase  31.65 
 
 
455 aa  195  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2154  phosphomannomutase  30.44 
 
 
449 aa  191  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0785  alpha-phosphoglucomutase / phosphomannomutase  31.73 
 
 
458 aa  189  1e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00879985  unclonable  0.000000000000213638 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0481  phosphomannomutase  29.6 
 
 
450 aa  185  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00838826 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2342  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  31.29 
 
 
433 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0286234  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1740  Phosphoglucosamine mutase  30.62 
 
 
454 aa  182  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.533946  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0224  phosphoglucosamine mutase  28.57 
 
 
449 aa  179  7e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4694  phosphomannomutase  30.64 
 
 
446 aa  179  8e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02922  phosphomannomutase  30.43 
 
 
782 aa  179  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.919523  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0714  phosphomannomutase  27.98 
 
 
460 aa  179  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.079186  normal  0.0391719 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2253  Phosphoglucosamine mutase  31.1 
 
 
434 aa  178  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.329457  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2021  phosphoglucomutase  30.7 
 
 
434 aa  177  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.63108 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0468  Phosphomannomutase  30.25 
 
 
462 aa  176  5e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.489238  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3174  Phosphomannomutase  30.67 
 
 
456 aa  175  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5288  phosphomannomutase  29.93 
 
 
463 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2673  Phosphomannomutase  30.97 
 
 
464 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00943387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5197  phosphomannomutase  29.93 
 
 
466 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1108  phosphomannomutase  30.02 
 
 
460 aa  173  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0485  Phosphomannomutase  28.98 
 
 
466 aa  172  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2782  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  30.07 
 
 
463 aa  171  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5338  phosphomannomutase  29.71 
 
 
466 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00384224 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2278  phosphomannomutase  29.29 
 
 
453 aa  171  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.984443  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70270  phosphomannomutase AlgC  28.04 
 
 
854 aa  170  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0219  phosphomannomutase  29.07 
 
 
465 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6098  phosphomannomutase AlgC  27.55 
 
 
868 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21229  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4124  phosphomannomutase  28.67 
 
 
448 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2994  phosphomannomutase  28.8 
 
 
468 aa  168  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0585  Phosphomannomutase  29.81 
 
 
447 aa  168  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.681403  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2432  Fis family transcriptional regulator  28.48 
 
 
444 aa  168  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0183  phosphomannomutase  29.02 
 
 
465 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12891  decreased coverage  0.0000000447524 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1786  phosphoglucomutase  29.72 
 
 
471 aa  167  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1132  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  30.61 
 
 
437 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.303022  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1993  Phosphomannomutase  29.37 
 
 
459 aa  167  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00229621 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1639  phosphomannomutase  30.62 
 
 
461 aa  167  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.306168 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0399  phosphomannomutase  29.72 
 
 
471 aa  166  5.9999999999999996e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.889065  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1905  phosphomannomutase  27.48 
 
 
461 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.293066  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0083  phosphomannomutase AlgC  28.48 
 
 
465 aa  166  8e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0120  phosphomannomutase  29.1 
 
 
497 aa  166  9e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4379  phosphomannomutase  29.15 
 
 
863 aa  166  9e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.124617 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2238  phosphomannomutase  29.35 
 
 
455 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.119559  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1218  phosphomannomutase  28.91 
 
 
448 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0459323  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2652  phosphomannomutase  29.38 
 
 
469 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1175  phosphomannomutase  27.78 
 
 
447 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0781  Phosphomannomutase  29.32 
 
 
461 aa  164  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3964  phosphomannomutase  29.31 
 
 
462 aa  164  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.234927 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1092  phosphomannomutase  29.78 
 
 
461 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0111  phosphomannomutase  30.79 
 
 
493 aa  163  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02910  Phosphomannomutase/phosphoglucomutase AlgC  28.44 
 
 
488 aa  163  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2945  phosphomannomutase  30.73 
 
 
457 aa  163  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1830  Phosphomannomutase  27.45 
 
 
462 aa  163  7e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325101  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1768  Phosphomannomutase  28.95 
 
 
451 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1242  Phosphomannomutase  26.86 
 
 
469 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0600  Phosphomannomutase  28.51 
 
 
462 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106733  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0641  Phosphomannomutase  29.4 
 
 
462 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2138  phosphomannomutase  29.17 
 
 
457 aa  161  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0166  phosphomannomutase  28.29 
 
 
456 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_469  phosphomannomutase  29.2 
 
 
430 aa  160  3e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3725  Phosphomannomutase  28.97 
 
 
460 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0691  putative phosphomannomutase or phosphoglucomutase protein  29.31 
 
 
461 aa  160  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0002556  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2021  phosphomannomutase  27.04 
 
 
462 aa  160  6e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.155894  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0504  phosphoglucosamine mutase  28.08 
 
 
430 aa  158  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.730223  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1021  phosphomannomutase  27.84 
 
 
472 aa  157  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0528  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  28.33 
 
 
430 aa  157  4e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1921  phosphomannomutase  30.58 
 
 
457 aa  157  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5049  Phosphomannomutase  29.19 
 
 
479 aa  157  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.721342  normal  0.477893 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2983  phosphomannomutase  29.34 
 
 
467 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794325  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0286  Phosphomannomutase  30.26 
 
 
782 aa  157  6e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.132974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>