More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3725 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2999  phosphomannomutase  76.21 
 
 		 475 aa  738    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3964  phosphomannomutase  75.32 
 
 		 462 aa  712    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234927 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1639  phosphomannomutase  78.96 
 
 		 461 aa  753    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.306168 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3725  Phosphomannomutase  100 
 
 		 460 aa  931    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1830  Phosphomannomutase  77.06 
 
 		 462 aa  726    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325101  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2822  phosphomannomutase  76.84 
 
 		 486 aa  732    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1108  phosphomannomutase  77.17 
 
 		 460 aa  742    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2021  phosphomannomutase  77.27 
 
 		 462 aa  727    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.155894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2559  phosphomannomutase  73.58 
 
 		 460 aa  690    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.344329  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2141  phosphomannomutase  66.38 
 
 		 463 aa  625  1e-178  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2443  phosphomannomutase  63 
 
 		 472 aa  596  1e-169  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.299376 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0691  putative phosphomannomutase or phosphoglucomutase protein  61.52 
 
 		 461 aa  579  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0002556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0641  Phosphomannomutase  61.44 
 
 		 462 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0600  Phosphomannomutase  61.79 
 
 		 462 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0745  phosphomannomutase  60.74 
 
 		 461 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0781  Phosphomannomutase  59.65 
 
 		 461 aa  569  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2716  phosphomannomutase  60.65 
 
 		 461 aa  570  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1092  phosphomannomutase  59.87 
 
 		 461 aa  570  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2267  phosphomannomutase  58.53 
 
 		 464 aa  556  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434508  normal  0.220531 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3299  phosphomannomutase  60.82 
 
 		 458 aa  550  1e-155  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230097 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2497  phosphomannomutase  58.41 
 
 		 485 aa  548  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.679752  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2191  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  60.69 
 
 		 472 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.738295  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3143  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  60.48 
 
 		 464 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3119  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  60.69 
 
 		 472 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14281  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3083  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  60.69 
 
 		 472 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835798  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0716  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  60.69 
 
 		 961 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2064  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  60.69 
 
 		 464 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.020226  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3701  phosphomannomutase  57.02 
 
 		 464 aa  542  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2550  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  60.69 
 
 		 464 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1489  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  60.26 
 
 		 464 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0374748  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0920  Phosphomannomutase  56.37 
 
 		 464 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1062  phosphomannomutase  57.68 
 
 		 469 aa  535  1e-151  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2138  phosphomannomutase  59.14 
 
 		 457 aa  534  1e-150  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0772  phosphomannomutase  58.41 
 
 		 487 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0863  phosphomannomutase  57.76 
 
 		 464 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0783  phosphomannomutase  58.41 
 
 		 464 aa  527  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1921  phosphomannomutase  56.8 
 
 		 457 aa  526  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0414  phosphomannomutase  57.76 
 
 		 489 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0893  phosphomannomutase  57.76 
 
 		 489 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498123  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3990  phosphomannomutase  57.97 
 
 		 464 aa  523  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.047705 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1206  Phosphomannomutase  60.32 
 
 		 465 aa  524  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02910  Phosphomannomutase/phosphoglucomutase AlgC  57.58 
 
 		 488 aa  519  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70270  phosphomannomutase AlgC  56.42 
 
 		 854 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5288  phosphomannomutase  57.18 
 
 		 463 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2994  phosphomannomutase  56.02 
 
 		 468 aa  502  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6098  phosphomannomutase AlgC  56.19 
 
 		 868 aa  504  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21229  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0083  phosphomannomutase AlgC  55.16 
 
 		 465 aa  501  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5542  phosphomannomutase  55.36 
 
 		 465 aa  498  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5197  phosphomannomutase  56.95 
 
 		 466 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2845  phosphomannomutase  54.49 
 
 		 469 aa  500  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.301586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0219  phosphomannomutase  54.61 
 
 		 465 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5338  phosphomannomutase  56.26 
 
 		 466 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00384224 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0183  phosphomannomutase  55.04 
 
 		 465 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12891  decreased coverage  0.0000000447524 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3561  phosphomannomutase  54.95 
 
 		 881 aa  491  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2782  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  54.89 
 
 		 463 aa  486  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4379  phosphomannomutase  54.7 
 
 		 863 aa  483  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.124617 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02922  phosphomannomutase  53.24 
 
 		 782 aa  476  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.919523  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1905  phosphomannomutase  50.76 
 
 		 461 aa  474  1e-132  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.293066  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2297  phosphomannomutase  52.88 
 
 		 464 aa  474  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1786  phosphoglucomutase  53.32 
 
 		 471 aa  469  1.0000000000000001e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0399  phosphomannomutase  53.32 
 
 		 471 aa  471  1.0000000000000001e-131  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.889065  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2983  phosphomannomutase  52.49 
 
 		 467 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794325  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0286  Phosphomannomutase  54.13 
 
 		 782 aa  465  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.132974 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2550  phosphomannomutase  48.18 
 
 		 462 aa  429  1e-119  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2406  phosphomannomutase  48.41 
 
 		 462 aa  431  1e-119  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0160  phosphomannomutase  49.89 
 
 		 456 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0178  Phosphomannomutase  49.89 
 
 		 456 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0167  phosphomannomutase  49.66 
 
 		 456 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0166  phosphomannomutase  48.87 
 
 		 456 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3676  phosphomannomutase  43.9 
 
 		 830 aa  389  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.991755  normal  0.132768 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2154  phosphomannomutase  44.67 
 
 		 449 aa  389  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0332  phosphomannomutase  45.85 
 
 		 469 aa  391  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0122  Phosphomannomutase  47.22 
 
 		 469 aa  385  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1915  phosphomannomutase  44.26 
 
 		 453 aa  382  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2673  Phosphomannomutase  46.9 
 
 		 464 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00943387 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2278  phosphomannomutase  45.91 
 
 		 453 aa  381  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.984443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1021  phosphomannomutase  47.66 
 
 		 472 aa  378  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0468  Phosphomannomutase  43.53 
 
 		 462 aa  376  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.489238  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1175  phosphomannomutase  41.69 
 
 		 447 aa  372  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1398  phosphomannomutase  42.16 
 
 		 458 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0481  phosphomannomutase  41.28 
 
 		 450 aa  369  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838826 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0362  Phosphomannomutase  43.75 
 
 		 474 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0485  Phosphomannomutase  43.44 
 
 		 466 aa  365  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2945  phosphomannomutase  42.58 
 
 		 457 aa  365  1e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2791  phosphomannomutase  45.5 
 
 		 460 aa  361  1e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.677839 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0067  Phosphomannomutase  41.14 
 
 		 475 aa  360  4e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2238  phosphomannomutase  43.15 
 
 		 455 aa  359  5e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.119559  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1242  Phosphomannomutase  43.01 
 
 		 469 aa  359  6e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0045  phosphomannomutase  45.52 
 
 		 467 aa  358  8e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109324  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0113  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  43.17 
 
 		 847 aa  356  5e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3316  phosphomannomutase  44.32 
 
 		 467 aa  353  2.9999999999999997e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3001  phosphomannomutase  44.37 
 
 		 460 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.324631  normal  0.16456 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0128  phosphomannomutase  42.95 
 
 		 495 aa  350  2e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.142416  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5049  Phosphomannomutase  43.16 
 
 		 479 aa  340  2.9999999999999998e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.721342  normal  0.477893 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1993  Phosphomannomutase  42.64 
 
 		 459 aa  328  9e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00229621 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2652  phosphomannomutase  40.97 
 
 		 469 aa  323  5e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0306  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  38.99 
 
 		 455 aa  321  1.9999999999999998e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0317157  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0102  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  38.86 
 
 		 455 aa  320  3e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2720  phosphomannomutase  41.98 
 
 		 468 aa  314  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0666  integral membrane protein  38.82 
 
 		 455 aa  313  2.9999999999999996e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0277597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>