More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2791 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_3001  phosphomannomutase  70.22 
 
 
460 aa  662    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.324631  normal  0.16456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2791  phosphomannomutase  100 
 
 
460 aa  927    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.677839 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3316  phosphomannomutase  62.1 
 
 
467 aa  567  1e-160  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1021  phosphomannomutase  59.34 
 
 
472 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0122  Phosphomannomutase  59.34 
 
 
469 aa  531  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0045  phosphomannomutase  56.07 
 
 
467 aa  490  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109324  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0166  phosphomannomutase  47.09 
 
 
456 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0332  phosphomannomutase  47.1 
 
 
469 aa  390  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0178  Phosphomannomutase  46 
 
 
456 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0160  phosphomannomutase  46 
 
 
456 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0167  phosphomannomutase  45.78 
 
 
456 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2994  phosphomannomutase  44.27 
 
 
468 aa  379  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0481  phosphomannomutase  44.47 
 
 
450 aa  379  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00838826 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3561  phosphomannomutase  43.6 
 
 
881 aa  372  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0920  Phosphomannomutase  44.22 
 
 
464 aa  363  4e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2999  phosphomannomutase  44.06 
 
 
475 aa  362  8e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0641  Phosphomannomutase  43.57 
 
 
462 aa  362  8e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0600  Phosphomannomutase  43.67 
 
 
462 aa  362  1e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106733  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3725  Phosphomannomutase  45.5 
 
 
460 aa  361  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5542  phosphomannomutase  43.51 
 
 
465 aa  361  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3701  phosphomannomutase  43.76 
 
 
464 aa  360  3e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2267  phosphomannomutase  43.99 
 
 
464 aa  359  6e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434508  normal  0.220531 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0219  phosphomannomutase  43.19 
 
 
465 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0691  putative phosphomannomutase or phosphoglucomutase protein  43.47 
 
 
461 aa  356  5e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0002556  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0083  phosphomannomutase AlgC  43.42 
 
 
465 aa  356  5e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2497  phosphomannomutase  43.31 
 
 
485 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.679752  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1108  phosphomannomutase  44.75 
 
 
460 aa  356  5.999999999999999e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2550  phosphomannomutase  40.59 
 
 
462 aa  355  8.999999999999999e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1639  phosphomannomutase  44.52 
 
 
461 aa  355  8.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.306168 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02910  Phosphomannomutase/phosphoglucomutase AlgC  43.47 
 
 
488 aa  355  1e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6098  phosphomannomutase AlgC  42.21 
 
 
868 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21229  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70270  phosphomannomutase AlgC  42.21 
 
 
854 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2845  phosphomannomutase  44.39 
 
 
469 aa  353  4e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.301586  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0745  phosphomannomutase  43.53 
 
 
461 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2406  phosphomannomutase  40.36 
 
 
462 aa  352  8e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3964  phosphomannomutase  44.57 
 
 
462 aa  352  8e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.234927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5288  phosphomannomutase  43.16 
 
 
463 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5197  phosphomannomutase  43.16 
 
 
466 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5338  phosphomannomutase  43.39 
 
 
466 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00384224 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0183  phosphomannomutase  42.92 
 
 
465 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12891  decreased coverage  0.0000000447524 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0485  Phosphomannomutase  42.99 
 
 
466 aa  350  4e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2141  phosphomannomutase  44.3 
 
 
463 aa  350  4e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0781  Phosphomannomutase  41.02 
 
 
461 aa  349  7e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2716  phosphomannomutase  42.63 
 
 
461 aa  349  7e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541607  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1175  phosphomannomutase  39.69 
 
 
447 aa  348  1e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1092  phosphomannomutase  40.85 
 
 
461 aa  346  4e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2822  phosphomannomutase  43.34 
 
 
486 aa  347  4e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02922  phosphomannomutase  42.28 
 
 
782 aa  346  5e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.919523  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4379  phosphomannomutase  43.28 
 
 
863 aa  346  5e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.124617 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2782  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  42.86 
 
 
463 aa  344  2e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1786  phosphoglucomutase  39.69 
 
 
471 aa  343  5e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2983  phosphomannomutase  44.72 
 
 
467 aa  342  7e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794325  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0863  phosphomannomutase  43.99 
 
 
464 aa  342  8e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3143  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  44.22 
 
 
464 aa  342  9e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0414  phosphomannomutase  43.99 
 
 
489 aa  342  9e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0893  phosphomannomutase  43.99 
 
 
489 aa  342  9e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498123  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3083  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  43.99 
 
 
472 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835798  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0399  phosphomannomutase  39.69 
 
 
471 aa  342  1e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.889065  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3119  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  43.99 
 
 
472 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14281  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2443  phosphomannomutase  43.85 
 
 
472 aa  341  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.299376 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2064  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  43.99 
 
 
464 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.020226  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2191  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  43.99 
 
 
472 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.738295  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0286  Phosphomannomutase  41.48 
 
 
782 aa  340  2e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.132974 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2550  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  43.99 
 
 
464 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1489  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  42.7 
 
 
464 aa  340  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0374748  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0067  Phosphomannomutase  41.18 
 
 
475 aa  340  2e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2673  Phosphomannomutase  43.47 
 
 
464 aa  341  2e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00943387 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2238  phosphomannomutase  39.82 
 
 
455 aa  341  2e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.119559  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2278  phosphomannomutase  43.86 
 
 
453 aa  339  5e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.984443  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3299  phosphomannomutase  42.26 
 
 
458 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230097 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2559  phosphomannomutase  43.47 
 
 
460 aa  337  1.9999999999999998e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.344329  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0716  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  43.99 
 
 
961 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0772  phosphomannomutase  43.08 
 
 
487 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2021  phosphomannomutase  42.58 
 
 
462 aa  336  5.999999999999999e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.155894  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0783  phosphomannomutase  43.08 
 
 
464 aa  335  7e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3990  phosphomannomutase  43.31 
 
 
464 aa  335  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.047705 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1830  Phosphomannomutase  42.58 
 
 
462 aa  335  1e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325101  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1921  phosphomannomutase  41.28 
 
 
457 aa  335  1e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1398  phosphomannomutase  40.42 
 
 
458 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0695  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  39.69 
 
 
462 aa  333  3e-90  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2297  phosphomannomutase  41.14 
 
 
464 aa  333  5e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2138  phosphomannomutase  41.15 
 
 
457 aa  330  3e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0468  Phosphomannomutase  38.93 
 
 
462 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.489238  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2945  phosphomannomutase  40.55 
 
 
457 aa  324  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1206  Phosphomannomutase  41.72 
 
 
465 aa  324  2e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3676  phosphomannomutase  40.33 
 
 
830 aa  322  6e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.991755  normal  0.132768 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1062  phosphomannomutase  41.14 
 
 
469 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2154  phosphomannomutase  39.59 
 
 
449 aa  319  7e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1406  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  40.05 
 
 
456 aa  317  2e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1594  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  40.05 
 
 
456 aa  317  3e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5049  Phosphomannomutase  40.52 
 
 
479 aa  314  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.721342  normal  0.477893 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1740  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  39.35 
 
 
456 aa  314  1.9999999999999998e-84  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1915  phosphomannomutase  38.26 
 
 
453 aa  307  3e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0362  Phosphomannomutase  40.18 
 
 
474 aa  306  7e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1905  phosphomannomutase  36.62 
 
 
461 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.293066  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0623  phosphomannomutase  39.46 
 
 
452 aa  297  3e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1242  Phosphomannomutase  39.37 
 
 
469 aa  297  3e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2652  phosphomannomutase  40.51 
 
 
469 aa  292  9e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2720  phosphomannomutase  39.36 
 
 
468 aa  290  5.0000000000000004e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0256  phosphohexosemutase  36.47 
 
 
455 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.769457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>