More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2172 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01932  Phosphomannomutase  76.43 
 
 
454 aa  729    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01954  phosphomannomutase  76.37 
 
 
456 aa  733    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0099894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1609  Phosphomannomutase  76.37 
 
 
456 aa  734    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000012475  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01943  hypothetical protein  76.37 
 
 
456 aa  733    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00870446  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1600  phosphomannomutase  74.07 
 
 
455 aa  715    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0455813  normal  0.713517 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0302  phosphomannomutase  67.25 
 
 
470 aa  637    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2229  phosphomannomutase  75.27 
 
 
456 aa  719    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117299  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2337  phosphomannomutase  75.93 
 
 
456 aa  726    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113042  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2964  phosphomannomutase  76.8 
 
 
456 aa  721    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000327344 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1317  Phosphomannomutase  74.84 
 
 
457 aa  728    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.214391  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3280  Phosphomannomutase  66.01 
 
 
454 aa  636    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2172  phosphomannomutase  100 
 
 
460 aa  951    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.140706  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1256  phosphomannomutase  74.67 
 
 
457 aa  734    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000453708  hitchhiker  0.000000000293956 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2444  phosphomannomutase  75.27 
 
 
456 aa  721    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188854 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2662  phosphomannomutase  77.68 
 
 
456 aa  750    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0392975  normal  0.829535 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1014  phosphomannomutase  76.15 
 
 
456 aa  732    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3037  phosphomannomutase  74.45 
 
 
457 aa  732    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.848364  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2340  phosphomannomutase  75.71 
 
 
456 aa  729    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2622  phosphomannomutase  68.25 
 
 
463 aa  669    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2851  Phosphomannomutase  72.21 
 
 
457 aa  689    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1593  phosphomannomutase  76.59 
 
 
456 aa  734    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.014113  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2286  phosphomannomutase  75.71 
 
 
456 aa  726    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000657815 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1118  phosphomannomutase  68.27 
 
 
454 aa  662    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000519382  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2643  phosphomannomutase  77.68 
 
 
457 aa  751    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320582  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1184  phosphomannomutase  75.93 
 
 
456 aa  730    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2330  phosphomannomutase  75.49 
 
 
456 aa  721    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0469689 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2982  phosphomannomutase  75.71 
 
 
456 aa  729    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000140295 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3178  phosphomannomutase  74.67 
 
 
457 aa  734    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1793  phosphomannomutase  62.79 
 
 
481 aa  629  1e-179  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00302913  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1792  phosphomannomutase  66.15 
 
 
450 aa  624  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1779  phosphomannomutase ManB  65.27 
 
 
450 aa  620  1e-176  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01868  phosphomannomutase  61.24 
 
 
486 aa  614  1e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203499  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1134  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain III  64.33 
 
 
450 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0747537  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3151  Phosphomannomutase  64.62 
 
 
450 aa  610  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1001  phosphomannomutase  64.76 
 
 
453 aa  604  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.834887  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00966  phosphomannomutase  60.41 
 
 
486 aa  603  1.0000000000000001e-171  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17998  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2589  Phosphomannomutase  63.72 
 
 
447 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1632  phosphomannomutase  61.69 
 
 
462 aa  593  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1738  phosphomannomutase  61.69 
 
 
462 aa  593  1e-168  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0922588  hitchhiker  0.000796464 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1525  phosphomannomutase  61.69 
 
 
462 aa  593  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3126  phosphomannomutase  60.13 
 
 
461 aa  587  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141531  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0863  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  60.04 
 
 
813 aa  565  1e-160  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0895  Phosphomannomutase  60.62 
 
 
456 aa  567  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310909  hitchhiker  0.000000688858 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2255  Phosphomannomutase  59.82 
 
 
450 aa  549  1e-155  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0395092  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0458  phosphomannomutase  58.94 
 
 
450 aa  550  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235202  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1777  phosphomannomutase  58.81 
 
 
453 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0509  Phosphomannomutase  59.03 
 
 
448 aa  541  9.999999999999999e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0115906 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2109  Phosphomannomutase  57.96 
 
 
467 aa  538  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.221501  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1677  phosphomannomutase  55.9 
 
 
457 aa  541  9.999999999999999e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03174  phosphohexose mutase  57.4 
 
 
448 aa  529  1e-149  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1384  phosphomannomutase  57.49 
 
 
453 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0274  phosphomannomutase  53.73 
 
 
487 aa  520  1e-146  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000825  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0200  phosphomannomutase  56.48 
 
 
449 aa  515  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1093  Phosphomannomutase  54.51 
 
 
448 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0489  Phosphomannomutase  52.4 
 
 
493 aa  514  1e-144  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0835  phosphomannomutase  54.92 
 
 
458 aa  512  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584316  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0229  phosphomannomutase  56.24 
 
 
449 aa  514  1e-144  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2492  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  55.14 
 
 
458 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.211242  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0120  phosphomannomutase  51.59 
 
 
497 aa  499  1e-140  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0111  phosphomannomutase  51.91 
 
 
493 aa  497  1e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0414  Phosphomannomutase  52.56 
 
 
473 aa  485  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1900  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  49.78 
 
 
456 aa  463  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.662048  hitchhiker  0.0000555961 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0831  phosphomannomutase  48.67 
 
 
451 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.975214  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01918  hypothetical protein  73.76 
 
 
282 aa  443  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4694  phosphomannomutase  41.69 
 
 
446 aa  375  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0585  Phosphomannomutase  41.81 
 
 
447 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.681403  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1218  phosphomannomutase  42.03 
 
 
448 aa  362  6e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0459323  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4124  phosphomannomutase  42.49 
 
 
448 aa  362  8e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3174  Phosphomannomutase  40 
 
 
456 aa  327  3e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1134  phosphomannomutase  38.91 
 
 
472 aa  325  1e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.579862  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0751  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  41.28 
 
 
452 aa  313  5.999999999999999e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.648752  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6327  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  41.67 
 
 
450 aa  310  2.9999999999999997e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.428689  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2432  Fis family transcriptional regulator  39.78 
 
 
444 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3760  Phosphomannomutase  39.39 
 
 
453 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.343268  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0465  phosphomannomutase  40.66 
 
 
454 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441417  normal  0.856635 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1768  Phosphomannomutase  39.81 
 
 
451 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4063  Phosphomannomutase  41.36 
 
 
456 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0919518  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0756  Phosphomannomutase  41.18 
 
 
451 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.0777802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1387  Phosphomannomutase  39.91 
 
 
450 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31020  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  41.13 
 
 
451 aa  302  9e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815121  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1432  Phosphomannomutase  37.56 
 
 
453 aa  301  1e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4298  Phosphomannomutase  38.65 
 
 
454 aa  298  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5858  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  39.82 
 
 
453 aa  293  4e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1187  Phosphomannomutase  40.23 
 
 
456 aa  292  8e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.485619  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0898  phosphomannomutase  39.78 
 
 
461 aa  292  8e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.478971  normal  0.0385997 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2510  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  38.99 
 
 
455 aa  291  2e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0671  phosphomannomutase  38.83 
 
 
475 aa  290  4e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.828766  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1737  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  38.99 
 
 
464 aa  286  4e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.847298  normal  0.689022 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1425  phosphomannomutase  38.16 
 
 
469 aa  286  5e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.896243  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3841  Phosphomannomutase  36.72 
 
 
497 aa  283  5.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.062306 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0818  Phosphomannomutase  38.74 
 
 
472 aa  283  7.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4168  Phosphomannomutase  39.1 
 
 
471 aa  279  7e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.400371  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08560  phosphomannomutase  37.24 
 
 
487 aa  273  3e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.749123 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7604  Phosphomannomutase  38.32 
 
 
449 aa  273  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.908268 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1328  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  39.13 
 
 
465 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23364  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1345  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  39.13 
 
 
465 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0961  phosphomannomutase  39.11 
 
 
461 aa  273  6e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.386078 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2542  Phosphomannomutase  35.7 
 
 
488 aa  273  7e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01919  hypothetical protein  82.28 
 
 
159 aa  272  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1364  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  38.9 
 
 
465 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.176475  normal  0.655061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>