More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_01919 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01932  Phosphomannomutase  100 
 
 
454 aa  327  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01919  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  326  9e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01954  phosphomannomutase  100 
 
 
456 aa  325  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0099894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1609  Phosphomannomutase  100 
 
 
456 aa  325  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000012475  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1014  phosphomannomutase  100 
 
 
456 aa  325  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01943  hypothetical protein  100 
 
 
456 aa  325  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00870446  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2340  phosphomannomutase  100 
 
 
456 aa  325  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1184  phosphomannomutase  99.37 
 
 
456 aa  323  4.0000000000000003e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1593  phosphomannomutase  99.37 
 
 
456 aa  323  5e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.014113  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2964  phosphomannomutase  99.37 
 
 
456 aa  323  5e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000327344 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2982  phosphomannomutase  99.37 
 
 
456 aa  323  5e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000140295 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2286  phosphomannomutase  91.77 
 
 
456 aa  301  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000657815 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2662  phosphomannomutase  91.14 
 
 
456 aa  301  3.0000000000000004e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0392975  normal  0.829535 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2330  phosphomannomutase  91.77 
 
 
456 aa  301  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0469689 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2337  phosphomannomutase  91.14 
 
 
456 aa  300  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113042  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2643  phosphomannomutase  90.51 
 
 
457 aa  300  7.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320582  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2444  phosphomannomutase  91.14 
 
 
456 aa  299  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188854 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2229  phosphomannomutase  91.14 
 
 
456 aa  299  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117299  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2172  phosphomannomutase  82.28 
 
 
460 aa  271  3e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.140706  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3178  phosphomannomutase  80.25 
 
 
457 aa  270  8.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1256  phosphomannomutase  80.25 
 
 
457 aa  270  9e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000453708  hitchhiker  0.000000000293956 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3037  phosphomannomutase  79.62 
 
 
457 aa  266  5.9999999999999995e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.848364  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1317  Phosphomannomutase  73.42 
 
 
457 aa  252  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.214391  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1600  phosphomannomutase  74.68 
 
 
455 aa  243  6.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0455813  normal  0.713517 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2851  Phosphomannomutase  68.99 
 
 
457 aa  238  4e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2622  phosphomannomutase  69.33 
 
 
463 aa  232  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1118  phosphomannomutase  68.79 
 
 
454 aa  228  2e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000519382  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3280  Phosphomannomutase  63.69 
 
 
454 aa  211  3.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1632  phosphomannomutase  65.19 
 
 
462 aa  208  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1525  phosphomannomutase  65.19 
 
 
462 aa  208  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1738  phosphomannomutase  65.19 
 
 
462 aa  208  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0922588  hitchhiker  0.000796464 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1792  phosphomannomutase  64.56 
 
 
450 aa  207  6e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0302  phosphomannomutase  61.15 
 
 
470 aa  204  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1001  phosphomannomutase  61.78 
 
 
453 aa  203  7e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.834887  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3151  Phosphomannomutase  61.39 
 
 
450 aa  202  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2589  Phosphomannomutase  60.13 
 
 
447 aa  202  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1134  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain III  60.13 
 
 
450 aa  201  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0747537  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1793  phosphomannomutase  56.83 
 
 
481 aa  201  5e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00302913  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1779  phosphomannomutase ManB  62.89 
 
 
450 aa  199  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3126  phosphomannomutase  58.71 
 
 
461 aa  193  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141531  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01868  phosphomannomutase  68.22 
 
 
486 aa  184  6e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203499  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0863  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  55.97 
 
 
813 aa  183  9e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0895  Phosphomannomutase  55.35 
 
 
456 aa  183  9e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310909  hitchhiker  0.000000688858 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00966  phosphomannomutase  60.39 
 
 
486 aa  181  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17998  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2255  Phosphomannomutase  56.05 
 
 
450 aa  181  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0395092  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0274  phosphomannomutase  55.03 
 
 
487 aa  180  7e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000825  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1677  phosphomannomutase  53.75 
 
 
457 aa  169  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0111  phosphomannomutase  48.85 
 
 
493 aa  169  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1777  phosphomannomutase  55.48 
 
 
453 aa  168  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0835  phosphomannomutase  53.21 
 
 
458 aa  167  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584316  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2492  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  53.21 
 
 
458 aa  167  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.211242  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1384  phosphomannomutase  56.13 
 
 
453 aa  167  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0458  phosphomannomutase  50.94 
 
 
450 aa  164  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235202  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0509  Phosphomannomutase  56.69 
 
 
448 aa  163  6.9999999999999995e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0115906 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1093  Phosphomannomutase  49.37 
 
 
448 aa  163  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0120  phosphomannomutase  47.7 
 
 
497 aa  160  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0489  Phosphomannomutase  56.29 
 
 
493 aa  159  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03174  phosphohexose mutase  53.5 
 
 
448 aa  155  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0200  phosphomannomutase  52.83 
 
 
449 aa  154  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0229  phosphomannomutase  52.83 
 
 
449 aa  154  7e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2109  Phosphomannomutase  49.37 
 
 
467 aa  152  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.221501  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1900  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  48.37 
 
 
456 aa  144  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.662048  hitchhiker  0.0000555961 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0831  phosphomannomutase  44.38 
 
 
451 aa  137  7.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.975214  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1768  Phosphomannomutase  46.2 
 
 
451 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4694  phosphomannomutase  41.29 
 
 
446 aa  132  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0585  Phosphomannomutase  43.31 
 
 
447 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.681403  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0414  Phosphomannomutase  45.78 
 
 
473 aa  127  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1218  phosphomannomutase  41.03 
 
 
448 aa  127  8.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0459323  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4124  phosphomannomutase  41.03 
 
 
448 aa  125  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1134  phosphomannomutase  41.51 
 
 
472 aa  121  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.579862  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3760  Phosphomannomutase  38.36 
 
 
453 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.343268  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0751  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  41.83 
 
 
452 aa  111  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.648752  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1432  Phosphomannomutase  45.59 
 
 
453 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0756  Phosphomannomutase  39.24 
 
 
451 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.0777802 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3001  phosphomannomutase  41.14 
 
 
460 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.324631  normal  0.16456 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31020  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  39.61 
 
 
451 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815121  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1242  Phosphomannomutase  40.25 
 
 
469 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2720  phosphomannomutase  40.88 
 
 
468 aa  106  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0465  phosphomannomutase  43.51 
 
 
454 aa  106  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441417  normal  0.856635 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6327  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  45.16 
 
 
450 aa  106  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.428689  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0067  Phosphomannomutase  38.04 
 
 
475 aa  105  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4063  Phosphomannomutase  41.18 
 
 
456 aa  106  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0919518  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08560  phosphomannomutase  40.49 
 
 
487 aa  105  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.749123 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2406  phosphomannomutase  48.21 
 
 
462 aa  104  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1425  phosphomannomutase  40.8 
 
 
469 aa  104  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.896243  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4298  Phosphomannomutase  39.02 
 
 
454 aa  104  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1187  Phosphomannomutase  38.51 
 
 
456 aa  104  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.485619  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3841  Phosphomannomutase  38.24 
 
 
497 aa  104  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.062306 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1830  Phosphomannomutase  41.77 
 
 
462 aa  103  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325101  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2550  phosphomannomutase  47.32 
 
 
462 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2432  Fis family transcriptional regulator  47.11 
 
 
444 aa  103  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1387  Phosphomannomutase  42.31 
 
 
450 aa  102  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1737  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  43.09 
 
 
464 aa  103  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.847298  normal  0.689022 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1921  phosphomannomutase  43.7 
 
 
457 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2021  phosphomannomutase  41.14 
 
 
462 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.155894  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2510  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  38.31 
 
 
455 aa  102  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4168  Phosphomannomutase  44.27 
 
 
471 aa  101  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.400371  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5858  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  40.52 
 
 
453 aa  101  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3174  Phosphomannomutase  39.49 
 
 
456 aa  101  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0600  Phosphomannomutase  40.12 
 
 
462 aa  101  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106733  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>