More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03174 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0509  Phosphomannomutase  81.88 
 
 
448 aa  770    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0115906 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03174  phosphohexose mutase  100 
 
 
448 aa  921    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0229  phosphomannomutase  83.96 
 
 
449 aa  791    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0200  phosphomannomutase  83.93 
 
 
449 aa  792    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1777  phosphomannomutase  62.7 
 
 
453 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1384  phosphomannomutase  63.6 
 
 
453 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1677  phosphomannomutase  60.89 
 
 
457 aa  590  1e-167  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0489  Phosphomannomutase  58.28 
 
 
493 aa  591  1e-167  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1792  phosphomannomutase  62.02 
 
 
450 aa  586  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1779  phosphomannomutase ManB  61.57 
 
 
450 aa  580  1e-164  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3151  Phosphomannomutase  62.47 
 
 
450 aa  579  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2255  Phosphomannomutase  62.72 
 
 
450 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0395092  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1093  Phosphomannomutase  61.02 
 
 
448 aa  571  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1134  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain III  61.35 
 
 
450 aa  569  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0747537  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2589  Phosphomannomutase  59.91 
 
 
447 aa  568  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1600  phosphomannomutase  61.06 
 
 
455 aa  571  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0455813  normal  0.713517 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2109  Phosphomannomutase  58.89 
 
 
467 aa  558  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.221501  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3280  Phosphomannomutase  57.96 
 
 
454 aa  560  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0895  Phosphomannomutase  60.41 
 
 
456 aa  555  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310909  hitchhiker  0.000000688858 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0863  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  62.3 
 
 
813 aa  556  1e-157  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0458  phosphomannomutase  58.48 
 
 
450 aa  555  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235202  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2662  phosphomannomutase  59.73 
 
 
456 aa  551  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0392975  normal  0.829535 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2337  phosphomannomutase  59.87 
 
 
456 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113042  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3126  phosphomannomutase  57.88 
 
 
461 aa  550  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141531  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2286  phosphomannomutase  60.09 
 
 
456 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000657815 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2643  phosphomannomutase  59.29 
 
 
457 aa  547  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320582  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2229  phosphomannomutase  59.87 
 
 
456 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117299  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1001  phosphomannomutase  58.48 
 
 
453 aa  544  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.834887  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2444  phosphomannomutase  59.42 
 
 
456 aa  542  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188854 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2330  phosphomannomutase  59.65 
 
 
456 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0469689 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01932  Phosphomannomutase  58.54 
 
 
454 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2982  phosphomannomutase  58.31 
 
 
456 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000140295 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1593  phosphomannomutase  58.31 
 
 
456 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.014113  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1014  phosphomannomutase  58.54 
 
 
456 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01954  phosphomannomutase  58.09 
 
 
456 aa  537  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0099894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1609  Phosphomannomutase  58.09 
 
 
456 aa  537  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000012475  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2964  phosphomannomutase  58.82 
 
 
456 aa  535  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000327344 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2340  phosphomannomutase  57.87 
 
 
456 aa  535  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01943  hypothetical protein  58.09 
 
 
456 aa  537  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00870446  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1184  phosphomannomutase  58.31 
 
 
456 aa  537  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1118  phosphomannomutase  57.33 
 
 
454 aa  533  1e-150  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000519382  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0302  phosphomannomutase  56.07 
 
 
470 aa  530  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1256  phosphomannomutase  57.3 
 
 
457 aa  526  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000453708  hitchhiker  0.000000000293956 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3178  phosphomannomutase  57.08 
 
 
457 aa  525  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3037  phosphomannomutase  57.3 
 
 
457 aa  526  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.848364  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0414  Phosphomannomutase  58.26 
 
 
473 aa  522  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01868  phosphomannomutase  54.17 
 
 
486 aa  516  1.0000000000000001e-145  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203499  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2851  Phosphomannomutase  57.05 
 
 
457 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1793  phosphomannomutase  52.6 
 
 
481 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00302913  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0831  phosphomannomutase  54.67 
 
 
451 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.975214  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1317  Phosphomannomutase  56.19 
 
 
457 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.214391  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1632  phosphomannomutase  54.17 
 
 
462 aa  512  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2172  phosphomannomutase  57.53 
 
 
460 aa  512  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.140706  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1738  phosphomannomutase  54.17 
 
 
462 aa  512  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0922588  hitchhiker  0.000796464 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1525  phosphomannomutase  54.17 
 
 
462 aa  512  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2622  phosphomannomutase  55.04 
 
 
463 aa  514  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00966  phosphomannomutase  52.71 
 
 
486 aa  504  1e-141  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17998  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1900  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  54.44 
 
 
456 aa  486  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.662048  hitchhiker  0.0000555961 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0274  phosphomannomutase  50.43 
 
 
487 aa  481  1e-135  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000825  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0835  phosphomannomutase  54.82 
 
 
458 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584316  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0120  phosphomannomutase  49.57 
 
 
497 aa  480  1e-134  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2492  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  54.39 
 
 
458 aa  480  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.211242  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0111  phosphomannomutase  49.15 
 
 
493 aa  464  1e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01918  hypothetical protein  61.43 
 
 
282 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0585  Phosphomannomutase  41.08 
 
 
447 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.681403  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4694  phosphomannomutase  42.25 
 
 
446 aa  354  2e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1134  phosphomannomutase  43.18 
 
 
472 aa  351  1e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.579862  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1218  phosphomannomutase  42.69 
 
 
448 aa  347  2e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0459323  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4124  phosphomannomutase  42.45 
 
 
448 aa  345  8.999999999999999e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3174  Phosphomannomutase  42.29 
 
 
456 aa  345  1e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0756  Phosphomannomutase  42.31 
 
 
451 aa  320  3e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.0777802 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0751  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  41.26 
 
 
452 aa  313  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.648752  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31020  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  43.21 
 
 
451 aa  313  4.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815121  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6327  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  42.59 
 
 
450 aa  309  5e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.428689  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1737  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  42.46 
 
 
464 aa  309  5e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.847298  normal  0.689022 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2510  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  40.22 
 
 
455 aa  309  8e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5858  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  41.65 
 
 
453 aa  307  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13286  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  41.57 
 
 
465 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.489635 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1768  Phosphomannomutase  40.45 
 
 
451 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1387  Phosphomannomutase  41.53 
 
 
450 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3760  Phosphomannomutase  39.78 
 
 
453 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.343268  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0465  phosphomannomutase  40.9 
 
 
454 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441417  normal  0.856635 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1425  phosphomannomutase  39.6 
 
 
469 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.896243  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1328  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  42.42 
 
 
465 aa  303  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23364  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1345  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  42.42 
 
 
465 aa  303  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08560  phosphomannomutase  42.79 
 
 
487 aa  302  1e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.749123 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0898  phosphomannomutase  41.55 
 
 
461 aa  300  4e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.478971  normal  0.0385997 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1364  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  41.96 
 
 
465 aa  298  9e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.176475  normal  0.655061 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3841  Phosphomannomutase  40.53 
 
 
497 aa  298  1e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.062306 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4063  Phosphomannomutase  41.7 
 
 
456 aa  298  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0919518  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1432  Phosphomannomutase  37.75 
 
 
453 aa  295  9e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4298  Phosphomannomutase  41.4 
 
 
454 aa  295  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7604  Phosphomannomutase  40.85 
 
 
449 aa  292  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.908268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6010  Phosphomannomutase  41.43 
 
 
454 aa  291  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.30884  normal  0.056179 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2542  Phosphomannomutase  39.16 
 
 
488 aa  290  3e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1187  Phosphomannomutase  40.97 
 
 
456 aa  289  5.0000000000000004e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.485619  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2432  Fis family transcriptional regulator  38.2 
 
 
444 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1856  Phosphomannomutase  38.89 
 
 
502 aa  284  2.0000000000000002e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114337  decreased coverage  0.00605536 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0961  phosphomannomutase  41.78 
 
 
461 aa  282  7.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.386078 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4726  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  39.81 
 
 
465 aa  278  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.267989  normal  0.336703 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>