More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01868 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00966  phosphomannomutase  86.42 
 
 
486 aa  882    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17998  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01868  phosphomannomutase  100 
 
 
486 aa  1001    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203499  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1793  phosphomannomutase  69.58 
 
 
481 aa  706    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00302913  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2286  phosphomannomutase  62.79 
 
 
456 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000657815 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1600  phosphomannomutase  61.8 
 
 
455 aa  627  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0455813  normal  0.713517 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2330  phosphomannomutase  62.37 
 
 
456 aa  621  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0469689 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2444  phosphomannomutase  62.16 
 
 
456 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188854 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2337  phosphomannomutase  61.95 
 
 
456 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113042  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01932  Phosphomannomutase  62 
 
 
454 aa  618  1e-176  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01954  phosphomannomutase  61.54 
 
 
456 aa  619  1e-176  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0099894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1609  Phosphomannomutase  61.75 
 
 
456 aa  619  1e-176  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000012475  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01943  hypothetical protein  61.54 
 
 
456 aa  619  1e-176  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00870446  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1184  phosphomannomutase  61.54 
 
 
456 aa  619  1e-176  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1593  phosphomannomutase  61.75 
 
 
456 aa  619  1e-176  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.014113  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2229  phosphomannomutase  61.75 
 
 
456 aa  618  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117299  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1014  phosphomannomutase  61.75 
 
 
456 aa  619  1e-176  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2982  phosphomannomutase  61.75 
 
 
456 aa  619  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000140295 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0302  phosphomannomutase  61.89 
 
 
470 aa  615  1e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2643  phosphomannomutase  61.16 
 
 
457 aa  616  1e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320582  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2340  phosphomannomutase  61.33 
 
 
456 aa  617  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2662  phosphomannomutase  60.83 
 
 
456 aa  612  9.999999999999999e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0392975  normal  0.829535 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2964  phosphomannomutase  62.47 
 
 
456 aa  610  1e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000327344 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3178  phosphomannomutase  62.03 
 
 
457 aa  607  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3037  phosphomannomutase  61.83 
 
 
457 aa  606  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.848364  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1256  phosphomannomutase  61.83 
 
 
457 aa  605  9.999999999999999e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000453708  hitchhiker  0.000000000293956 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2851  Phosphomannomutase  59.67 
 
 
457 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1317  Phosphomannomutase  60 
 
 
457 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.214391  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2172  phosphomannomutase  61.68 
 
 
460 aa  596  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.140706  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3280  Phosphomannomutase  57.47 
 
 
454 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1118  phosphomannomutase  56.85 
 
 
454 aa  574  1.0000000000000001e-162  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000519382  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2622  phosphomannomutase  58.23 
 
 
463 aa  566  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1779  phosphomannomutase ManB  57.8 
 
 
450 aa  566  1e-160  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1792  phosphomannomutase  57.59 
 
 
450 aa  560  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1134  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain III  56.99 
 
 
450 aa  552  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0747537  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3151  Phosphomannomutase  57.2 
 
 
450 aa  553  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3126  phosphomannomutase  56.3 
 
 
461 aa  553  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141531  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1001  phosphomannomutase  56.94 
 
 
453 aa  547  1e-154  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.834887  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2589  Phosphomannomutase  55.11 
 
 
447 aa  541  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0509  Phosphomannomutase  55.09 
 
 
448 aa  536  1e-151  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0115906 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0458  phosphomannomutase  54.62 
 
 
450 aa  537  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235202  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0895  Phosphomannomutase  54.83 
 
 
456 aa  535  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310909  hitchhiker  0.000000688858 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1632  phosphomannomutase  54.41 
 
 
462 aa  533  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1525  phosphomannomutase  54.41 
 
 
462 aa  533  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1738  phosphomannomutase  54.41 
 
 
462 aa  533  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0922588  hitchhiker  0.000796464 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1677  phosphomannomutase  54.28 
 
 
457 aa  522  1e-147  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0835  phosphomannomutase  51.98 
 
 
458 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584316  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1777  phosphomannomutase  53.09 
 
 
453 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2492  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  51.98 
 
 
458 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.211242  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03174  phosphohexose mutase  54.17 
 
 
448 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1384  phosphomannomutase  53.69 
 
 
453 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0863  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  54.32 
 
 
813 aa  516  1.0000000000000001e-145  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0489  Phosphomannomutase  52.64 
 
 
493 aa  510  1e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1093  Phosphomannomutase  51.98 
 
 
448 aa  510  1e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0200  phosphomannomutase  52.18 
 
 
449 aa  507  9.999999999999999e-143  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2109  Phosphomannomutase  52.91 
 
 
467 aa  506  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.221501  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0229  phosphomannomutase  52.18 
 
 
449 aa  505  9.999999999999999e-143  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0274  phosphomannomutase  51.23 
 
 
487 aa  503  1e-141  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000825  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2255  Phosphomannomutase  53.86 
 
 
450 aa  498  1e-140  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0395092  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0414  Phosphomannomutase  49.29 
 
 
473 aa  486  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0111  phosphomannomutase  50 
 
 
493 aa  477  1e-133  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0120  phosphomannomutase  48.58 
 
 
497 aa  476  1e-133  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1900  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  47.6 
 
 
456 aa  449  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.662048  hitchhiker  0.0000555961 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0831  phosphomannomutase  45.76 
 
 
451 aa  441  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.975214  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01918  hypothetical protein  68.21 
 
 
282 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0585  Phosphomannomutase  40.66 
 
 
447 aa  348  1e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.681403  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4694  phosphomannomutase  38.54 
 
 
446 aa  337  1.9999999999999998e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1134  phosphomannomutase  38.17 
 
 
472 aa  325  1e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.579862  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1218  phosphomannomutase  37.53 
 
 
448 aa  318  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0459323  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4124  phosphomannomutase  37.96 
 
 
448 aa  317  3e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0756  Phosphomannomutase  38.33 
 
 
451 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.0777802 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3174  Phosphomannomutase  35.88 
 
 
456 aa  306  7e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2432  Fis family transcriptional regulator  35.83 
 
 
444 aa  299  7e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5858  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  38.2 
 
 
453 aa  299  9e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4298  Phosphomannomutase  36.49 
 
 
454 aa  298  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1432  Phosphomannomutase  36.55 
 
 
453 aa  296  4e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0751  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  36.95 
 
 
452 aa  295  9e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.648752  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0898  phosphomannomutase  37.85 
 
 
461 aa  293  3e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.478971  normal  0.0385997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1387  Phosphomannomutase  36.58 
 
 
450 aa  291  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0818  Phosphomannomutase  36.96 
 
 
472 aa  289  9e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4063  Phosphomannomutase  37.55 
 
 
456 aa  289  1e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0919518  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4168  Phosphomannomutase  36.96 
 
 
471 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.400371  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0671  phosphomannomutase  37.17 
 
 
475 aa  286  7e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.828766  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3760  Phosphomannomutase  34.5 
 
 
453 aa  286  7e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.343268  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6327  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  37.39 
 
 
450 aa  284  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.428689  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2510  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  35.34 
 
 
455 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08560  phosphomannomutase  36.11 
 
 
487 aa  283  4.0000000000000003e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.749123 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31020  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  37.63 
 
 
451 aa  281  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815121  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3841  Phosphomannomutase  35.12 
 
 
497 aa  280  5e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.062306 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0465  phosphomannomutase  36.65 
 
 
454 aa  280  6e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441417  normal  0.856635 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0961  phosphomannomutase  38.06 
 
 
461 aa  278  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.386078 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1768  Phosphomannomutase  35.73 
 
 
451 aa  278  2e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7604  Phosphomannomutase  37.77 
 
 
449 aa  270  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.908268 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1425  phosphomannomutase  35.04 
 
 
469 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.896243  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09120  phosphomannomutase  34.37 
 
 
529 aa  270  5e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.187509 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03540  phosphomannomutase  35.17 
 
 
491 aa  270  5e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13286  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  35.77 
 
 
465 aa  269  8e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.489635 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3585  Phosphomannomutase  34.61 
 
 
479 aa  268  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1737  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  34.76 
 
 
464 aa  269  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.847298  normal  0.689022 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1856  Phosphomannomutase  34.5 
 
 
502 aa  267  4e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114337  decreased coverage  0.00605536 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1952  phosphomannomutase  37.68 
 
 
414 aa  264  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.322718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>