More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1593 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01932  Phosphomannomutase  97.79 
 
 
454 aa  916    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01954  phosphomannomutase  99.12 
 
 
456 aa  931    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0099894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1609  Phosphomannomutase  99.56 
 
 
456 aa  935    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000012475  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1593  phosphomannomutase  100 
 
 
456 aa  938    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.014113  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2982  phosphomannomutase  99.12 
 
 
456 aa  934    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000140295 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0302  phosphomannomutase  66.37 
 
 
470 aa  643    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1600  phosphomannomutase  76.92 
 
 
455 aa  740    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0455813  normal  0.713517 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2286  phosphomannomutase  89.25 
 
 
456 aa  858    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000657815 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2337  phosphomannomutase  89.47 
 
 
456 aa  860    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113042  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1014  phosphomannomutase  99.56 
 
 
456 aa  937    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2964  phosphomannomutase  98.65 
 
 
456 aa  906    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000327344 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3037  phosphomannomutase  74.01 
 
 
457 aa  724    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.848364  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2851  Phosphomannomutase  71.49 
 
 
457 aa  686    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01943  hypothetical protein  99.12 
 
 
456 aa  931    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00870446  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2340  phosphomannomutase  98.46 
 
 
456 aa  928    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2643  phosphomannomutase  87.28 
 
 
457 aa  837    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320582  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2330  phosphomannomutase  89.25 
 
 
456 aa  854    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0469689 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2662  phosphomannomutase  87.94 
 
 
456 aa  844    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0392975  normal  0.829535 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3178  phosphomannomutase  74.23 
 
 
457 aa  728    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1793  phosphomannomutase  64.93 
 
 
481 aa  652    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00302913  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2229  phosphomannomutase  88.6 
 
 
456 aa  850    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117299  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2172  phosphomannomutase  77.01 
 
 
460 aa  715    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.140706  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1118  phosphomannomutase  68.42 
 
 
454 aa  662    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000519382  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2622  phosphomannomutase  67.1 
 
 
463 aa  646    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1184  phosphomannomutase  98.9 
 
 
456 aa  931    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1256  phosphomannomutase  74.23 
 
 
457 aa  727    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000453708  hitchhiker  0.000000000293956 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2444  phosphomannomutase  89.04 
 
 
456 aa  853    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188854 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1317  Phosphomannomutase  72.37 
 
 
457 aa  712    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.214391  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3151  Phosphomannomutase  65.49 
 
 
450 aa  624  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1792  phosphomannomutase  65.05 
 
 
450 aa  620  1e-176  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3280  Phosphomannomutase  64.38 
 
 
454 aa  618  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01868  phosphomannomutase  61.75 
 
 
486 aa  619  1e-176  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203499  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1134  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain III  64.25 
 
 
450 aa  617  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0747537  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1779  phosphomannomutase ManB  64.47 
 
 
450 aa  613  9.999999999999999e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2589  Phosphomannomutase  63.41 
 
 
447 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00966  phosphomannomutase  60.21 
 
 
486 aa  597  1e-169  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17998  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3126  phosphomannomutase  60.89 
 
 
461 aa  595  1e-169  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141531  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1001  phosphomannomutase  62.03 
 
 
453 aa  597  1e-169  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.834887  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1525  phosphomannomutase  60.09 
 
 
462 aa  582  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1738  phosphomannomutase  60.09 
 
 
462 aa  582  1.0000000000000001e-165  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0922588  hitchhiker  0.000796464 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1632  phosphomannomutase  60.09 
 
 
462 aa  582  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0895  Phosphomannomutase  60.93 
 
 
456 aa  579  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310909  hitchhiker  0.000000688858 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01918  hypothetical protein  96.1 
 
 
282 aa  567  1e-160  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0863  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  60.39 
 
 
813 aa  565  1e-160  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2255  Phosphomannomutase  60.18 
 
 
450 aa  558  1e-158  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0395092  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1777  phosphomannomutase  59.91 
 
 
453 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0509  Phosphomannomutase  60.04 
 
 
448 aa  556  1e-157  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0115906 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1384  phosphomannomutase  60.13 
 
 
453 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1677  phosphomannomutase  56.8 
 
 
457 aa  550  1e-155  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0458  phosphomannomutase  57.91 
 
 
450 aa  545  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235202  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0274  phosphomannomutase  55.87 
 
 
487 aa  542  1e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000825  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03174  phosphohexose mutase  58.31 
 
 
448 aa  539  9.999999999999999e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0489  Phosphomannomutase  54.93 
 
 
493 aa  535  1e-151  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0200  phosphomannomutase  57.17 
 
 
449 aa  535  1e-151  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2109  Phosphomannomutase  56.69 
 
 
467 aa  534  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.221501  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0835  phosphomannomutase  57.49 
 
 
458 aa  532  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584316  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0229  phosphomannomutase  56.95 
 
 
449 aa  534  1e-150  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1093  Phosphomannomutase  56.07 
 
 
448 aa  531  1e-150  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2492  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  57.49 
 
 
458 aa  529  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.211242  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0120  phosphomannomutase  52.97 
 
 
497 aa  517  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0111  phosphomannomutase  52.49 
 
 
493 aa  507  9.999999999999999e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1900  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  50.22 
 
 
456 aa  476  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.662048  hitchhiker  0.0000555961 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0414  Phosphomannomutase  53.12 
 
 
473 aa  473  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0831  phosphomannomutase  49.78 
 
 
451 aa  462  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.975214  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4694  phosphomannomutase  43.33 
 
 
446 aa  384  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0585  Phosphomannomutase  42.44 
 
 
447 aa  380  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.681403  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1218  phosphomannomutase  41.34 
 
 
448 aa  361  2e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0459323  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4124  phosphomannomutase  41.34 
 
 
448 aa  356  3.9999999999999996e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3174  Phosphomannomutase  42.46 
 
 
456 aa  350  4e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1134  phosphomannomutase  40.31 
 
 
472 aa  333  4e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.579862  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01919  hypothetical protein  99.37 
 
 
159 aa  323  3e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2432  Fis family transcriptional regulator  40.35 
 
 
444 aa  322  6e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1768  Phosphomannomutase  42.23 
 
 
451 aa  322  6e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0756  Phosphomannomutase  41.28 
 
 
451 aa  320  3e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.0777802 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0751  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  40.4 
 
 
452 aa  311  2e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.648752  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4063  Phosphomannomutase  40.13 
 
 
456 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0919518  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5858  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  40.53 
 
 
453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1387  Phosphomannomutase  38.84 
 
 
450 aa  303  4.0000000000000003e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3760  Phosphomannomutase  37.69 
 
 
453 aa  298  9e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.343268  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0465  phosphomannomutase  38.53 
 
 
454 aa  298  9e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441417  normal  0.856635 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1432  Phosphomannomutase  37.86 
 
 
453 aa  298  1e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6327  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  39.64 
 
 
450 aa  297  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.428689  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1187  Phosphomannomutase  39.55 
 
 
456 aa  296  6e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.485619  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1425  phosphomannomutase  37.64 
 
 
469 aa  295  9e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.896243  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4298  Phosphomannomutase  38.18 
 
 
454 aa  291  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31020  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  39.35 
 
 
451 aa  289  6e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815121  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2510  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  38.17 
 
 
455 aa  288  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0671  phosphomannomutase  38.06 
 
 
475 aa  288  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.828766  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7604  Phosphomannomutase  39.72 
 
 
449 aa  288  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.908268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6010  Phosphomannomutase  41.06 
 
 
454 aa  288  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.30884  normal  0.056179 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1737  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  38.64 
 
 
464 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.847298  normal  0.689022 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0818  Phosphomannomutase  38.18 
 
 
472 aa  283  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3841  Phosphomannomutase  37.5 
 
 
497 aa  283  4.0000000000000003e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.062306 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0898  phosphomannomutase  37.41 
 
 
461 aa  283  6.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.478971  normal  0.0385997 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08560  phosphomannomutase  38.51 
 
 
487 aa  281  2e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.749123 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3585  Phosphomannomutase  37.39 
 
 
479 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1364  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  38.3 
 
 
465 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.176475  normal  0.655061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1328  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  38.3 
 
 
465 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23364  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1345  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  38.3 
 
 
465 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09120  phosphomannomutase  38.04 
 
 
529 aa  274  3e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.187509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>