More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2109 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2109  Phosphomannomutase  100 
 
 		 467 aa  958    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.221501  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1792  phosphomannomutase  60.78 
 
 		 450 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3126  phosphomannomutase  59.83 
 
 		 461 aa  568  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141531  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2589  Phosphomannomutase  59.7 
 
 		 447 aa  566  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0509  Phosphomannomutase  60.3 
 
 		 448 aa  562  1.0000000000000001e-159  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0115906 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1779  phosphomannomutase ManB  59.91 
 
 		 450 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0229  phosphomannomutase  59.1 
 
 		 449 aa  561  1e-158  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03174  phosphohexose mutase  58.89 
 
 		 448 aa  558  1e-158  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3151  Phosphomannomutase  61.12 
 
 		 450 aa  560  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0200  phosphomannomutase  59.1 
 
 		 449 aa  561  1e-158  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1134  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain III  61.3 
 
 		 450 aa  557  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0747537  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1677  phosphomannomutase  56.32 
 
 		 457 aa  550  1e-155  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3280  Phosphomannomutase  57.87 
 
 		 454 aa  545  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0895  Phosphomannomutase  57.42 
 
 		 456 aa  546  1e-154  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310909  hitchhiker  0.000000688858 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0863  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  58.13 
 
 		 813 aa  542  1e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2255  Phosphomannomutase  60.6 
 
 		 450 aa  542  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0395092  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1093  Phosphomannomutase  58.33 
 
 		 448 aa  541  1e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2662  phosphomannomutase  57.32 
 
 		 456 aa  543  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0392975  normal  0.829535 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2643  phosphomannomutase  57.75 
 
 		 457 aa  543  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1317  Phosphomannomutase  57.23 
 
 		 457 aa  538  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.214391  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1600  phosphomannomutase  57.51 
 
 		 455 aa  541  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0455813  normal  0.713517 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01932  Phosphomannomutase  56.69 
 
 		 454 aa  535  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1777  phosphomannomutase  58.32 
 
 		 453 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0489  Phosphomannomutase  56.27 
 
 		 493 aa  535  1e-151  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2330  phosphomannomutase  57.87 
 
 		 456 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0469689 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2229  phosphomannomutase  57.96 
 
 		 456 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117299  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2337  phosphomannomutase  57.96 
 
 		 456 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2286  phosphomannomutase  57.75 
 
 		 456 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657815 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1609  Phosphomannomutase  56.38 
 
 		 456 aa  532  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000012475  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1184  phosphomannomutase  55.96 
 
 		 456 aa  531  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2444  phosphomannomutase  57.87 
 
 		 456 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188854 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1014  phosphomannomutase  56.48 
 
 		 456 aa  533  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2982  phosphomannomutase  56.48 
 
 		 456 aa  533  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000140295 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1593  phosphomannomutase  56.69 
 
 		 456 aa  534  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.014113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0458  phosphomannomutase  58.57 
 
 		 450 aa  534  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235202  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01954  phosphomannomutase  55.96 
 
 		 456 aa  530  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0099894  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2964  phosphomannomutase  56.96 
 
 		 456 aa  529  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000327344 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2340  phosphomannomutase  55.53 
 
 		 456 aa  529  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1384  phosphomannomutase  58.41 
 
 		 453 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01943  hypothetical protein  55.96 
 
 		 456 aa  530  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00870446  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0302  phosphomannomutase  56.14 
 
 		 470 aa  526  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3178  phosphomannomutase  57.08 
 
 		 457 aa  525  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1256  phosphomannomutase  57.08 
 
 		 457 aa  524  1e-147  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000453708  hitchhiker  0.000000000293956 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3037  phosphomannomutase  57.08 
 
 		 457 aa  524  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.848364  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1001  phosphomannomutase  54.41 
 
 		 453 aa  520  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.834887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2172  phosphomannomutase  58.19 
 
 		 460 aa  520  1e-146  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.140706  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2851  Phosphomannomutase  58.3 
 
 		 457 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01868  phosphomannomutase  52.91 
 
 		 486 aa  506  9.999999999999999e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203499  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1118  phosphomannomutase  54.06 
 
 		 454 aa  506  9.999999999999999e-143  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000519382  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2622  phosphomannomutase  52.33 
 
 		 463 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1793  phosphomannomutase  51.91 
 
 		 481 aa  498  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00302913  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1632  phosphomannomutase  53.05 
 
 		 462 aa  495  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1738  phosphomannomutase  53.05 
 
 		 462 aa  495  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0922588  hitchhiker  0.000796464 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1525  phosphomannomutase  53.05 
 
 		 462 aa  495  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00966  phosphomannomutase  51.61 
 
 		 486 aa  487  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17998  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0835  phosphomannomutase  51.91 
 
 		 458 aa  472  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584316  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2492  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  51.91 
 
 		 458 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.211242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0831  phosphomannomutase  49.57 
 
 		 451 aa  462  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.975214  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0414  Phosphomannomutase  51.98 
 
 		 473 aa  463  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0274  phosphomannomutase  47.93 
 
 		 487 aa  453  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0120  phosphomannomutase  46.42 
 
 		 497 aa  451  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1900  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  49.89 
 
 		 456 aa  440  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.662048  hitchhiker  0.0000555961 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0111  phosphomannomutase  46.07 
 
 		 493 aa  436  1e-121  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01918  hypothetical protein  61.2 
 
 		 282 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0585  Phosphomannomutase  41.74 
 
 		 447 aa  360  3e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.681403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4694  phosphomannomutase  40.26 
 
 		 446 aa  346  4e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3174  Phosphomannomutase  41.15 
 
 		 456 aa  340  4e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4124  phosphomannomutase  40.86 
 
 		 448 aa  326  5e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1218  phosphomannomutase  40.99 
 
 		 448 aa  324  2e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0459323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1134  phosphomannomutase  39.14 
 
 		 472 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.579862  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0751  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  38.89 
 
 		 452 aa  293  5e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.648752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1768  Phosphomannomutase  38.34 
 
 		 451 aa  292  1e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1387  Phosphomannomutase  40.32 
 
 		 450 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3760  Phosphomannomutase  38.72 
 
 		 453 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.343268  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0756  Phosphomannomutase  39.35 
 
 		 451 aa  286  5e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.0777802 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31020  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  40.65 
 
 		 451 aa  283  4.0000000000000003e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2432  Fis family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 444 aa  282  7.000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5858  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  38.46 
 
 		 453 aa  282  8.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2510  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  37.39 
 
 		 455 aa  279  1e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0465  phosphomannomutase  38.21 
 
 		 454 aa  276  4e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441417  normal  0.856635 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1432  Phosphomannomutase  36.91 
 
 		 453 aa  276  6e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6327  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  38.75 
 
 		 450 aa  275  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.428689  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08560  phosphomannomutase  38.32 
 
 		 487 aa  270  5e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.749123 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1856  Phosphomannomutase  38.1 
 
 		 502 aa  267  2.9999999999999995e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114337  decreased coverage  0.00605536 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4168  Phosphomannomutase  38 
 
 		 471 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.400371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1737  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  37.02 
 
 		 464 aa  266  4e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.847298  normal  0.689022 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09120  phosphomannomutase  36.61 
 
 		 529 aa  265  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.187509 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4298  Phosphomannomutase  37.39 
 
 		 454 aa  263  4.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0818  Phosphomannomutase  38.16 
 
 		 472 aa  263  4.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3841  Phosphomannomutase  36.77 
 
 		 497 aa  263  6e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.062306 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0898  phosphomannomutase  37.21 
 
 		 461 aa  262  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.478971  normal  0.0385997 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0671  phosphomannomutase  37.08 
 
 		 475 aa  262  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.828766  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2542  Phosphomannomutase  36.92 
 
 		 488 aa  260  4e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4063  Phosphomannomutase  38.63 
 
 		 456 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0919518  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13286  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  37.31 
 
 		 465 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.489635 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3585  Phosphomannomutase  39.23 
 
 		 479 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03540  phosphomannomutase  36.95 
 
 		 491 aa  254  3e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7604  Phosphomannomutase  36.97 
 
 		 449 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.908268 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1187  Phosphomannomutase  35.43 
 
 		 456 aa  252  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.485619  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0961  phosphomannomutase  36.8 
 
 		 461 aa  250  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.386078 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>