More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1952 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1952  phosphomannomutase  100 
 
 
414 aa  832    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.322718  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0671  phosphomannomutase  69.83 
 
 
475 aa  581  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.828766  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0818  Phosphomannomutase  69.47 
 
 
472 aa  579  1e-164  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03540  phosphomannomutase  68.2 
 
 
491 aa  570  1e-161  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3841  Phosphomannomutase  65.57 
 
 
497 aa  522  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.062306 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2542  Phosphomannomutase  64.85 
 
 
488 aa  513  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3760  Phosphomannomutase  64.51 
 
 
453 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.343268  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2510  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  63.64 
 
 
455 aa  500  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1856  Phosphomannomutase  62.8 
 
 
502 aa  488  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114337  decreased coverage  0.00605536 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3585  Phosphomannomutase  60.66 
 
 
479 aa  483  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31020  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  64.03 
 
 
451 aa  483  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815121  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7604  Phosphomannomutase  63.31 
 
 
449 aa  481  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.908268 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09120  phosphomannomutase  62.17 
 
 
529 aa  483  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.187509 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4298  Phosphomannomutase  62.02 
 
 
454 aa  481  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6327  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  62.74 
 
 
450 aa  476  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.428689  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0898  phosphomannomutase  62.41 
 
 
461 aa  476  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.478971  normal  0.0385997 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4063  Phosphomannomutase  65.31 
 
 
456 aa  472  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0919518  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1387  Phosphomannomutase  62.98 
 
 
450 aa  473  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0756  Phosphomannomutase  63.22 
 
 
451 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.0777802 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08560  phosphomannomutase  62.06 
 
 
487 aa  464  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.749123 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0961  phosphomannomutase  62.65 
 
 
461 aa  463  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.386078 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4168  Phosphomannomutase  63.25 
 
 
471 aa  458  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.400371  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1187  Phosphomannomutase  60.34 
 
 
456 aa  459  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.485619  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6010  Phosphomannomutase  60.82 
 
 
454 aa  457  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.30884  normal  0.056179 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0751  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  60.1 
 
 
452 aa  449  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.648752  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1425  phosphomannomutase  60.29 
 
 
469 aa  449  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.896243  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0465  phosphomannomutase  61.72 
 
 
454 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441417  normal  0.856635 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5858  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  61.93 
 
 
453 aa  444  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13286  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  59.95 
 
 
465 aa  433  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.489635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1328  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  59.62 
 
 
465 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23364  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1364  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  59.62 
 
 
465 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.176475  normal  0.655061 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1345  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  59.62 
 
 
465 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1737  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  60 
 
 
464 aa  428  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.847298  normal  0.689022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4726  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  59.22 
 
 
465 aa  423  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.267989  normal  0.336703 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20740  phosphomannomutase  55.64 
 
 
592 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00626227  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1134  phosphomannomutase  49.4 
 
 
472 aa  391  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.579862  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1768  Phosphomannomutase  50.61 
 
 
451 aa  376  1e-103  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0585  Phosphomannomutase  41.59 
 
 
447 aa  302  6.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.681403  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4694  phosphomannomutase  40.82 
 
 
446 aa  302  9e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2432  Fis family transcriptional regulator  44.5 
 
 
444 aa  280  4e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1317  Phosphomannomutase  40.24 
 
 
457 aa  279  6e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.214391  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3151  Phosphomannomutase  40.45 
 
 
450 aa  279  8e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0302  phosphomannomutase  39.04 
 
 
470 aa  278  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1218  phosphomannomutase  41.11 
 
 
448 aa  276  3e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0459323  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1792  phosphomannomutase  40.91 
 
 
450 aa  277  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1256  phosphomannomutase  38.76 
 
 
457 aa  275  9e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000453708  hitchhiker  0.000000000293956 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4124  phosphomannomutase  40.87 
 
 
448 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3037  phosphomannomutase  38.66 
 
 
457 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.848364  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3178  phosphomannomutase  38.66 
 
 
457 aa  275  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1134  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain III  39.8 
 
 
450 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0747537  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1779  phosphomannomutase ManB  39.71 
 
 
450 aa  273  5.000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0863  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  41.23 
 
 
813 aa  271  1e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2643  phosphomannomutase  39.81 
 
 
457 aa  271  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320582  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1432  Phosphomannomutase  41.25 
 
 
453 aa  271  2e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2589  Phosphomannomutase  39.28 
 
 
447 aa  271  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01868  phosphomannomutase  37.39 
 
 
486 aa  271  2e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203499  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3174  Phosphomannomutase  40.14 
 
 
456 aa  270  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2662  phosphomannomutase  40.19 
 
 
456 aa  269  7e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0392975  normal  0.829535 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0895  Phosphomannomutase  40.3 
 
 
456 aa  269  8e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310909  hitchhiker  0.000000688858 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1793  phosphomannomutase  36.79 
 
 
481 aa  268  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00302913  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0458  phosphomannomutase  37.56 
 
 
450 aa  267  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235202  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1600  phosphomannomutase  38.26 
 
 
455 aa  266  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0455813  normal  0.713517 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3126  phosphomannomutase  37.71 
 
 
461 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141531  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1093  Phosphomannomutase  39.81 
 
 
448 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0229  phosphomannomutase  40 
 
 
449 aa  263  4.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0200  phosphomannomutase  40 
 
 
449 aa  263  6e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03174  phosphohexose mutase  40.1 
 
 
448 aa  262  6.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1118  phosphomannomutase  37.08 
 
 
454 aa  262  8e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000519382  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2337  phosphomannomutase  39.13 
 
 
456 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113042  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0509  Phosphomannomutase  40.44 
 
 
448 aa  258  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0115906 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2330  phosphomannomutase  39.13 
 
 
456 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0469689 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2444  phosphomannomutase  38.89 
 
 
456 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188854 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2622  phosphomannomutase  37.35 
 
 
463 aa  257  3e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3280  Phosphomannomutase  38.94 
 
 
454 aa  257  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00966  phosphomannomutase  36.85 
 
 
486 aa  257  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17998  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1184  phosphomannomutase  37.68 
 
 
456 aa  256  5e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2229  phosphomannomutase  38.89 
 
 
456 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117299  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2286  phosphomannomutase  38.65 
 
 
456 aa  256  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000657815 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2340  phosphomannomutase  37.44 
 
 
456 aa  256  7e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01954  phosphomannomutase  37.44 
 
 
456 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0099894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1609  Phosphomannomutase  37.44 
 
 
456 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000012475  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01943  hypothetical protein  37.44 
 
 
456 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00870446  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0414  Phosphomannomutase  40.79 
 
 
473 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1632  phosphomannomutase  36.3 
 
 
462 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1738  phosphomannomutase  36.3 
 
 
462 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0922588  hitchhiker  0.000796464 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1525  phosphomannomutase  36.3 
 
 
462 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01932  Phosphomannomutase  37.32 
 
 
454 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1014  phosphomannomutase  37.44 
 
 
456 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2255  Phosphomannomutase  41.01 
 
 
450 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0395092  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2851  Phosphomannomutase  39.6 
 
 
457 aa  253  5.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1593  phosphomannomutase  37.44 
 
 
456 aa  252  8.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.014113  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2982  phosphomannomutase  37.29 
 
 
456 aa  252  9.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000140295 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2964  phosphomannomutase  38 
 
 
456 aa  251  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000327344 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2172  phosphomannomutase  39.51 
 
 
460 aa  251  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.140706  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1677  phosphomannomutase  37.26 
 
 
457 aa  250  3e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1384  phosphomannomutase  40.93 
 
 
453 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2109  Phosphomannomutase  38.7 
 
 
467 aa  248  1e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.221501  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0835  phosphomannomutase  39.2 
 
 
458 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584316  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1777  phosphomannomutase  40.4 
 
 
453 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1900  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  41.46 
 
 
456 aa  244  3e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.662048  hitchhiker  0.0000555961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>