More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1118 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01932  Phosphomannomutase  69.32 
 
 
454 aa  660    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01954  phosphomannomutase  68.2 
 
 
456 aa  658    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0099894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1609  Phosphomannomutase  68.2 
 
 
456 aa  660    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000012475  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2643  phosphomannomutase  68.86 
 
 
457 aa  666    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320582  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2229  phosphomannomutase  68.86 
 
 
456 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117299  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1317  Phosphomannomutase  68.42 
 
 
457 aa  659    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.214391  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2340  phosphomannomutase  68.2 
 
 
456 aa  659    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2964  phosphomannomutase  69.3 
 
 
456 aa  653    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000327344 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1184  phosphomannomutase  67.98 
 
 
456 aa  658    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2337  phosphomannomutase  68.86 
 
 
456 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113042  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1593  phosphomannomutase  68.42 
 
 
456 aa  662    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.014113  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3037  phosphomannomutase  67.98 
 
 
457 aa  661    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.848364  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1256  phosphomannomutase  68.2 
 
 
457 aa  663    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000453708  hitchhiker  0.000000000293956 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01943  hypothetical protein  68.2 
 
 
456 aa  658    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00870446  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2662  phosphomannomutase  68.86 
 
 
456 aa  670    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0392975  normal  0.829535 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1118  phosphomannomutase  100 
 
 
454 aa  935    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000519382  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2982  phosphomannomutase  68.64 
 
 
456 aa  663    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000140295 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2444  phosphomannomutase  68.2 
 
 
456 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188854 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1014  phosphomannomutase  68.64 
 
 
456 aa  664    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2286  phosphomannomutase  68.86 
 
 
456 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000657815 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1600  phosphomannomutase  69.89 
 
 
455 aa  669    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0455813  normal  0.713517 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2172  phosphomannomutase  68.75 
 
 
460 aa  641    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.140706  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2330  phosphomannomutase  68.42 
 
 
456 aa  659    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0469689 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3178  phosphomannomutase  68.42 
 
 
457 aa  666    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0302  phosphomannomutase  64.62 
 
 
470 aa  628  1e-179  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2851  Phosphomannomutase  66.23 
 
 
457 aa  629  1e-179  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3280  Phosphomannomutase  62.53 
 
 
454 aa  616  1e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2622  phosphomannomutase  63.91 
 
 
463 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1779  phosphomannomutase ManB  62.61 
 
 
450 aa  607  9.999999999999999e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1792  phosphomannomutase  62.61 
 
 
450 aa  605  9.999999999999999e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1134  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain III  62.78 
 
 
450 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0747537  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3151  Phosphomannomutase  62.39 
 
 
450 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1793  phosphomannomutase  58.75 
 
 
481 aa  594  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00302913  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2589  Phosphomannomutase  61.25 
 
 
447 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01868  phosphomannomutase  56.85 
 
 
486 aa  574  1.0000000000000001e-162  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203499  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1525  phosphomannomutase  58.82 
 
 
462 aa  572  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1632  phosphomannomutase  58.82 
 
 
462 aa  572  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1738  phosphomannomutase  58.82 
 
 
462 aa  572  1.0000000000000001e-162  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0922588  hitchhiker  0.000796464 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0274  phosphomannomutase  58.61 
 
 
487 aa  569  1e-161  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000825  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00966  phosphomannomutase  57.26 
 
 
486 aa  564  1.0000000000000001e-159  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17998  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0863  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  58.72 
 
 
813 aa  551  1e-155  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3126  phosphomannomutase  56.79 
 
 
461 aa  551  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141531  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2255  Phosphomannomutase  58.57 
 
 
450 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0395092  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0120  phosphomannomutase  55.98 
 
 
497 aa  540  9.999999999999999e-153  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0895  Phosphomannomutase  56.22 
 
 
456 aa  537  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310909  hitchhiker  0.000000688858 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0509  Phosphomannomutase  57.08 
 
 
448 aa  532  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0115906 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1001  phosphomannomutase  54.77 
 
 
453 aa  533  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.834887  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03174  phosphohexose mutase  57.33 
 
 
448 aa  533  1e-150  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0458  phosphomannomutase  56.42 
 
 
450 aa  533  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235202  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1777  phosphomannomutase  56.76 
 
 
453 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0111  phosphomannomutase  54.86 
 
 
493 aa  526  1e-148  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0229  phosphomannomutase  56.58 
 
 
449 aa  524  1e-147  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0200  phosphomannomutase  56.58 
 
 
449 aa  524  1e-147  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1384  phosphomannomutase  56.57 
 
 
453 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0835  phosphomannomutase  54.63 
 
 
458 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584316  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1093  Phosphomannomutase  53.98 
 
 
448 aa  514  1e-144  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1677  phosphomannomutase  53.29 
 
 
457 aa  508  1e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2492  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  54.41 
 
 
458 aa  511  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.211242  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2109  Phosphomannomutase  54.06 
 
 
467 aa  506  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.221501  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0489  Phosphomannomutase  50.51 
 
 
493 aa  484  1e-135  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1900  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  48.79 
 
 
456 aa  472  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.662048  hitchhiker  0.0000555961 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0414  Phosphomannomutase  48.82 
 
 
473 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0831  phosphomannomutase  48.22 
 
 
451 aa  458  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.975214  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01918  hypothetical protein  69.15 
 
 
282 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4694  phosphomannomutase  41.07 
 
 
446 aa  359  7e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0585  Phosphomannomutase  39.87 
 
 
447 aa  355  6.999999999999999e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.681403  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1218  phosphomannomutase  40.37 
 
 
448 aa  341  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0459323  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3174  Phosphomannomutase  38.86 
 
 
456 aa  340  2e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4124  phosphomannomutase  38.89 
 
 
448 aa  333  5e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1768  Phosphomannomutase  41.02 
 
 
451 aa  332  1e-89  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1134  phosphomannomutase  39.96 
 
 
472 aa  328  8e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.579862  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0671  phosphomannomutase  40.04 
 
 
475 aa  316  5e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.828766  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0756  Phosphomannomutase  39.87 
 
 
451 aa  312  6.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.0777802 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0818  Phosphomannomutase  39.83 
 
 
472 aa  312  7.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3760  Phosphomannomutase  37.72 
 
 
453 aa  311  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.343268  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4063  Phosphomannomutase  40.13 
 
 
456 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0919518  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0465  phosphomannomutase  39.25 
 
 
454 aa  307  3e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441417  normal  0.856635 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2510  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  39.11 
 
 
455 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4298  Phosphomannomutase  37.06 
 
 
454 aa  301  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6327  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  37.89 
 
 
450 aa  299  7e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.428689  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1387  Phosphomannomutase  38.14 
 
 
450 aa  299  7e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2542  Phosphomannomutase  35.92 
 
 
488 aa  297  2e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3841  Phosphomannomutase  37.32 
 
 
497 aa  296  4e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.062306 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09120  phosphomannomutase  37.32 
 
 
529 aa  295  9e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.187509 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0751  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  38.44 
 
 
452 aa  295  1e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.648752  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31020  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  38.56 
 
 
451 aa  292  7e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815121  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2432  Fis family transcriptional regulator  37.05 
 
 
444 aa  292  1e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1187  Phosphomannomutase  36.11 
 
 
456 aa  290  4e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.485619  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08560  phosphomannomutase  36.97 
 
 
487 aa  289  9e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.749123 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5858  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  37.86 
 
 
453 aa  286  5e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1432  Phosphomannomutase  37.14 
 
 
453 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1856  Phosphomannomutase  35.45 
 
 
502 aa  283  3.0000000000000004e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114337  decreased coverage  0.00605536 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4168  Phosphomannomutase  37.63 
 
 
471 aa  281  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.400371  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7604  Phosphomannomutase  36.46 
 
 
449 aa  281  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.908268 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1425  phosphomannomutase  36.24 
 
 
469 aa  278  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.896243  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1364  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  36.69 
 
 
465 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.176475  normal  0.655061 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3585  Phosphomannomutase  36.08 
 
 
479 aa  277  3e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03540  phosphomannomutase  35.62 
 
 
491 aa  276  4e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1328  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  36.69 
 
 
465 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23364  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1345  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  36.69 
 
 
465 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.701993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>