More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2716 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_2497  phosphomannomutase  71.06 
 
 
485 aa  677    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.679752  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3119  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  71.49 
 
 
472 aa  664    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14281  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0691  putative phosphomannomutase or phosphoglucomutase protein  83.95 
 
 
461 aa  811    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0002556  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2191  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  71.27 
 
 
472 aa  662    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.738295  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0783  phosphomannomutase  70.63 
 
 
464 aa  649    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0745  phosphomannomutase  91.54 
 
 
461 aa  869    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0920  Phosphomannomutase  70.19 
 
 
464 aa  675    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3143  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  71.27 
 
 
464 aa  663    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3990  phosphomannomutase  71.92 
 
 
464 aa  661    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.047705 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2267  phosphomannomutase  69.98 
 
 
464 aa  673    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434508  normal  0.220531 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0863  phosphomannomutase  71.06 
 
 
464 aa  654    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1489  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  71.06 
 
 
464 aa  657    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0374748  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3701  phosphomannomutase  70.84 
 
 
464 aa  678    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2064  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  71.27 
 
 
464 aa  662    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.020226  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0781  Phosphomannomutase  73.32 
 
 
461 aa  721    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2716  phosphomannomutase  100 
 
 
461 aa  939    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541607  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0414  phosphomannomutase  71.06 
 
 
489 aa  656    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1092  phosphomannomutase  73.54 
 
 
461 aa  711    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0641  Phosphomannomutase  81.74 
 
 
462 aa  793    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0772  phosphomannomutase  70.63 
 
 
487 aa  651    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0893  phosphomannomutase  71.06 
 
 
489 aa  656    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498123  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2550  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  71.27 
 
 
464 aa  662    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0600  Phosphomannomutase  81.74 
 
 
462 aa  793    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106733  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3083  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  71.49 
 
 
472 aa  664    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835798  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0716  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  71.27 
 
 
961 aa  663    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3299  phosphomannomutase  66.3 
 
 
458 aa  627  1e-179  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230097 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2138  phosphomannomutase  65.02 
 
 
457 aa  629  1e-179  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1921  phosphomannomutase  64.43 
 
 
457 aa  620  1e-176  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1062  phosphomannomutase  62.53 
 
 
469 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2141  phosphomannomutase  63.12 
 
 
463 aa  593  1e-168  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1206  Phosphomannomutase  63.77 
 
 
465 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1108  phosphomannomutase  60.7 
 
 
460 aa  575  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1639  phosphomannomutase  59.65 
 
 
461 aa  569  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.306168 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3725  Phosphomannomutase  60.65 
 
 
460 aa  570  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1830  Phosphomannomutase  60.61 
 
 
462 aa  565  1e-160  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325101  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3964  phosphomannomutase  60.82 
 
 
462 aa  564  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.234927 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2021  phosphomannomutase  60.61 
 
 
462 aa  565  1e-160  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.155894  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2999  phosphomannomutase  58.63 
 
 
475 aa  548  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2994  phosphomannomutase  56.59 
 
 
468 aa  543  1e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2822  phosphomannomutase  60.09 
 
 
486 aa  544  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2559  phosphomannomutase  58.75 
 
 
460 aa  535  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.344329  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2782  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  57.48 
 
 
463 aa  529  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2443  phosphomannomutase  57.75 
 
 
472 aa  531  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.299376 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2845  phosphomannomutase  57.27 
 
 
469 aa  530  1e-149  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.301586  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02910  Phosphomannomutase/phosphoglucomutase AlgC  54.7 
 
 
488 aa  521  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5288  phosphomannomutase  54.27 
 
 
463 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6098  phosphomannomutase AlgC  54.05 
 
 
868 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21229  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4379  phosphomannomutase  55.48 
 
 
863 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.124617 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5197  phosphomannomutase  54.27 
 
 
466 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70270  phosphomannomutase AlgC  54.05 
 
 
854 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0183  phosphomannomutase  54.05 
 
 
465 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12891  decreased coverage  0.0000000447524 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5338  phosphomannomutase  53.83 
 
 
466 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00384224 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3561  phosphomannomutase  54.47 
 
 
881 aa  511  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0219  phosphomannomutase  52.95 
 
 
465 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5542  phosphomannomutase  52.74 
 
 
465 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2983  phosphomannomutase  56.1 
 
 
467 aa  506  9.999999999999999e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794325  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02922  phosphomannomutase  54.8 
 
 
782 aa  507  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.919523  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0083  phosphomannomutase AlgC  52.74 
 
 
465 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1905  phosphomannomutase  52.48 
 
 
461 aa  497  1e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.293066  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1786  phosphoglucomutase  52.18 
 
 
471 aa  494  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0399  phosphomannomutase  52.18 
 
 
471 aa  493  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.889065  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0286  Phosphomannomutase  55.08 
 
 
782 aa  488  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.132974 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2297  phosphomannomutase  53.13 
 
 
464 aa  485  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3676  phosphomannomutase  48.31 
 
 
830 aa  427  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.991755  normal  0.132768 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2550  phosphomannomutase  46.97 
 
 
462 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2406  phosphomannomutase  46.97 
 
 
462 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0160  phosphomannomutase  46.09 
 
 
456 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0178  Phosphomannomutase  45.64 
 
 
456 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0167  phosphomannomutase  45.86 
 
 
456 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1175  phosphomannomutase  42.99 
 
 
447 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0166  phosphomannomutase  45.54 
 
 
456 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1398  phosphomannomutase  46.83 
 
 
458 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2154  phosphomannomutase  46 
 
 
449 aa  395  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0481  phosphomannomutase  43.6 
 
 
450 aa  392  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00838826 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0332  phosphomannomutase  44.61 
 
 
469 aa  388  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0113  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  45.2 
 
 
847 aa  386  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0122  Phosphomannomutase  46.33 
 
 
469 aa  384  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0128  phosphomannomutase  45.42 
 
 
495 aa  381  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.142416  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2278  phosphomannomutase  45.25 
 
 
453 aa  376  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.984443  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1021  phosphomannomutase  45.29 
 
 
472 aa  375  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2945  phosphomannomutase  43.24 
 
 
457 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2673  Phosphomannomutase  44.44 
 
 
464 aa  371  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00943387 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2238  phosphomannomutase  42.04 
 
 
455 aa  366  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.119559  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0485  Phosphomannomutase  42.92 
 
 
466 aa  363  3e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1915  phosphomannomutase  44.18 
 
 
453 aa  362  8e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3001  phosphomannomutase  44.24 
 
 
460 aa  361  2e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.324631  normal  0.16456 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0045  phosphomannomutase  44.34 
 
 
467 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109324  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0362  Phosphomannomutase  40.13 
 
 
474 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3316  phosphomannomutase  42.98 
 
 
467 aa  353  4e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0468  Phosphomannomutase  40.88 
 
 
462 aa  350  3e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.489238  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0067  Phosphomannomutase  39.09 
 
 
475 aa  349  5e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2791  phosphomannomutase  42.63 
 
 
460 aa  349  7e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.677839 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1242  Phosphomannomutase  41.24 
 
 
469 aa  348  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2720  phosphomannomutase  43.74 
 
 
468 aa  348  2e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2652  phosphomannomutase  43.51 
 
 
469 aa  345  1e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1993  Phosphomannomutase  42.36 
 
 
459 aa  342  1e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00229621 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5049  Phosphomannomutase  39.96 
 
 
479 aa  327  3e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.721342  normal  0.477893 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0623  phosphomannomutase  38.07 
 
 
452 aa  309  5.9999999999999995e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1799  Phosphomannomutase  37.96 
 
 
456 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0306  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  35.59 
 
 
455 aa  294  2e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0317157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>