More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2174 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2658  integrase catalytic subunit  99.81 
 
 		 523 aa  1095    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2653  integrase catalytic subunit  99.81 
 
 		 523 aa  1095    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2384  integrase catalytic subunit  99.81 
 
 		 523 aa  1095    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2321  integrase catalytic subunit  99.81 
 
 		 523 aa  1095    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0179767  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2568  integrase catalytic subunit  99.81 
 
 		 523 aa  1095    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.467785  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0716  Integrase catalytic region  93.5 
 
 		 524 aa  1022    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.323373  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0008  integrase catalytic subunit  99.81 
 
 		 523 aa  1095    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0076  integrase catalytic subunit  99.81 
 
 		 523 aa  1095    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0273  integrase catalytic subunit  99.81 
 
 		 523 aa  1095    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0328  integrase catalytic subunit  99.81 
 
 		 523 aa  1095    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.67866  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0642  integrase catalytic subunit  99.81 
 
 		 523 aa  1095    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1136  integrase catalytic subunit  99.81 
 
 		 523 aa  1095    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.728344  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1281  integrase catalytic subunit  99.62 
 
 		 523 aa  1092    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.942736  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1348  integrase catalytic subunit  99.81 
 
 		 523 aa  1095    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.554323  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1452  integrase catalytic subunit  99.81 
 
 		 523 aa  1095    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.618875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1557  integrase catalytic subunit  99.62 
 
 		 523 aa  1092    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124198  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1751  integrase catalytic subunit  99.81 
 
 		 523 aa  1095    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2041  integrase catalytic subunit  99.81 
 
 		 523 aa  1095    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00623438  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2110  integrase catalytic subunit  99.81 
 
 		 523 aa  1095    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.728344  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2174  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 523 aa  1097    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.377816  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2211  integrase catalytic subunit  99.81 
 
 		 523 aa  1095    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2309  integrase catalytic subunit  99.81 
 
 		 523 aa  1095    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1530  integrase catalytic subunit  32.05 
 
 		 523 aa  200  7e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2334  integrase catalytic subunit  32.05 
 
 		 523 aa  200  7e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0026  integrase catalytic subunit  28.22 
 
 		 512 aa  174  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2216  integrase catalytic subunit  28.22 
 
 		 512 aa  174  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1296  integrase catalytic subunit  28.22 
 
 		 512 aa  174  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.709062  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0737  transposase (22)  36.33 
 
 		 253 aa  169  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1457  integrase  29.46 
 
 		 410 aa  143  8e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5106  integrase catalytic subunit  28.42 
 
 		 431 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214322  normal  0.182706 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2452  integrase catalytic region  28.39 
 
 		 427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1510  integrase catalytic region  28.39 
 
 		 427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2798  integrase catalytic region  28.39 
 
 		 427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7013  hypothetical protein  28.39 
 
 		 427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6916  integrase catalytic region  28.39 
 
 		 427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1464  integrase catalytic region  28.39 
 
 		 427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5534  integrase catalytic region  28.39 
 
 		 427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4700  integrase catalytic region  28.39 
 
 		 427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3888  integrase catalytic region  28.39 
 
 		 427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0210  transposase, IS21 family  27.2 
 
 		 417 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000847159 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1009  integrase catalytic subunit  28.91 
 
 		 412 aa  130  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00535974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1319  integrase catalytic subunit  28.91 
 
 		 412 aa  130  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2854  integrase catalytic subunit  28.91 
 
 		 412 aa  130  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230802  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3717  integrase catalytic subunit  28.65 
 
 		 412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1081  Integrase catalytic region  28.71 
 
 		 449 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333924  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0119  Integrase catalytic region  28.71 
 
 		 449 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1865  Integrase catalytic region  29.18 
 
 		 413 aa  120  7.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2538  integrase catalytic subunit  27.87 
 
 		 424 aa  119  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178355  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1554  Integrase catalytic region  25.84 
 
 		 413 aa  117  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0136  integrase catalytic subunit  29.25 
 
 		 434 aa  116  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2833  integrase catalytic subunit  29.25 
 
 		 434 aa  116  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0624  transposase  31.91 
 
 		 610 aa  108  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337489  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2217  hypothetical protein  26.6 
 
 		 289 aa  108  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0943  Integrase catalytic region  25.78 
 
 		 502 aa  99  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.346378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2939  Integrase catalytic region  25.78 
 
 		 502 aa  98.6  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1791  putative transposase catalytic subunit  27.02 
 
 		 507 aa  97.8  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1052  Integrase catalytic region  26.19 
 
 		 502 aa  97.1  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2874  Integrase catalytic region  26.19 
 
 		 502 aa  96.7  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4855  Integrase catalytic region  26.19 
 
 		 502 aa  96.7  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000769666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4858  Integrase catalytic region  26.19 
 
 		 502 aa  96.7  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0252827  normal  0.0109178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6478  Integrase catalytic region  26.19 
 
 		 507 aa  96.7  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1072  Integrase catalytic region  26.19 
 
 		 502 aa  97.1  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1063  Integrase catalytic region  26.19 
 
 		 502 aa  97.1  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.877216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6440  Integrase catalytic region  28.75 
 
 		 508 aa  95.9  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000175464 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3857  Integrase catalytic region  28.75 
 
 		 508 aa  95.9  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1192  Integrase catalytic region  28.75 
 
 		 508 aa  95.9  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1326  Integrase catalytic region  27.43 
 
 		 425 aa  95.1  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1139  Integrase catalytic region  27.63 
 
 		 474 aa  94.4  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6529  Integrase catalytic region  29.76 
 
 		 512 aa  94.7  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1589  Integrase catalytic region  25.85 
 
 		 502 aa  94.7  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0199  Integrase catalytic region  29.76 
 
 		 512 aa  94.7  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0240231 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1097  Integrase catalytic region  27.63 
 
 		 474 aa  93.2  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.81424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4458  transposase  27.78 
 
 		 442 aa  92.8  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000107543  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4913  integrase catalytic subunit  26.19 
 
 		 428 aa  92  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279769 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5653  integrase catalytic region  26.4 
 
 		 510 aa  92.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6239  integrase catalytic region  26.4 
 
 		 510 aa  92.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0018  integrase catalytic region  26.4 
 
 		 510 aa  92.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4737  integrase catalytic region  26.4 
 
 		 510 aa  92.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2511  integrase catalytic region  26.4 
 
 		 510 aa  92.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2295  integrase catalytic region  26.4 
 
 		 510 aa  92.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3058  Integrase catalytic region  27.06 
 
 		 425 aa  91.3  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3693  Integrase catalytic region  27.06 
 
 		 425 aa  91.3  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1512  Integrase catalytic region  27.06 
 
 		 425 aa  91.3  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1847  integrase catalytic region  25.4 
 
 		 429 aa  90.9  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5624  integrase catalytic region  25.4 
 
 		 429 aa  90.9  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205652  normal  0.723097 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0638  Integrase catalytic region  27.86 
 
 		 504 aa  90.9  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.316321  normal  0.0202803 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1706  integrase catalytic region  25.4 
 
 		 429 aa  90.9  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1264  integrase catalytic subunit  27.66 
 
 		 336 aa  90.5  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0642781  normal  0.0493016 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1563  hypothetical protein  28.12 
 
 		 340 aa  90.1  8e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0020  hypothetical protein  28.12 
 
 		 348 aa  90.1  9e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2884  hypothetical protein  28.12 
 
 		 348 aa  90.1  9e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3160  integrase catalytic region  26.4 
 
 		 408 aa  90.1  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012152 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2854  integrase catalytic region  26.4 
 
 		 408 aa  90.1  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.429143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1024  integrase catalytic region  26.4 
 
 		 408 aa  90.1  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0461677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4926  integrase catalytic region  26.4 
 
 		 408 aa  90.1  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.409648  normal  0.357662 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1968  integrase catalytic region  26.4 
 
 		 408 aa  90.1  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1591  integrase catalytic region  26.4 
 
 		 408 aa  90.1  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379475 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6841  integrase catalytic subunit  27.34 
 
 		 257 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3282  integrase catalytic subunit  28.79 
 
 		 341 aa  88.6  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.590315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2580  integrase catalytic region  26.6 
 
 		 408 aa  88.2  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0415627  normal  0.0862482 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>