More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1751 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2658  integrase catalytic subunit  100 
 
 
523 aa  1097    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2653  integrase catalytic subunit  100 
 
 
523 aa  1097    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2568  integrase catalytic subunit  100 
 
 
523 aa  1097    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.467785  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0716  Integrase catalytic region  93.69 
 
 
524 aa  1024    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.323373  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0008  integrase catalytic subunit  100 
 
 
523 aa  1097    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0076  integrase catalytic subunit  100 
 
 
523 aa  1097    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0273  integrase catalytic subunit  100 
 
 
523 aa  1097    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0328  integrase catalytic subunit  100 
 
 
523 aa  1097    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.67866  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0642  integrase catalytic subunit  100 
 
 
523 aa  1097    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1136  integrase catalytic subunit  100 
 
 
523 aa  1097    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.728344  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1281  integrase catalytic subunit  99.81 
 
 
523 aa  1093    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.942736  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1348  integrase catalytic subunit  100 
 
 
523 aa  1097    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.554323  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1452  integrase catalytic subunit  100 
 
 
523 aa  1097    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.618875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1557  integrase catalytic subunit  99.81 
 
 
523 aa  1093    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124198  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1751  integrase catalytic subunit  100 
 
 
523 aa  1097    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2041  integrase catalytic subunit  100 
 
 
523 aa  1097    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00623438  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2110  integrase catalytic subunit  100 
 
 
523 aa  1097    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.728344  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2174  integrase catalytic subunit  99.81 
 
 
523 aa  1095    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.377816  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2211  integrase catalytic subunit  100 
 
 
523 aa  1097    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2309  integrase catalytic subunit  100 
 
 
523 aa  1097    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2321  integrase catalytic subunit  100 
 
 
523 aa  1097    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0179767  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2384  integrase catalytic subunit  100 
 
 
523 aa  1097    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1530  integrase catalytic subunit  32.05 
 
 
523 aa  200  6e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2334  integrase catalytic subunit  32.05 
 
 
523 aa  200  6e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0026  integrase catalytic subunit  28.22 
 
 
512 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2216  integrase catalytic subunit  28.22 
 
 
512 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1296  integrase catalytic subunit  28.22 
 
 
512 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.709062  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0737  transposase (22)  36.33 
 
 
253 aa  169  8e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1457  integrase  29.72 
 
 
410 aa  144  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5106  integrase catalytic subunit  28.68 
 
 
431 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214322  normal  0.182706 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3888  integrase catalytic region  28.65 
 
 
427 aa  134  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2798  integrase catalytic region  28.65 
 
 
427 aa  134  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5534  integrase catalytic region  28.65 
 
 
427 aa  134  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2452  integrase catalytic region  28.65 
 
 
427 aa  134  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1464  integrase catalytic region  28.65 
 
 
427 aa  134  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7013  hypothetical protein  28.65 
 
 
427 aa  134  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6916  integrase catalytic region  28.65 
 
 
427 aa  134  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4700  integrase catalytic region  28.65 
 
 
427 aa  134  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1510  integrase catalytic region  28.65 
 
 
427 aa  134  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0210  transposase, IS21 family  27.2 
 
 
417 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000847159 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1009  integrase catalytic subunit  28.91 
 
 
412 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00535974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1319  integrase catalytic subunit  28.91 
 
 
412 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2854  integrase catalytic subunit  28.91 
 
 
412 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230802  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3717  integrase catalytic subunit  28.65 
 
 
412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1081  Integrase catalytic region  28.96 
 
 
449 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333924  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0119  Integrase catalytic region  28.96 
 
 
449 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1865  Integrase catalytic region  29.18 
 
 
413 aa  119  9e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2538  integrase catalytic subunit  27.87 
 
 
424 aa  119  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178355  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1554  Integrase catalytic region  26.1 
 
 
413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0136  integrase catalytic subunit  29.55 
 
 
434 aa  117  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324788  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2833  integrase catalytic subunit  29.55 
 
 
434 aa  117  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0624  transposase  32.3 
 
 
610 aa  109  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337489  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2217  hypothetical protein  26.6 
 
 
289 aa  108  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0943  Integrase catalytic region  26.09 
 
 
502 aa  100  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.346378  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2939  Integrase catalytic region  26.09 
 
 
502 aa  100  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620801  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1791  putative transposase catalytic subunit  27.37 
 
 
507 aa  99  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1072  Integrase catalytic region  26.53 
 
 
502 aa  98.2  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1052  Integrase catalytic region  26.53 
 
 
502 aa  98.2  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437105  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2874  Integrase catalytic region  26.53 
 
 
502 aa  98.6  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4855  Integrase catalytic region  26.53 
 
 
502 aa  98.6  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000769666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4858  Integrase catalytic region  26.53 
 
 
502 aa  98.6  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0252827  normal  0.0109178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6478  Integrase catalytic region  26.53 
 
 
507 aa  98.2  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1063  Integrase catalytic region  26.53 
 
 
502 aa  98.6  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.877216  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6440  Integrase catalytic region  28.53 
 
 
508 aa  97.1  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000175464 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3857  Integrase catalytic region  28.53 
 
 
508 aa  97.1  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1192  Integrase catalytic region  28.53 
 
 
508 aa  97.1  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1589  Integrase catalytic region  26.19 
 
 
502 aa  95.9  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1326  Integrase catalytic region  27.73 
 
 
425 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1139  Integrase catalytic region  28.07 
 
 
474 aa  95.9  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650058  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6529  Integrase catalytic region  30.04 
 
 
512 aa  95.9  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277485  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0199  Integrase catalytic region  30.04 
 
 
512 aa  95.9  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0240231 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1097  Integrase catalytic region  28.07 
 
 
474 aa  94.7  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.81424  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4458  transposase  28.06 
 
 
442 aa  94.4  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000107543  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5653  integrase catalytic region  26.8 
 
 
510 aa  94  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2295  integrase catalytic region  26.8 
 
 
510 aa  94  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218611  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2511  integrase catalytic region  26.8 
 
 
510 aa  94  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4737  integrase catalytic region  26.8 
 
 
510 aa  94  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6239  integrase catalytic region  26.8 
 
 
510 aa  94  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0018  integrase catalytic region  26.8 
 
 
510 aa  94  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0638  Integrase catalytic region  28.24 
 
 
504 aa  92.4  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.316321  normal  0.0202803 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3058  Integrase catalytic region  27.35 
 
 
425 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3693  Integrase catalytic region  27.35 
 
 
425 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1512  Integrase catalytic region  27.35 
 
 
425 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1264  integrase catalytic subunit  27.96 
 
 
336 aa  91.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0642781  normal  0.0493016 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1024  integrase catalytic region  26.65 
 
 
408 aa  91.3  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0461677 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1563  hypothetical protein  28.12 
 
 
340 aa  90.9  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1591  integrase catalytic region  26.65 
 
 
408 aa  91.3  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00379475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1968  integrase catalytic region  26.65 
 
 
408 aa  91.3  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2854  integrase catalytic region  26.65 
 
 
408 aa  91.3  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.429143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3160  integrase catalytic region  26.65 
 
 
408 aa  91.3  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012152 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4926  integrase catalytic region  26.65 
 
 
408 aa  91.3  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.409648  normal  0.357662 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0020  hypothetical protein  28.12 
 
 
348 aa  90.9  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2884  hypothetical protein  28.12 
 
 
348 aa  90.9  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6841  integrase catalytic subunit  27.72 
 
 
257 aa  90.5  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4913  integrase catalytic subunit  25.93 
 
 
428 aa  89.7  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.279769 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2580  integrase catalytic region  26.85 
 
 
408 aa  89.7  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0415627  normal  0.0862482 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1847  integrase catalytic region  25.13 
 
 
429 aa  89  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1706  integrase catalytic region  25.13 
 
 
429 aa  89  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5624  integrase catalytic region  25.13 
 
 
429 aa  89  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205652  normal  0.723097 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3282  integrase catalytic subunit  28.21 
 
 
341 aa  88.6  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.590315  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>