More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1655 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1655  iojap-like protein  100 
 
 
123 aa  251  2.0000000000000002e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07936  hypothetical protein  66.94 
 
 
123 aa  173  6e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2601  iojap-like protein  60.33 
 
 
123 aa  157  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.378393  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3002  iojap-like protein  50.43 
 
 
131 aa  135  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5041  iojap-like protein  48.74 
 
 
127 aa  133  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0233  hypothetical protein  43.64 
 
 
122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0031  iojap-like protein  45.54 
 
 
124 aa  105  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.983708  normal  0.170479 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0612  hypothetical protein  42.34 
 
 
125 aa  105  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0022  Iojap-related protein  40.35 
 
 
163 aa  95.1  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1783  iojap-like protein  41.38 
 
 
144 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3307  iojap-like protein  40 
 
 
115 aa  87.8  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000123789  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0156  iojap-like protein  40.74 
 
 
164 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0164  Iojap-related protein  42.57 
 
 
139 aa  86.7  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13380  iojap-like protein  43.01 
 
 
121 aa  86.7  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.129259  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0361  Iojap-related protein  35.96 
 
 
158 aa  85.9  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0567  Iojap-related protein  43 
 
 
115 aa  85.5  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2516  iojap-like protein  38.61 
 
 
118 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000207265  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0092  iojap-like protein  39.47 
 
 
114 aa  85.9  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1238  iojap-like protein  35.45 
 
 
113 aa  84.7  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2674  iojap-like protein  39.47 
 
 
124 aa  85.1  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0269937  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2006  iojap-like protein  41.84 
 
 
142 aa  84.7  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0014366  hitchhiker  0.0000000000365534 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2013  iojap-like protein  42.57 
 
 
117 aa  84.7  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3248  iojap-like protein  38.18 
 
 
125 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000025477  unclonable  0.0000142145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3737  iojap-like protein  43 
 
 
104 aa  84.3  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000069668  unclonable  0.000000000198678 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4639  iojap-like protein  38.94 
 
 
139 aa  84.3  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.188421  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0612  iojap-like protein  37.27 
 
 
140 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4809  iojap-like protein  37.27 
 
 
139 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.243454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4862  iojap-like protein  37.27 
 
 
139 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376874  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2263  iojap-like protein  49.49 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  36.61 
 
 
123 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4367  Iojap-related protein  36.84 
 
 
128 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2110  iojap-like protein  40.52 
 
 
117 aa  83.2  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4684  iojap-like protein  37.27 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1753  iojap-like protein  36.13 
 
 
122 aa  82.8  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2664  iojap-like protein  38.79 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000901507  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0136  iojap-like protein  39.67 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.872852  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0095  iojap-like protein  37.5 
 
 
131 aa  82.4  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000027247  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3646  iojap-like protein  37 
 
 
150 aa  82  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000675973  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0755  iojap-like protein  35.9 
 
 
113 aa  82.4  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.307154  normal  0.0157817 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0686  iojap-like protein  36.21 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000289548  normal  0.0203597 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1866  iojap-like protein  34.75 
 
 
118 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000042805  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0467  iojap-like protein  41.67 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.979719 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2454  iojap-like protein  34.75 
 
 
118 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000449181  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4129  iojap-like protein  30.33 
 
 
128 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000489424  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2415  iojap-like protein  34.23 
 
 
116 aa  80.5  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000527491  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0372  iojap-like protein  38.3 
 
 
114 aa  80.1  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000445596  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0124  iojap-like protein  38.6 
 
 
143 aa  80.1  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000225979  hitchhiker  0.00822144 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1659  iojap-related protein  35.34 
 
 
118 aa  79.7  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000807789  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0997  iojap-like protein  38.74 
 
 
118 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2225  iojap-like protein  35.9 
 
 
114 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.194852  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2933  iojap-like protein  37.39 
 
 
115 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000045875  decreased coverage  0.00669714 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2660  Iojap-related protein  38.32 
 
 
115 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00250929  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1972  Iojap-related protein  37.17 
 
 
274 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.972723 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3118  iojap-like protein  36.84 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1736  Iojap family protein  35.45 
 
 
124 aa  80.1  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0393  iojap-like protein  37 
 
 
114 aa  79  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00274134  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3483  iojap-like protein  36.7 
 
 
109 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000176434  unclonable  0.0000000000377675 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3343  Poly(A) polymerase, PcnB  40.54 
 
 
114 aa  79  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574363  normal  0.0167921 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1601  iojap-related protein  36.27 
 
 
118 aa  79  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000667428  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3002  iojap-like protein  35.96 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2526  Iojap-related protein  36.7 
 
 
241 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4972  hypothetical protein  33.63 
 
 
164 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05158  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2577  Iojap-related protein  37.37 
 
 
119 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.5603199999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0087  Iojap-related protein  36.52 
 
 
129 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.755827  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2079  Iojap-related protein  35.78 
 
 
261 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4552  iojap-like protein  34.78 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.67264  normal  0.570489 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1732  iojap-like protein  37.5 
 
 
289 aa  78.2  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  35.04 
 
 
122 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1923  iojap-like protein  37.86 
 
 
116 aa  77.4  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000477061  unclonable  0.00000000896903 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0865  hypothetical protein  39.8 
 
 
106 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0097  Iojap-related protein  36.67 
 
 
131 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0187008  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0781  Iojap-related protein  36.7 
 
 
256 aa  77.4  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11902  normal  0.247773 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2525  iojap-like protein  39.8 
 
 
106 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52236  normal  0.917472 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3451  iojap-like protein  33.33 
 
 
114 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316802  hitchhiker  0.00269335 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3315  iojap-like protein  33.33 
 
 
114 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000132969  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1366  iojap-like protein  35.65 
 
 
114 aa  77  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3346  iojap-like protein  40.38 
 
 
226 aa  77.4  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000242927  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2544  iojap-like protein  33.33 
 
 
120 aa  77  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00643892  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_335  hypothetical protein  36 
 
 
116 aa  77  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000506445  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2687  iojap-like protein  35.45 
 
 
221 aa  76.6  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0645219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3273  iojap-like protein  33.33 
 
 
109 aa  77  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3706  iojap-like protein  36.45 
 
 
109 aa  77  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000743073  decreased coverage  0.000000204323 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1094  iojap-like protein  33.33 
 
 
109 aa  77  0.00000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000143508  hitchhiker  0.000000000478913 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0735  Iojap-related protein  37.72 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130458  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2194  hypothetical protein  35.78 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0226  iojap-like protein  38 
 
 
198 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0857  Iojap-related protein  34.86 
 
 
109 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000112346  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0237  iojap-like protein  38 
 
 
198 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3147  iojap-like protein  35.78 
 
 
109 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000880611  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2867  iojap-like protein  34.23 
 
 
109 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000086194  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18190  iojap-related protein  40 
 
 
125 aa  74.7  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.131232  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0161  iojap-like protein  39.8 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0102  iojap-like protein  37.37 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000101684  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0213  Iojap-related protein  37.74 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277011  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2625  iojap-like protein  35.19 
 
 
233 aa  74.7  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.247151  normal  0.127166 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13060  iojap-related protein  38.78 
 
 
128 aa  74.3  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.691164  normal  0.0908003 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3524  iojap-like protein  33.94 
 
 
261 aa  73.9  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.395947  normal  0.0571508 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0910  Iojap family protein  34.17 
 
 
120 aa  73.9  0.0000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000376688  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1313  iojap-like protein  35.14 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0377  Iojap-related protein  35.51 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>