More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0612 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0612  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  256  1e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3002  iojap-like protein  56.64 
 
 
131 aa  139  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5041  iojap-like protein  50 
 
 
127 aa  132  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0031  iojap-like protein  46.34 
 
 
124 aa  122  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.983708  normal  0.170479 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0233  hypothetical protein  45.76 
 
 
122 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2601  iojap-like protein  44.14 
 
 
123 aa  108  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.378393  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1655  iojap-like protein  42.34 
 
 
123 aa  105  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07936  hypothetical protein  39.5 
 
 
123 aa  102  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2674  iojap-like protein  40.18 
 
 
124 aa  95.9  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0269937  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2516  iojap-like protein  45.1 
 
 
118 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000207265  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1238  iojap-like protein  41.67 
 
 
113 aa  93.6  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3307  iojap-like protein  40.37 
 
 
115 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000123789  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0467  iojap-like protein  43.12 
 
 
135 aa  91.3  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.979719 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2454  iojap-like protein  45.45 
 
 
118 aa  90.9  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000449181  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0686  iojap-like protein  42.31 
 
 
158 aa  89.7  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000289548  normal  0.0203597 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1253  iojap-like protein  44 
 
 
110 aa  89.7  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00407148  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1366  iojap-like protein  44.64 
 
 
114 aa  89.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3248  iojap-like protein  39.45 
 
 
125 aa  89  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000025477  unclonable  0.0000142145 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1923  iojap-like protein  40 
 
 
116 aa  88.2  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000477061  unclonable  0.00000000896903 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0228  iojap-like protein  38.14 
 
 
191 aa  87  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.689651  normal  0.307872 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3737  iojap-like protein  45.65 
 
 
104 aa  87  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000069668  unclonable  0.000000000198678 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0997  iojap-like protein  43 
 
 
118 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1783  iojap-like protein  41.07 
 
 
144 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2110  iojap-like protein  36.29 
 
 
117 aa  85.1  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0213  Iojap-related protein  39.25 
 
 
107 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277011  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0593  Iojap-related protein  41.58 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.328156 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2263  iojap-like protein  43.27 
 
 
152 aa  84.7  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0237  iojap-like protein  41 
 
 
198 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2544  iojap-like protein  41.24 
 
 
120 aa  84  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00643892  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0226  iojap-like protein  41 
 
 
198 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0192  iojap-like protein  38.18 
 
 
118 aa  83.6  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000139024  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1866  iojap-like protein  39.09 
 
 
118 aa  82.8  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000042805  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0022  Iojap-related protein  37.61 
 
 
163 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13380  iojap-like protein  40.91 
 
 
121 aa  82.4  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.129259  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3118  iojap-like protein  36.75 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4639  iojap-like protein  37.74 
 
 
139 aa  82  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.188421  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3002  iojap-like protein  35.9 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0136  iojap-like protein  40.2 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.872852  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0164  Iojap-related protein  40.22 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0648  iojap-like protein  36.52 
 
 
146 aa  80.1  0.000000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0131268 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2660  Iojap-related protein  44.23 
 
 
115 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00250929  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2006  iojap-like protein  36.75 
 
 
142 aa  80.1  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0014366  hitchhiker  0.0000000000365534 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2013  iojap-like protein  36.84 
 
 
117 aa  79.7  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4181  iojap-like protein  45.98 
 
 
118 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000680321  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0567  Iojap-related protein  40.57 
 
 
115 aa  79.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2934  iojap-like protein  39.39 
 
 
128 aa  79.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.968442 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09441  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  35.71 
 
 
122 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.120716  hitchhiker  0.0000153571 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3056  iojap-like protein  45.65 
 
 
118 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000232499  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18190  iojap-related protein  33.64 
 
 
125 aa  79  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.131232  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1736  Iojap family protein  39.64 
 
 
124 aa  79  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3646  iojap-like protein  40.66 
 
 
150 aa  79  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000675973  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4329  iojap-like protein  39.8 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.9777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0092  iojap-like protein  36.08 
 
 
114 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2577  Iojap-related protein  33.98 
 
 
119 aa  78.2  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.5603199999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4129  iojap-like protein  33.06 
 
 
128 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000489424  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1581  hypothetical protein  39.29 
 
 
117 aa  78.6  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000588564  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3346  iojap-like protein  36.45 
 
 
226 aa  78.6  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000242927  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4450  iojap-related protein  44.57 
 
 
118 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0295288  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1159  iojap-related protein  35.85 
 
 
117 aa  78.2  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4411  iojap-related protein  44.57 
 
 
118 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0836383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4066  iojap-related protein  44.57 
 
 
118 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  2.08408e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4076  iojap-related protein  44.57 
 
 
118 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000000293892  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4352  iojap-related protein  44.57 
 
 
118 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00200465 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4463  iojap-related protein  44.57 
 
 
118 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000001313  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0787  iojap-related protein  44.57 
 
 
118 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000071595  hitchhiker  0.00000138621 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2664  iojap-like protein  34.85 
 
 
131 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000901507  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0156  iojap-like protein  34.78 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1601  iojap-related protein  35.19 
 
 
118 aa  77.4  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000667428  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0095  iojap-like protein  41 
 
 
131 aa  77.4  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000027247  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4228  iojap-related protein  44.57 
 
 
118 aa  77  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4556  iojap-related protein  44.57 
 
 
118 aa  77  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000107806  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4367  Iojap-related protein  33.64 
 
 
128 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1753  iojap-like protein  34.55 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1659  iojap-related protein  39.09 
 
 
118 aa  75.9  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000807789  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2170  Iojap-related protein  41.33 
 
 
134 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186283  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0097  Iojap-related protein  39 
 
 
131 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0187008  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3201  Iojap-related protein  35.64 
 
 
131 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.12867e-19  unclonable  7.41028e-24 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4206  iojap-like protein  35.35 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573117  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0058  Iojap-related protein  37.04 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2127  iojap-like protein  37.62 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.810786  normal  0.0331873 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3882  iojap-like protein  35.35 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.604343  normal  0.0302517 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0701  iojap-like protein  36.45 
 
 
109 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000119797  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2415  iojap-like protein  39.81 
 
 
116 aa  75.5  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000527491  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0393  iojap-like protein  36.63 
 
 
114 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00274134  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  36.36 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01219  hypothetical protein  40 
 
 
105 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3860  iojap-like protein  36.73 
 
 
128 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.152757 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3776  iojap-like protein  35.71 
 
 
128 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0735  Iojap-related protein  37.62 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130458  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0087  Iojap-related protein  34.86 
 
 
129 aa  73.9  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.755827  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1817  Iojap-related protein  34.62 
 
 
118 aa  73.9  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0224  Iojap-related protein  32.08 
 
 
124 aa  73.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.739057  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0124  iojap-like protein  35.04 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000225979  hitchhiker  0.00822144 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1380  hypothetical protein  38.6 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0102  iojap-like protein  38 
 
 
131 aa  73.6  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000101684  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  35.42 
 
 
123 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3613  iojap-like protein  41.3 
 
 
135 aa  73.6  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000208423  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1821  iojap-like protein  35.51 
 
 
127 aa  73.6  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.383706  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_335  hypothetical protein  35.64 
 
 
116 aa  73.6  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000506445  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0087  iojap-like protein  37.23 
 
 
110 aa  73.6  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00113012  normal  0.300811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>