More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1821 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1821  iojap-like protein  100 
 
 
127 aa  254  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.383706  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3359  iojap-like protein  69.84 
 
 
132 aa  184  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.573704  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1555  iojap-like protein  72.36 
 
 
139 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116764  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2250  iojap-like protein  65.08 
 
 
130 aa  176  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7260  hypothetical protein  72.73 
 
 
135 aa  167  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00000500377  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2170  Iojap-related protein  70.34 
 
 
134 aa  165  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186283  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3534  iojap-like protein  61.34 
 
 
133 aa  164  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3529  Iojap-related protein  61.34 
 
 
122 aa  164  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3602  iojap-like protein  61.34 
 
 
122 aa  164  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158813  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7257  iojap-like protein  65.35 
 
 
173 aa  163  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2452  iojap-like protein  64.84 
 
 
134 aa  163  8e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.344945  normal  0.138235 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3449  iojap-like protein  65.6 
 
 
138 aa  157  7e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.467632  normal  0.645308 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1641  iojap-like protein  60.5 
 
 
141 aa  155  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660201 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3193  iojap-like protein  63.56 
 
 
120 aa  152  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5246  iojap-like protein  64.66 
 
 
144 aa  151  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.378223  normal  0.556736 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2274  iojap-like protein  63.87 
 
 
127 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000201224  hitchhiker  0.000438261 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11480  iojap-related protein  60.48 
 
 
148 aa  147  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  hitchhiker  0.00298358 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3473  iojap-like protein  62.79 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3853  iojap-like protein  62.02 
 
 
133 aa  144  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.782657  hitchhiker  0.00260799 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0764  iojap-like protein  64.57 
 
 
132 aa  143  6e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.589269  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2654  iojap-like protein  61.39 
 
 
120 aa  143  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2807  iojap-like protein  62.28 
 
 
135 aa  140  9e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.649209  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1198  iojap-like protein  60.8 
 
 
148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1233  Iojap-related protein  66.38 
 
 
196 aa  137  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.342641 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12448  hypothetical protein  53.97 
 
 
126 aa  138  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.873041 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18190  iojap-related protein  58.33 
 
 
125 aa  138  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.131232  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2383  iojap-like protein  58.62 
 
 
133 aa  137  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00906189  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3925  iojap-like protein  60.42 
 
 
121 aa  136  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436955  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11590  iojap-related protein  58.62 
 
 
151 aa  136  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.633601 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1509  iojap-like protein  57.89 
 
 
137 aa  135  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0462296  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12550  iojap-related protein  68.54 
 
 
135 aa  134  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.679587  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2137  iojap-like protein  56.1 
 
 
129 aa  132  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000149501 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10180  iojap-related protein  60.82 
 
 
141 aa  127  4.0000000000000003e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.168082  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5475  iojap-like protein  56.52 
 
 
141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.219146  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1637  iojap-like protein  55.1 
 
 
138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.418914 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1607  iojap-like protein  62.93 
 
 
191 aa  123  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186987  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0719  hypothetical protein  52.54 
 
 
137 aa  123  1e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00101649  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2006  iojap-like protein  49.57 
 
 
142 aa  110  7.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0014366  hitchhiker  0.0000000000365534 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1866  iojap-like protein  49.07 
 
 
118 aa  107  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000042805  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0192  iojap-like protein  49.06 
 
 
118 aa  107  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000139024  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1012  iojap-like protein  57.14 
 
 
140 aa  105  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2516  iojap-like protein  43.64 
 
 
118 aa  104  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000207265  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1253  iojap-like protein  43.24 
 
 
110 aa  98.2  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00407148  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1238  iojap-like protein  45.1 
 
 
113 aa  98.2  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4329  iojap-like protein  40.38 
 
 
112 aa  95.5  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.9777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1736  Iojap family protein  41.03 
 
 
124 aa  95.9  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3118  iojap-like protein  46.73 
 
 
144 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0686  iojap-like protein  44.64 
 
 
158 aa  93.2  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000289548  normal  0.0203597 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0092  iojap-like protein  43.24 
 
 
114 aa  93.2  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3002  iojap-like protein  45.79 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1581  hypothetical protein  39.09 
 
 
117 aa  91.7  3e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000588564  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  43.56 
 
 
122 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  43.56 
 
 
118 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  43.56 
 
 
118 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  41.58 
 
 
123 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1366  iojap-like protein  54.17 
 
 
114 aa  89.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13060  iojap-related protein  42.05 
 
 
128 aa  89  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.691164  normal  0.0908003 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4367  Iojap-related protein  39.6 
 
 
128 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0213  Iojap-related protein  41.35 
 
 
107 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277011  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0910  Iojap family protein  42.11 
 
 
120 aa  89  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000376688  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3307  iojap-like protein  44.95 
 
 
115 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000123789  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2013  iojap-like protein  41.44 
 
 
117 aa  87.4  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0097  Iojap-related protein  40.19 
 
 
131 aa  87.4  6e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0187008  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06010  iojap-related protein  48.86 
 
 
137 aa  87.4  6e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0403792  hitchhiker  0.0000000000582879 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0997  iojap-like protein  40.38 
 
 
118 aa  87.4  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3646  iojap-like protein  43.48 
 
 
150 aa  87.4  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000675973  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0372  iojap-like protein  35.19 
 
 
114 aa  87  8e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000445596  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4972  hypothetical protein  41 
 
 
164 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05158  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2110  iojap-like protein  45.74 
 
 
117 aa  86.7  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1659  iojap-related protein  37.74 
 
 
118 aa  86.3  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000807789  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0228  iojap-like protein  40.82 
 
 
191 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.689651  normal  0.307872 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2577  Iojap-related protein  42.31 
 
 
119 aa  86.3  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.5603199999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13380  iojap-like protein  47.67 
 
 
121 aa  86.3  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.129259  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1783  iojap-like protein  44 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3613  iojap-like protein  39.17 
 
 
135 aa  86.3  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000208423  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0393  iojap-like protein  34.26 
 
 
114 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00274134  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0237  iojap-like protein  41.05 
 
 
198 aa  84.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0226  iojap-like protein  41.05 
 
 
198 aa  84.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_335  hypothetical protein  33.33 
 
 
116 aa  84.7  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000506445  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2544  iojap-like protein  37.96 
 
 
120 aa  84.7  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00643892  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4129  iojap-like protein  36.97 
 
 
128 aa  84.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000489424  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0095  iojap-like protein  39.81 
 
 
131 aa  84  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000027247  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0022  Iojap-related protein  41.18 
 
 
163 aa  84  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1543  Iojap-related protein  40.66 
 
 
123 aa  84  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0158973  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0735  Iojap-related protein  37.39 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130458  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3201  Iojap-related protein  39.32 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.12867e-19  unclonable  7.41028e-24 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0567  Iojap-related protein  45.92 
 
 
115 aa  82.8  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0593  Iojap-related protein  43.18 
 
 
119 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.328156 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0612  iojap-like protein  38 
 
 
140 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1923  iojap-like protein  39.29 
 
 
116 aa  82.4  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000477061  unclonable  0.00000000896903 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1401  Iojap family protein  36.04 
 
 
121 aa  82  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131748  hitchhiker  5.83181e-24 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1159  iojap-related protein  36.54 
 
 
117 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2415  iojap-like protein  41.11 
 
 
116 aa  82  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000527491  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0432  iojap-like protein  36.75 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1380  hypothetical protein  39.39 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4684  iojap-like protein  37.62 
 
 
158 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4809  iojap-like protein  37.62 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.243454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4862  iojap-like protein  37.62 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376874  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0124  iojap-like protein  38.66 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000225979  hitchhiker  0.00822144 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2079  Iojap-related protein  40.66 
 
 
261 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>