More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0393 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0393  iojap-like protein  100 
 
 
114 aa  234  2e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00274134  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_335  hypothetical protein  96.49 
 
 
116 aa  230  6e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000506445  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0372  iojap-like protein  94.74 
 
 
114 aa  226  1e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000445596  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3248  iojap-like protein  46.96 
 
 
125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000025477  unclonable  0.0000142145 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1659  iojap-related protein  44.55 
 
 
118 aa  106  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000807789  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1753  iojap-like protein  44.04 
 
 
122 aa  104  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0686  iojap-like protein  43.12 
 
 
158 aa  102  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000289548  normal  0.0203597 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1581  hypothetical protein  47.96 
 
 
117 aa  101  4e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000588564  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3737  iojap-like protein  45.71 
 
 
104 aa  100  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000069668  unclonable  0.000000000198678 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1923  iojap-like protein  44.55 
 
 
116 aa  99.4  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000477061  unclonable  0.00000000896903 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0213  Iojap-related protein  47.52 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277011  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2006  iojap-like protein  43.75 
 
 
142 aa  99  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0014366  hitchhiker  0.0000000000365534 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0226  iojap-like protein  48.96 
 
 
198 aa  97.1  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0237  iojap-like protein  48.96 
 
 
198 aa  97.1  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0910  Iojap family protein  41.67 
 
 
120 aa  96.7  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000376688  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0192  iojap-like protein  40.91 
 
 
118 aa  95.5  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000139024  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1238  iojap-like protein  43.27 
 
 
113 aa  95.9  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0228  iojap-like protein  46.88 
 
 
191 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.689651  normal  0.307872 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18190  iojap-related protein  40.74 
 
 
125 aa  91.7  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.131232  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3002  iojap-like protein  46.32 
 
 
131 aa  91.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0399  iojap-like protein  37.84 
 
 
116 aa  91.3  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000418488  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2674  iojap-like protein  41.9 
 
 
124 aa  90.9  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0269937  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1641  iojap-like protein  39.81 
 
 
141 aa  89  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660201 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2013  iojap-like protein  41.18 
 
 
117 aa  89  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3646  iojap-like protein  43.62 
 
 
150 aa  89.4  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000675973  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  38.32 
 
 
123 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2516  iojap-like protein  39.62 
 
 
118 aa  87.4  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000207265  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0986  iojap-like protein  36.04 
 
 
120 aa  87.4  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.254875  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0022  Iojap-related protein  40.59 
 
 
163 aa  87.4  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1783  iojap-like protein  38.68 
 
 
144 aa  87.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13060  iojap-related protein  41.76 
 
 
128 aa  87.4  7e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.691164  normal  0.0908003 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4367  Iojap-related protein  36.7 
 
 
128 aa  87  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0163  Iojap-related protein  40.66 
 
 
141 aa  86.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3776  iojap-like protein  38.46 
 
 
128 aa  86.3  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2250  iojap-like protein  39.62 
 
 
130 aa  86.3  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1821  iojap-like protein  34.26 
 
 
127 aa  85.9  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.383706  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1159  iojap-related protein  36.11 
 
 
117 aa  85.5  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1380  hypothetical protein  43.3 
 
 
148 aa  85.9  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2664  iojap-like protein  38.83 
 
 
131 aa  85.9  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000901507  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2454  iojap-like protein  37.96 
 
 
118 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000449181  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4809  iojap-like protein  41.3 
 
 
139 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.243454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4862  iojap-like protein  41.3 
 
 
139 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376874  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0092  iojap-like protein  41.94 
 
 
114 aa  85.1  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2601  iojap-like protein  37.62 
 
 
123 aa  85.1  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.378393  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4684  iojap-like protein  41.3 
 
 
158 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3860  iojap-like protein  38.46 
 
 
128 aa  84.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.152757 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5246  iojap-like protein  38.71 
 
 
144 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.378223  normal  0.556736 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2274  iojap-like protein  38.68 
 
 
127 aa  84.3  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000201224  hitchhiker  0.000438261 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  37.62 
 
 
148 aa  84  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1736  Iojap family protein  40.38 
 
 
124 aa  84.3  6e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4129  iojap-like protein  40.37 
 
 
128 aa  84  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000489424  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1313  iojap-like protein  42.27 
 
 
148 aa  84  7e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3201  Iojap-related protein  40.37 
 
 
131 aa  83.6  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.12867e-19  unclonable  7.41028e-24 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5041  iojap-like protein  40 
 
 
127 aa  83.6  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11480  iojap-related protein  43.18 
 
 
148 aa  83.6  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  hitchhiker  0.00298358 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2415  iojap-like protein  39.78 
 
 
116 aa  83.6  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000527491  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13380  iojap-like protein  43.96 
 
 
121 aa  82.8  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.129259  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0095  iojap-like protein  39.81 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000027247  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0522  Iojap-related protein  40.23 
 
 
120 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0513689  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2110  iojap-like protein  36.89 
 
 
117 aa  82.4  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3118  iojap-like protein  41.84 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0161  iojap-like protein  39.56 
 
 
150 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06010  iojap-related protein  41.11 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0403792  hitchhiker  0.0000000000582879 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1509  iojap-like protein  42.05 
 
 
137 aa  82  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0462296  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  39.05 
 
 
118 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0234  hypothetical protein  36.7 
 
 
119 aa  82.8  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  41.3 
 
 
118 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0567  Iojap-related protein  38.18 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1149  iojap-like protein  37.96 
 
 
110 aa  82  0.000000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1521  Iojap-related protein  44.94 
 
 
131 aa  81.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.191395  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2263  iojap-like protein  41.9 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07936  hypothetical protein  38.38 
 
 
123 aa  82  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2660  Iojap-related protein  36.11 
 
 
115 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00250929  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3359  iojap-like protein  38.18 
 
 
132 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.573704  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11590  iojap-related protein  36.7 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.633601 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0569  Iojap-related protein  38.04 
 
 
210 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1866  iojap-like protein  41.84 
 
 
118 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000042805  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0612  iojap-like protein  37 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7257  iojap-like protein  38.39 
 
 
173 aa  80.9  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3002  iojap-like protein  40.82 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0446  Iojap-related protein  37.11 
 
 
123 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.284133  normal  0.877531 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0255  Iojap-related protein  38.04 
 
 
135 aa  80.5  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3613  iojap-like protein  41.9 
 
 
135 aa  80.5  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000208423  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2299  iojap-like protein  37.36 
 
 
91 aa  80.9  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000554928  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3449  iojap-like protein  39.78 
 
 
138 aa  80.5  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.467632  normal  0.645308 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4972  hypothetical protein  41.11 
 
 
164 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05158  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3529  Iojap-related protein  36.7 
 
 
122 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3602  iojap-like protein  36.7 
 
 
122 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158813  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0150  hypothetical protein  30.91 
 
 
119 aa  79.3  0.00000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3193  iojap-like protein  36.45 
 
 
120 aa  80.1  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2807  iojap-like protein  37.78 
 
 
135 aa  80.1  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.649209  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0997  iojap-like protein  36.36 
 
 
118 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3534  iojap-like protein  36.7 
 
 
133 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0405  iojap-like protein  42.53 
 
 
123 aa  79.7  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64212  normal  0.310869 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10180  iojap-related protein  43.33 
 
 
141 aa  80.1  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.168082  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3209  iojap-related protein  42.86 
 
 
131 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.013969  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1253  iojap-like protein  37.25 
 
 
110 aa  79.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00407148  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0124  iojap-like protein  34.62 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000225979  hitchhiker  0.00822144 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2908  iojap-like protein  41.38 
 
 
137 aa  79  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1555  iojap-like protein  39.82 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>