More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5041 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5041  iojap-like protein  100 
 
 
127 aa  257  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3002  iojap-like protein  61.6 
 
 
131 aa  176  7e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07936  hypothetical protein  50.42 
 
 
123 aa  135  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1655  iojap-like protein  48.74 
 
 
123 aa  133  8e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0612  hypothetical protein  50 
 
 
125 aa  132  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0031  iojap-like protein  50 
 
 
124 aa  132  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.983708  normal  0.170479 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0233  hypothetical protein  45.08 
 
 
122 aa  130  6e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2601  iojap-like protein  45.76 
 
 
123 aa  124  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.378393  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0022  Iojap-related protein  42.98 
 
 
163 aa  100  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2516  iojap-like protein  42.86 
 
 
118 aa  97.4  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000207265  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2674  iojap-like protein  38.39 
 
 
124 aa  96.3  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0269937  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1866  iojap-like protein  39.83 
 
 
118 aa  95.5  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000042805  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1238  iojap-like protein  44.04 
 
 
113 aa  94.7  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0467  iojap-like protein  48.51 
 
 
135 aa  94.4  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.979719 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0567  Iojap-related protein  41.03 
 
 
115 aa  94.4  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4129  iojap-like protein  39.47 
 
 
128 aa  92  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000489424  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0164  Iojap-related protein  45.26 
 
 
139 aa  92  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2263  iojap-like protein  41.23 
 
 
152 aa  91.7  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13380  iojap-like protein  47.78 
 
 
121 aa  91.3  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.129259  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3118  iojap-like protein  38.53 
 
 
144 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1659  iojap-related protein  41.44 
 
 
118 aa  90.1  8e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000807789  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2454  iojap-like protein  37.19 
 
 
118 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000449181  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2577  Iojap-related protein  38.79 
 
 
119 aa  89  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.5603199999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3002  iojap-like protein  37.61 
 
 
144 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1753  iojap-like protein  39.02 
 
 
122 aa  88.6  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0192  iojap-like protein  39.64 
 
 
118 aa  87.8  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000139024  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  36.61 
 
 
123 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3307  iojap-like protein  36.84 
 
 
115 aa  87  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000123789  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1581  hypothetical protein  43.12 
 
 
117 aa  87  8e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000588564  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0095  iojap-like protein  41.8 
 
 
131 aa  86.7  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000027247  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4367  Iojap-related protein  36.61 
 
 
128 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4972  hypothetical protein  37.5 
 
 
164 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05158  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3248  iojap-like protein  38.33 
 
 
125 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000025477  unclonable  0.0000142145 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0136  iojap-like protein  44.12 
 
 
147 aa  86.3  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.872852  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3631  iojap-like protein  36.8 
 
 
138 aa  86.3  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000986152  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1783  iojap-like protein  39.42 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0997  iojap-like protein  37.17 
 
 
118 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0612  iojap-like protein  34.45 
 
 
140 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2660  Iojap-related protein  42.45 
 
 
115 aa  84.3  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00250929  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0097  Iojap-related protein  42.02 
 
 
131 aa  84.3  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0187008  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1366  iojap-like protein  41.07 
 
 
114 aa  84.3  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2170  Iojap-related protein  43.42 
 
 
134 aa  84.3  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186283  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3737  iojap-like protein  42.55 
 
 
104 aa  84  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000069668  unclonable  0.000000000198678 
 
 
-
 
NC_002936  DET0393  iojap-like protein  40 
 
 
114 aa  83.6  8e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00274134  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0087  Iojap-related protein  39.34 
 
 
129 aa  83.6  8e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.755827  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3056  iojap-like protein  38.89 
 
 
118 aa  83.6  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000232499  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10471  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  38.18 
 
 
114 aa  83.6  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.176086  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3201  Iojap-related protein  40.2 
 
 
131 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.12867e-19  unclonable  7.41028e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4450  iojap-related protein  37.61 
 
 
118 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0295288  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0787  iojap-related protein  37.61 
 
 
118 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000071595  hitchhiker  0.00000138621 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_335  hypothetical protein  39.64 
 
 
116 aa  82.8  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000506445  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  38.66 
 
 
122 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3646  iojap-like protein  37.72 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000675973  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4809  iojap-like protein  34.45 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.243454 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4411  iojap-related protein  37.96 
 
 
118 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0836383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4066  iojap-related protein  37.96 
 
 
118 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  2.08408e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4076  iojap-related protein  37.96 
 
 
118 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000000293892  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7257  iojap-like protein  42.35 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0372  iojap-like protein  40 
 
 
114 aa  82  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000445596  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2110  iojap-like protein  40.78 
 
 
117 aa  82.4  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2006  iojap-like protein  33.93 
 
 
142 aa  82.4  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0014366  hitchhiker  0.0000000000365534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4684  iojap-like protein  34.45 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0102  iojap-like protein  47.42 
 
 
131 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000101684  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0686  iojap-like protein  38.53 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000289548  normal  0.0203597 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4463  iojap-related protein  37.96 
 
 
118 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000001313  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4862  iojap-like protein  34.45 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376874  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4352  iojap-related protein  37.96 
 
 
118 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00200465 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0124  iojap-like protein  42.74 
 
 
143 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000225979  hitchhiker  0.00822144 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1817  Iojap-related protein  37.27 
 
 
118 aa  81.6  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  39.09 
 
 
117 aa  81.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0237  iojap-like protein  42 
 
 
198 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0226  iojap-like protein  42 
 
 
198 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2664  iojap-like protein  40.35 
 
 
131 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000901507  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2544  iojap-like protein  36.52 
 
 
120 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00643892  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3776  iojap-like protein  41.49 
 
 
128 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4639  iojap-like protein  35.85 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.188421  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0228  iojap-like protein  43.16 
 
 
191 aa  81.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.689651  normal  0.307872 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1159  iojap-related protein  36.04 
 
 
117 aa  80.9  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1717  iojap-related protein  36.11 
 
 
106 aa  80.9  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4228  iojap-related protein  37.96 
 
 
118 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4556  iojap-related protein  37.96 
 
 
118 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000107806  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0213  Iojap-related protein  42 
 
 
107 aa  81.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277011  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3613  iojap-like protein  37.5 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000208423  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0838  Iojap-related protein  35.45 
 
 
121 aa  80.5  0.000000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1923  iojap-like protein  36 
 
 
116 aa  80.5  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000477061  unclonable  0.00000000896903 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0361  Iojap-related protein  39.45 
 
 
158 aa  80.1  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3860  iojap-like protein  40.43 
 
 
128 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.152757 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4181  iojap-like protein  39.77 
 
 
118 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000680321  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08981  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  37.27 
 
 
114 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09441  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  31.36 
 
 
122 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.120716  hitchhiker  0.0000153571 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0399  iojap-like protein  38.68 
 
 
116 aa  79  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000418488  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01659  iojap domain protein  39.62 
 
 
105 aa  78.2  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000504193  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3273  iojap-like protein  36.36 
 
 
109 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1684  hypothetical protein  36.7 
 
 
117 aa  78.6  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0432873  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1649  hypothetical protein  36.7 
 
 
117 aa  78.6  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0156  iojap-like protein  37.84 
 
 
164 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10471  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  36.36 
 
 
114 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1094  iojap-like protein  36.36 
 
 
109 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000143508  hitchhiker  0.000000000478913 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18190  iojap-related protein  33.63 
 
 
125 aa  78.6  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.131232  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2013  iojap-like protein  37 
 
 
117 aa  78.2  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>