More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_335 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_335  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  241  3e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000506445  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0393  iojap-like protein  96.49 
 
 		 114 aa  230  6e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00274134  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0372  iojap-like protein  93.86 
 
 		 114 aa  224  4e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000445596  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3248  iojap-like protein  46.96 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000025477  unclonable  0.0000142145 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1659  iojap-related protein  44.44 
 
 		 118 aa  104  5e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000807789  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1753  iojap-like protein  43.12 
 
 		 122 aa  103  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0686  iojap-like protein  41.59 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000289548  normal  0.0203597 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3737  iojap-like protein  44.76 
 
 		 104 aa  100  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000069668  unclonable  0.000000000198678 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1581  hypothetical protein  46.94 
 
 		 117 aa  99.4  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000588564  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0213  Iojap-related protein  46.53 
 
 		 107 aa  98.6  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277011  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1923  iojap-like protein  41.88 
 
 		 116 aa  97.8  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000477061  unclonable  0.00000000896903 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2006  iojap-like protein  42.71 
 
 		 142 aa  97.1  7e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0014366  hitchhiker  0.0000000000365534 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0226  iojap-like protein  47.92 
 
 		 198 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0237  iojap-like protein  47.92 
 
 		 198 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0228  iojap-like protein  45.83 
 
 		 191 aa  93.6  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.689651  normal  0.307872 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0910  Iojap family protein  39.09 
 
 		 120 aa  93.6  8e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000376688  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0192  iojap-like protein  40.57 
 
 		 118 aa  93.2  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000139024  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1238  iojap-like protein  41.35 
 
 		 113 aa  92.4  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18190  iojap-related protein  39.81 
 
 		 125 aa  90.9  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.131232  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0399  iojap-like protein  37.84 
 
 		 116 aa  90.1  8e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000418488  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3002  iojap-like protein  45.26 
 
 		 131 aa  90.1  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2674  iojap-like protein  40.37 
 
 		 124 aa  89.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0269937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3646  iojap-like protein  42.55 
 
 		 150 aa  87.8  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000675973  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2013  iojap-like protein  40.2 
 
 		 117 aa  87.8  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1641  iojap-like protein  38.89 
 
 		 141 aa  87.8  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660201 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1783  iojap-like protein  37.74 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2516  iojap-like protein  38.68 
 
 		 118 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000207265  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13060  iojap-related protein  40.66 
 
 		 128 aa  85.9  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.691164  normal  0.0908003 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0022  Iojap-related protein  39.6 
 
 		 163 aa  85.5  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3776  iojap-like protein  37.5 
 
 		 128 aa  84.7  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  36.45 
 
 		 123 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2250  iojap-like protein  38.68 
 
 		 130 aa  84.7  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4367  Iojap-related protein  39.6 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0163  Iojap-related protein  39.56 
 
 		 141 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0986  iojap-like protein  34.23 
 
 		 120 aa  84.3  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.254875  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1821  iojap-like protein  33.33 
 
 		 127 aa  84.7  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.383706  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2664  iojap-like protein  37.86 
 
 		 131 aa  84.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000901507  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0092  iojap-like protein  40.86 
 
 		 114 aa  83.6  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4809  iojap-like protein  40.22 
 
 		 139 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.243454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4862  iojap-like protein  40.22 
 
 		 139 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2454  iojap-like protein  37.5 
 
 		 118 aa  83.6  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000449181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3860  iojap-like protein  37.5 
 
 		 128 aa  83.6  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.152757 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4684  iojap-like protein  40.22 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5246  iojap-like protein  37.63 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.378223  normal  0.556736 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3201  Iojap-related protein  40.37 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.12867e-19  unclonable  7.41028e-24 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1380  hypothetical protein  41.24 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5041  iojap-like protein  39.64 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2274  iojap-like protein  37.74 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000201224  hitchhiker  0.000438261 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1159  iojap-related protein  36.73 
 
 		 117 aa  82.4  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  36.63 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11480  iojap-related protein  42.05 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  hitchhiker  0.00298358 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2601  iojap-like protein  37.89 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.378393  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1736  Iojap family protein  39.42 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2415  iojap-like protein  38.95 
 
 		 116 aa  82.8  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000527491  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0095  iojap-like protein  38.83 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000027247  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4129  iojap-like protein  38.18 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000489424  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3359  iojap-like protein  38.18 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.573704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13380  iojap-like protein  42.86 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.129259  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2263  iojap-like protein  40.18 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1509  iojap-like protein  40.91 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0462296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06010  iojap-related protein  40 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0403792  hitchhiker  0.0000000000582879 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3118  iojap-like protein  40.82 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2110  iojap-like protein  35.92 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0522  Iojap-related protein  39.08 
 
 		 120 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0513689  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  37.38 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1866  iojap-like protein  38.18 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000042805  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1313  iojap-like protein  40.21 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2299  iojap-like protein  36.26 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000554928  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1521  Iojap-related protein  43.82 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.191395  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  40.22 
 
 		 118 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2807  iojap-like protein  37.78 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.649209  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1149  iojap-like protein  37.04 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11590  iojap-related protein  35.78 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.633601 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0612  iojap-like protein  36 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0567  Iojap-related protein  41.05 
 
 		 115 aa  80.1  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0161  iojap-like protein  38.46 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0234  hypothetical protein  34.86 
 
 		 119 aa  80.1  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3613  iojap-like protein  40.54 
 
 		 135 aa  80.1  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000208423  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3209  iojap-related protein  39.82 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.013969  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3449  iojap-like protein  38.71 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.467632  normal  0.645308 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0446  Iojap-related protein  36.08 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.284133  normal  0.877531 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4972  hypothetical protein  35.51 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05158  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0255  Iojap-related protein  36.96 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10180  iojap-related protein  42.22 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.168082  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0569  Iojap-related protein  36.96 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07936  hypothetical protein  37.63 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3002  iojap-like protein  39.8 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0343  iojap-like protein  42.86 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000185203  unclonable  0.000000000186984 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3534  iojap-like protein  35.78 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3529  Iojap-related protein  35.78 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3193  iojap-like protein  35.51 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0405  iojap-like protein  41.38 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64212  normal  0.310869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7257  iojap-like protein  39.36 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3602  iojap-like protein  35.78 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0997  iojap-like protein  35.35 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2660  Iojap-related protein  34.26 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00250929  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0124  iojap-like protein  33.65 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000225979  hitchhiker  0.00822144 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2577  Iojap-related protein  39 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.5603199999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1253  iojap-like protein  36.27 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00407148  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2908  iojap-like protein  40.23 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>