More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0741 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0741  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 321 aa  655    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0263  putative transcriptional regulator  28.34 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2787  LysR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  30.73 
 
 		 300 aa  106  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  32.22 
 
 		 296 aa  106  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0409  transcriptional regulator, LysR family  34.5 
 
 		 313 aa  105  9e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.610294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0284  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1650  LysR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4876  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 335 aa  103  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0982311 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0033  LysR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000417374  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3185  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.377934  normal  0.982451 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5056  LysR family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 375 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0171  transcriptional regulator, LysR family  30.57 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3225  transcriptional regulator, LysR family  29.14 
 
 		 300 aa  100  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.456811 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  29.49 
 
 		 306 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0544  transcriptional regulator, LysR family  30.77 
 
 		 295 aa  99  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2454  lysR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 317 aa  99  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0383  transcriptional regulator, LysR family  25.41 
 
 		 297 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715241  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0898  transcriptional regulator, LysR family  26.9 
 
 		 293 aa  98.2  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2418  transcriptional regulator, LysR family  23.96 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  32.6 
 
 		 307 aa  98.2  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08961  transcriptional regulator, LysR family protein  37.36 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2850  LysR family substrate binding transcriptional regulator  27.19 
 
 		 290 aa  97.4  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.46504  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3234  DNA-binding transcriptional regulator CynR  36.99 
 
 		 295 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.842433  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0352  transcriptional regulator, LysR family  34.86 
 
 		 296 aa  97.4  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256379  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2322  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 298 aa  97.1  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1575  transcriptional regulator, LysR family  24.92 
 
 		 295 aa  97.1  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381269  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 296 aa  97.1  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2817  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.83 
 
 		 298 aa  96.7  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3287  DNA-binding transcriptional regulator CynR  32.57 
 
 		 299 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 300 aa  96.3  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0403  DNA-binding transcriptional regulator CynR  32.57 
 
 		 299 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 300 aa  96.3  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0362  DNA-binding transcriptional regulator CynR  32.57 
 
 		 299 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.709016  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0147  LysR family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 312 aa  96.3  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2736  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  31.43 
 
 		 294 aa  96.3  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0002  transcriptional regulator, LysR family  29.73 
 
 		 316 aa  96.3  6e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37940  DNA-binding transcriptional regulator CynR  35.62 
 
 		 295 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000278966  normal  0.0117616 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1749  LysR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 337 aa  96.3  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301666  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3534  LysR substrate-binding protein  27.85 
 
 		 292 aa  96.3  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0157  transcriptional regulator, LysR family  29.21 
 
 		 308 aa  95.9  9e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1389  LysR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 295 aa  95.5  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0139  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 308 aa  95.5  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0369  DNA-binding transcriptional regulator CynR  32.57 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  25.57 
 
 		 300 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 296 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03200  transcriptional regulator  24.6 
 
 		 300 aa  95.5  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1803  LysR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6511  transcriptional regulator, LysR family  34.88 
 
 		 315 aa  94.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000105391  normal  0.0531961 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0712  LysR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 299 aa  94.7  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 296 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1688  LysR family transcriptional regulator  25.8 
 
 		 292 aa  94.7  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776975  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1980  LysR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 329 aa  94.4  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.362231  normal  0.28719 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0146  LysR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 337 aa  94.4  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2145  DNA-binding transcriptional regulator CynR  28.65 
 
 		 304 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.276237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1930  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 306 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4130  DNA-binding transcriptional regulator CynR  28.18 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.717557 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2394  LysR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 305 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2148  LysR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 329 aa  94  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4781  DNA-binding transcriptional regulator CynR  28.18 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.749024  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3386  DNA-binding transcriptional regulator CynR  28.18 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00292  DNA-binding transcriptional dual regulator  32 
 
 		 299 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3268  transcriptional regulator, LysR family  32 
 
 		 299 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 300 aa  93.6  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3393  LysR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 298 aa  93.6  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162722 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00296  hypothetical protein  32 
 
 		 299 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  26.25 
 
 		 300 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2186  LysR family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 302 aa  93.6  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.209379 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2886  LysR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 301 aa  93.6  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1535  DNA-binding transcriptional regulator CynR  31.4 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.195582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0411  DNA-binding transcriptional regulator CynR  32.57 
 
 		 299 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1911  transcriptional regulator, LysR family  24.28 
 
 		 310 aa  93.2  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3924  transcriptional regulator, LysR family  24.34 
 
 		 316 aa  93.6  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4335  LysR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 297 aa  93.2  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.385889  normal  0.337801 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0537  LysR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 308 aa  92.8  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1817  LysR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 310 aa  92.4  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4222  LysR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 302 aa  92.8  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79182  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 299 aa  92.8  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  23.67 
 
 		 298 aa  92.4  8e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3422  transcriptional regulator, LysR family  23.58 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4861  DNA-binding transcriptional regulator CynR  34.51 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0956909 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  25.9 
 
 		 300 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3027  LysR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal  0.0983391 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0673  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 289 aa  92  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102205  normal  0.750884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8459  LysR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 310 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.983783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2830  LysR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 303 aa  91.7  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3012  LysR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3058  LysR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  25.25 
 
 		 300 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3094  DNA-binding transcriptional regulator CynR  34.44 
 
 		 295 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.899085  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1778  hydrogen peroxide-inducible genes activator  29.63 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1779  hydrogen peroxide-inducible genes activator  29.63 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1555  LysR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 318 aa  91.7  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214293  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0783  LysR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.33611  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2154  transcriptional regulator, LysR family  28.79 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5457  LysR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>