More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4374 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4374  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  504  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.716093 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4036  protein of unknown function DUF81  65.4 
 
 
263 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.843514  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3780  hypothetical protein  63.88 
 
 
263 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779876  normal  0.855482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4074  protein of unknown function DUF81  63.12 
 
 
263 aa  306  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0883  protein of unknown function DUF81  51.36 
 
 
270 aa  251  7e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  50.2 
 
 
261 aa  245  4.9999999999999997e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1748  hypothetical protein  50.63 
 
 
261 aa  241  7.999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.179176 
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  52.05 
 
 
261 aa  236  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  51.9 
 
 
261 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  52.05 
 
 
272 aa  236  3e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  51.24 
 
 
272 aa  232  5e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0542  hypothetical protein  47.64 
 
 
263 aa  207  9e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.768311  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  46.72 
 
 
256 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1638  hypothetical protein  46.72 
 
 
256 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0157393  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2846  hypothetical protein  46.31 
 
 
256 aa  205  5e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  45.87 
 
 
257 aa  204  8e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1653  hypothetical protein  46.31 
 
 
256 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2451  hypothetical protein  46.94 
 
 
269 aa  203  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2521  hypothetical protein  46.94 
 
 
256 aa  203  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000101647  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2613  hypothetical protein  46.94 
 
 
269 aa  203  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000236157 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  47.33 
 
 
270 aa  202  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  45.49 
 
 
256 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  45.34 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3018  hypothetical protein  46.37 
 
 
252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  45.14 
 
 
259 aa  198  6e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  41.6 
 
 
257 aa  198  7.999999999999999e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2735  hypothetical protein  45.27 
 
 
269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2611  hypothetical protein  45.27 
 
 
269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2571  hypothetical protein  45.27 
 
 
269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2624  hypothetical protein  45.27 
 
 
269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2522  hypothetical protein  45.27 
 
 
269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2502  hypothetical protein  50.44 
 
 
252 aa  196  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656569  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004476  membrane protein  43.32 
 
 
259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.61152  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  45.08 
 
 
266 aa  195  6e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  45.9 
 
 
268 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  45.9 
 
 
268 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  45.9 
 
 
268 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  44.44 
 
 
266 aa  193  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  41.7 
 
 
259 aa  191  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2491  protein of unknown function DUF81  44.67 
 
 
249 aa  190  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.33045 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02252  conserved inner membrane protein  47.33 
 
 
269 aa  189  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1329  protein of unknown function DUF81  47.33 
 
 
269 aa  189  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95844  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1325  hypothetical protein  47.33 
 
 
269 aa  189  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2484  hypothetical protein  47.33 
 
 
269 aa  189  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2705  hypothetical protein  47.33 
 
 
269 aa  189  4e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2479  hypothetical protein  47.33 
 
 
269 aa  189  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3468  hypothetical protein  47.33 
 
 
269 aa  189  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2507  hypothetical protein  47.5 
 
 
253 aa  189  4e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02212  hypothetical protein  47.33 
 
 
269 aa  189  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.53091  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2622  hypothetical protein  47.33 
 
 
269 aa  189  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1266  hypothetical protein  44.09 
 
 
260 aa  189  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.612634  hitchhiker  0.000168784 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  42.51 
 
 
267 aa  186  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1433  permease  43.14 
 
 
268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3065  hypothetical protein  41.41 
 
 
259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  hitchhiker  0.00363187 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  45.9 
 
 
257 aa  182  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3956  hypothetical protein  43.7 
 
 
256 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  39.6 
 
 
253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  37.35 
 
 
257 aa  169  3e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00918  hypothetical protein  43.87 
 
 
259 aa  169  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2122  hypothetical protein  40.41 
 
 
251 aa  169  6e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1837  hypothetical protein  40 
 
 
251 aa  168  7e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2464  hypothetical protein  43.29 
 
 
254 aa  168  9e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000359609 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  38.15 
 
 
253 aa  167  1e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0368  hypothetical protein  39.27 
 
 
254 aa  166  4e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.003766  hitchhiker  0.000586302 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2248  hypothetical protein  42.68 
 
 
256 aa  165  9e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.71549  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2809  hypothetical protein  41.25 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1455  hypothetical protein  42.62 
 
 
266 aa  163  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2504  protein of unknown function DUF81  39.52 
 
 
254 aa  159  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  40.08 
 
 
253 aa  158  7e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0722  inner membrane protein YfcA  37.28 
 
 
254 aa  158  7e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1715  protein of unknown function DUF81  39.92 
 
 
254 aa  158  8e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000213393 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2455  inner membrane protein YfcA  37.67 
 
 
223 aa  157  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2881  inner membrane protein YfcA  37.22 
 
 
223 aa  156  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.752456 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1028  protein of unknown function DUF81  46.4 
 
 
254 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2446  hypothetical protein  40.51 
 
 
247 aa  149  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.335155  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  37.45 
 
 
251 aa  148  9e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0966  hypothetical protein  46.18 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0162432  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1025  protein of unknown function DUF81  46.4 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.665306  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  33.86 
 
 
255 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  34.13 
 
 
255 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0226  hypothetical protein  39.52 
 
 
252 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.94047  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1961  hypothetical protein  43.13 
 
 
261 aa  142  8e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5469  hypothetical protein  44.13 
 
 
264 aa  138  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51215  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0177  hypothetical protein  36.86 
 
 
252 aa  138  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0854  hypothetical protein  33.6 
 
 
255 aa  136  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0046251  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1113  hypothetical protein  33.6 
 
 
255 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.172741  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1128  membrane protein  37.6 
 
 
256 aa  135  9e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.24374  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0886  hypothetical protein  33.2 
 
 
255 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0939  hypothetical protein  33.2 
 
 
255 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2179  hypothetical protein  35.25 
 
 
259 aa  133  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403668  normal  0.519759 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1372  protein of unknown function DUF81  36.84 
 
 
253 aa  132  5e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000140624  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1817  hypothetical protein  30.95 
 
 
254 aa  132  5e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1462  hypothetical protein  30.95 
 
 
254 aa  132  6e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2880  hypothetical protein  34.94 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460718  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4327  hypothetical protein  33.2 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.876554 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1642  hypothetical protein  30.56 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1447  hypothetical protein  38.11 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115265  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1026  hypothetical protein  33.2 
 
 
255 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4288400000000001e-24 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3206  protein of unknown function DUF81  36.11 
 
 
252 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1043  hypothetical protein  33.2 
 
 
255 aa  130  3e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00403886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>