More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3043 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3043  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 
357 aa  697    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426157  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3537  thiamine-monophosphate kinase  47.22 
 
 
324 aa  225  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.719113  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2915  thiamine-monophosphate kinase  44.14 
 
 
338 aa  218  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0468053  hitchhiker  0.00439314 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0208  thiamine-monophosphate kinase  44.9 
 
 
331 aa  217  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.752934  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1820  thiamine-monophosphate kinase  43.47 
 
 
323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1530  thiamine-monophosphate kinase  44.83 
 
 
320 aa  213  5.999999999999999e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.160353  normal  0.929464 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2677  thiamine-monophosphate kinase  46.41 
 
 
323 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00408376  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1721  thiamine-monophosphate kinase  44.24 
 
 
323 aa  207  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488772  normal  0.0257709 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2116  thiamine-monophosphate kinase  43.3 
 
 
312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3484  thiamine-monophosphate kinase  43.14 
 
 
325 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  36.67 
 
 
338 aa  191  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3160  thiamine-monophosphate kinase  42.95 
 
 
325 aa  191  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.172815  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6802  thiamine-monophosphate kinase  44.63 
 
 
328 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2640  thiamine-monophosphate kinase  44.44 
 
 
323 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23047  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1820  thiamine-monophosphate kinase  43.21 
 
 
327 aa  189  8e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3011  thiamine-monophosphate kinase  44.05 
 
 
323 aa  188  9e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  34.34 
 
 
315 aa  185  8e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7541  thiamine-monophosphate kinase  43.77 
 
 
330 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301752  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4643  thiamin-monophosphate kinase  42.01 
 
 
330 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567008  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4282  thiamine-monophosphate kinase  44.59 
 
 
336 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0547325 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3356  thiamine-monophosphate kinase  43.32 
 
 
325 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0658  thiamine-monophosphate kinase  42.68 
 
 
323 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0295042 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2665  thiamine-monophosphate kinase  42.2 
 
 
338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3852  thiamine monophosphate kinase  38.23 
 
 
317 aa  172  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0253  thiamine-monophosphate kinase  39.7 
 
 
313 aa  171  2e-41  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0505  thiamine-monophosphate kinase  31.31 
 
 
314 aa  166  4e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0139572  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3978  thiamine-monophosphate kinase  43.73 
 
 
331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  decreased coverage  0.00138187 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4457  thiamine monophosphate kinase  38.26 
 
 
321 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  35.95 
 
 
339 aa  162  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0565  thiamine monophosphate kinase  36.75 
 
 
322 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2773  thiamine-monophosphate kinase  47.21 
 
 
310 aa  160  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  35.28 
 
 
320 aa  160  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0519  thiamine monophosphate kinase  36.97 
 
 
322 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0554  thiamine monophosphate kinase  36.67 
 
 
322 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0380  thiamine-monophosphate kinase  39.39 
 
 
321 aa  159  6e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.450658  normal  0.175688 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  35.26 
 
 
318 aa  158  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1395  thiamine-monophosphate kinase  37.5 
 
 
322 aa  157  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  35.28 
 
 
323 aa  156  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  42.01 
 
 
315 aa  156  6e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5014  thiamine monophosphate kinase  35.98 
 
 
321 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  33.84 
 
 
319 aa  155  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  36.2 
 
 
325 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  34.25 
 
 
319 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2768  thiamine monophosphate kinase  39.26 
 
 
332 aa  153  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.086077  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0804  thiamine-monophosphate kinase  36.78 
 
 
319 aa  152  7e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.914964  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  34.26 
 
 
318 aa  152  8e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4471  thiamine-monophosphate kinase  37.5 
 
 
332 aa  152  8.999999999999999e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1597  thiamine-phosphate kinase  38.7 
 
 
319 aa  152  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  34.58 
 
 
321 aa  151  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  34.66 
 
 
323 aa  151  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0711  thiamine-monophosphate kinase  38.69 
 
 
321 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2024  thiamine-monophosphate kinase  39.94 
 
 
317 aa  150  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.908086  normal  0.0114447 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  39.86 
 
 
325 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0695  thiamine monophosphate kinase  37.2 
 
 
321 aa  149  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3665  thiamine-monophosphate kinase  38.46 
 
 
332 aa  149  7e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1050  thiamine monophosphate kinase  36.28 
 
 
322 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3014  thiamine monophosphate kinase  40.53 
 
 
361 aa  149  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.783652 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0572  thiamine monophosphate kinase  36.06 
 
 
319 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  34.36 
 
 
323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  34.42 
 
 
318 aa  148  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  34.42 
 
 
318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0210  thiamine-phosphate kinase  39.42 
 
 
323 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.631674 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  34.36 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  33.03 
 
 
331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  34.36 
 
 
323 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  33.84 
 
 
333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  34.36 
 
 
323 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2604  thiamine monophosphate kinase  40.2 
 
 
361 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0796602  normal  0.511018 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2241  thiamine-monophosphate kinase  32.04 
 
 
335 aa  147  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  34.97 
 
 
328 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  34.88 
 
 
329 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  35.08 
 
 
336 aa  146  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  31.89 
 
 
320 aa  146  6e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  36.77 
 
 
320 aa  146  6e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  31.89 
 
 
320 aa  146  6e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0345  thiamine-monophosphate kinase  39.86 
 
 
324 aa  146  6e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.277053  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  34.57 
 
 
329 aa  145  9e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  33.13 
 
 
318 aa  145  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  35.69 
 
 
323 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  37.46 
 
 
331 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  36.58 
 
 
327 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  37.16 
 
 
325 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  33.23 
 
 
318 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  33.23 
 
 
318 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0356  thiamine-monophosphate kinase  39.36 
 
 
324 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1653  thiamine-monophosphate kinase  35.09 
 
 
325 aa  144  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0108412  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  33.23 
 
 
318 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  34.57 
 
 
329 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0487  thiamine-monophosphate kinase  36.05 
 
 
319 aa  143  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06770  thiamine monophosphate kinase  40.26 
 
 
321 aa  142  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11460  thiamine monophosphate kinase  35.76 
 
 
322 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0770171  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  35.17 
 
 
325 aa  142  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  35.17 
 
 
325 aa  142  7e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  35.17 
 
 
325 aa  142  7e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  35.17 
 
 
325 aa  142  7e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  35.17 
 
 
325 aa  142  7e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  35.17 
 
 
325 aa  142  8e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0714  thiamine-monophosphate kinase  38.8 
 
 
319 aa  142  8e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  35.17 
 
 
325 aa  142  8e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  35.17 
 
 
325 aa  142  9e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>