More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0658 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0658  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 		 323 aa  621  1e-177  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0295042 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0208  thiamine-monophosphate kinase  60.49 
 
 		 331 aa  354  1e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.752934  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6802  thiamine-monophosphate kinase  59.13 
 
 		 328 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7541  thiamine-monophosphate kinase  57.89 
 
 		 330 aa  310  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301752  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3484  thiamine-monophosphate kinase  55.11 
 
 		 325 aa  295  8e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3978  thiamine-monophosphate kinase  56.66 
 
 		 331 aa  291  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  decreased coverage  0.00138187 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3160  thiamine-monophosphate kinase  53.87 
 
 		 325 aa  287  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.172815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3356  thiamine-monophosphate kinase  54.49 
 
 		 325 aa  286  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1721  thiamine-monophosphate kinase  50 
 
 		 323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488772  normal  0.0257709 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2677  thiamine-monophosphate kinase  51.23 
 
 		 323 aa  269  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00408376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2665  thiamine-monophosphate kinase  52.47 
 
 		 338 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1820  thiamine-monophosphate kinase  48.93 
 
 		 323 aa  264  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3011  thiamine-monophosphate kinase  50.62 
 
 		 323 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2640  thiamine-monophosphate kinase  50.31 
 
 		 323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23047  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4643  thiamin-monophosphate kinase  45.99 
 
 		 330 aa  232  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567008  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4282  thiamine-monophosphate kinase  48 
 
 		 336 aa  228  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0547325 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2915  thiamine-monophosphate kinase  46.1 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0468053  hitchhiker  0.00439314 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3537  thiamine-monophosphate kinase  44.89 
 
 		 324 aa  223  4.9999999999999996e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.719113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2116  thiamine-monophosphate kinase  45.65 
 
 		 312 aa  210  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1820  thiamine-monophosphate kinase  44.62 
 
 		 327 aa  204  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  34.97 
 
 		 315 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  44.51 
 
 		 331 aa  196  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0505  thiamine-monophosphate kinase  33.64 
 
 		 314 aa  194  1e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0139572  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  43.2 
 
 		 325 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2768  thiamine monophosphate kinase  45.43 
 
 		 332 aa  187  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.086077  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2604  thiamine monophosphate kinase  45.57 
 
 		 361 aa  186  5e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0796602  normal  0.511018 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  41.54 
 
 		 323 aa  186  6e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3014  thiamine monophosphate kinase  45.57 
 
 		 361 aa  186  6e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.783652 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0556  thiamine monophosphate kinase  45.54 
 
 		 334 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3400  thiamine monophosphate kinase  44.86 
 
 		 332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0357932 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  35.95 
 
 		 338 aa  182  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  36.5 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2478  thiamine monophosphate kinase  43.58 
 
 		 333 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152794  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3440  thiamine monophosphate kinase  43.58 
 
 		 333 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.721251  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3475  thiamine monophosphate kinase  43.58 
 
 		 333 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1257  thiamine monophosphate kinase  43.58 
 
 		 333 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0397  thiamine monophosphate kinase  43.58 
 
 		 333 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100912  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3477  thiamine monophosphate kinase  43.58 
 
 		 333 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3308  thiamine monophosphate kinase  43.58 
 
 		 333 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1188  thiamine monophosphate kinase  43.28 
 
 		 333 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  36.39 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3665  thiamine-monophosphate kinase  43.75 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4471  thiamine-monophosphate kinase  42.69 
 
 		 332 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  38.26 
 
 		 336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  40.32 
 
 		 339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2848  thiamine monophosphate kinase  41.52 
 
 		 326 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  37.71 
 
 		 321 aa  170  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  35.81 
 
 		 318 aa  170  4e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3043  thiamine-monophosphate kinase  42.68 
 
 		 357 aa  169  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  39.58 
 
 		 326 aa  169  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  35.81 
 
 		 319 aa  169  6e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  35.58 
 
 		 323 aa  169  8e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  35.58 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0555  thiamine monophosphate kinase  42.5 
 
 		 344 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0380  thiamine-monophosphate kinase  43.29 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.450658  normal  0.175688 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  35.58 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  40.84 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  36.98 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0531  thiamine monophosphate kinase  42.19 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  35.28 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  38.7 
 
 		 327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  35.58 
 
 		 323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  35.28 
 
 		 318 aa  166  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  34.65 
 
 		 319 aa  166  5e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  35.28 
 
 		 318 aa  166  5e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  35.28 
 
 		 323 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3712  thiamine monophosphate kinase  41.07 
 
 		 332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.0722604 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0487  thiamine-monophosphate kinase  40.74 
 
 		 319 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  38.51 
 
 		 329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  40.8 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  37.39 
 
 		 327 aa  163  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  35.78 
 
 		 319 aa  164  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0598  thiamine monophosphate kinase  41.32 
 
 		 332 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  0.343428 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  37.54 
 
 		 329 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  37.54 
 
 		 329 aa  162  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0147  thiamine monophosphate kinase  41.02 
 
 		 332 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0630  thiamine monophosphate kinase  41.02 
 
 		 332 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  37.24 
 
 		 329 aa  162  9e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  37.31 
 
 		 325 aa  161  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  37.31 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  37.31 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  37 
 
 		 326 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  34.05 
 
 		 320 aa  160  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0928  thiamine-monophosphate kinase  41.67 
 
 		 340 aa  160  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1047  thiamine-monophosphate kinase  41.67 
 
 		 340 aa  160  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061049 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2755  thiamine monophosphate kinase  41.88 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.281901  normal  0.6872 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0345  thiamine-monophosphate kinase  41.39 
 
 		 324 aa  159  5e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.277053  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  36.83 
 
 		 328 aa  159  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0356  thiamine-monophosphate kinase  41.57 
 
 		 324 aa  159  6e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0210  thiamine-phosphate kinase  39.88 
 
 		 323 aa  159  7e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.631674 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0013  thiamine-monophosphate kinase  36.78 
 
 		 341 aa  159  8e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  37 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  37 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  37.43 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  36.39 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  37 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  37 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  36.39 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1653  thiamine-monophosphate kinase  38.41 
 
 		 325 aa  157  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0108412  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0583  thiamine-monophosphate kinase  42.39 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>